RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472230.5

GCFC2-208, Transcript of GC-rich sequence DNA-binding factor 2, human

TSL 2

Gene GCFC2, Length 2,265 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GCFC2-208	ENST00000472230	AMT	P48728	403 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GCFC2-208	ENST00000472230	FHL3	Q13643	280 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GCFC2-208	ENST00000472230	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GCFC2-208	ENST00000472230	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
GCFC2-208	ENST00000472230	AKAP9	Q99996	3911 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GCFC2-208	ENST00000472230	HSBP1	O75506	76 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GCFC2-208	ENST00000472230	IGKV3-20	P01619	116 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GCFC2-208	ENST00000472230	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
GCFC2-208	ENST00000472230	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GCFC2-208	ENST00000472230	AMN1	Q8IY45	258 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GCFC2-208	ENST00000472230	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GCFC2-208	ENST00000472230	KLLN	B2CW77	178 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GCFC2-208	ENST00000472230	TCF21	O43680	179 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GCFC2-208	ENST00000472230	FOSL1	P15407	271 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GCFC2-208	ENST00000472230	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
GCFC2-208	ENST00000472230	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GCFC2-208	ENST00000472230	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GCFC2-208	ENST00000472230	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
GCFC2-208	ENST00000472230	OR5AL1	P0C617	328 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GCFC2-208	ENST00000472230	ASIP	P42127	132 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GCFC2-208	ENST00000472230	KIR3DS1	Q14943	382 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GCFC2-208	ENST00000472230	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GCFC2-208	ENST00000472230	NIT1	Q86X76	327 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GCFC2-208	ENST00000472230	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
GCFC2-208	ENST00000472230	HIVEP2	P31629	2446 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GCFC2-208	ENST00000472230		H3BVH4	76 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GCFC2-208	ENST00000472230	TSPO	P30536	169 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GCFC2-208	ENST00000472230	CACNG7	P62955	275 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GCFC2-208	ENST00000472230	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GCFC2-208	ENST00000472230	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GCFC2-208	ENST00000472230	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GCFC2-208	ENST00000472230	DEFB131A	P59861	70 aa		13.66	□□□□□ -0.22
GCFC2-208	ENST00000472230	C7orf71	A4D174	169 aa		13.66	□□□□□ -0.22
GCFC2-208	ENST00000472230	SNAI2	O43623	268 aa		13.66	□□□□□ -0.22
GCFC2-208	ENST00000472230	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		13.66	□□□□□ -0.22
GCFC2-208	ENST00000472230	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		13.66	□□□□□ -0.22
GCFC2-208	ENST00000472230	PROK1	P58294	105 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GCFC2-208	ENST00000472230	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
GCFC2-208	ENST00000472230	ORMDL3	Q8N138	153 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GCFC2-208	ENST00000472230	OR4C46	A6NHA9	309 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GCFC2-208	ENST00000472230		D6R8Y8	96 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GCFC2-208	ENST00000472230	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
GCFC2-208	ENST00000472230	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GCFC2-208	ENST00000472230	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GCFC2-208	ENST00000472230	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GCFC2-208	ENST00000472230	CDKN1B	P46527	198 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GCFC2-208	ENST00000472230	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
GCFC2-208	ENST00000472230	PRELID3A	Q96N28	172 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GCFC2-208	ENST00000472230	SCGB1D1	O95968	90 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GCFC2-208	ENST00000472230	CKS2	P33552	79 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GCFC2-208	ENST00000472230	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
GCFC2-208	ENST00000472230	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GCFC2-208	ENST00000472230		M0R2Z0	102 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GCFC2-208	ENST00000472230	LINC00614	P0C842	121 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GCFC2-208	ENST00000472230	MED14OS	P0DP75	135 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GCFC2-208	ENST00000472230	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GCFC2-208	ENST00000472230	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GCFC2-208	ENST00000472230		Q6ZWC4	215 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GCFC2-208	ENST00000472230	KNCN	A6PVL3	124 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GCFC2-208	ENST00000472230	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GCFC2-208	ENST00000472230	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GCFC2-208	ENST00000472230	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GCFC2-208	ENST00000472230		U3KQK5	164 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GCFC2-208	ENST00000472230	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GCFC2-208	ENST00000472230	GNRH2	O43555	120 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GCFC2-208	ENST00000472230	RAB4A	P20338	218 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GCFC2-208	ENST00000472230	S100A12	P80511	92 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GCFC2-208	ENST00000472230	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GCFC2-208	ENST00000472230	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GCFC2-208	ENST00000472230	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GCFC2-208	ENST00000472230	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GCFC2-208	ENST00000472230	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
GCFC2-208	ENST00000472230	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GCFC2-208	ENST00000472230	HLA-DRB4	P13762	266 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GCFC2-208	ENST00000472230	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GCFC2-208	ENST00000472230	PPBP	P02775	128 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GCFC2-208	ENST00000472230	KRTDAP	P60985	99 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GCFC2-208	ENST00000472230	FA2H	Q7L5A8	372 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GCFC2-208	ENST00000472230	RNF185	Q96GF1	192 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GCFC2-208	ENST00000472230		M0R381	172 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GCFC2-208	ENST00000472230	SMKR1	H3BMG3	65 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GCFC2-208	ENST00000472230	CD7	P09564	240 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GCFC2-208	ENST00000472230	EVI2A	P22794	236 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GCFC2-208	ENST00000472230	AMTN	Q6UX39	209 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GCFC2-208	ENST00000472230	MTOR	P42345	2549 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GCFC2-208	ENST00000472230	NCR2	O95944	276 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GCFC2-208	ENST00000472230	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GCFC2-208	ENST00000472230		H3BMM0	161 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GCFC2-208	ENST00000472230	SAP30	O75446	220 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GCFC2-208	ENST00000472230	CRLF1	O75462	422 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GCFC2-208	ENST00000472230	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
GCFC2-208	ENST00000472230	FXYD7	P58549	80 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GCFC2-208	ENST00000472230	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GCFC2-208	ENST00000472230	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GCFC2-208	ENST00000472230	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GCFC2-208	ENST00000472230	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GCFC2-208	ENST00000472230	ZNF124	Q15973	351 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GCFC2-208	ENST00000472230	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GCFC2-208	ENST00000472230	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
GCFC2-208	ENST00000472230	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		13.56	□□□□□ -0.24

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