RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431908.5

DDX39B-210, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 5

Gene DDX39B, Length 914 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-210ENST00000431908 PAGE4O60829 102 aa8.29□□□□□ -1.08
DDX39B-210ENST00000431908 CXCL1P09341 107 aa8.29□□□□□ -1.08
DDX39B-210ENST00000431908 LEPP41159 167 aa8.29□□□□□ -1.08
DDX39B-210ENST00000431908 RPL23P62829 140 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
DDX39B-210ENST00000431908 ZNF674Q2M3X9 581 aa8.29□□□□□ -1.08
DDX39B-210ENST00000431908 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa8.29□□□□□ -1.08
DDX39B-210ENST00000431908 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
DDX39B-210ENST00000431908 PYGO2Q9BRQ0 406 aa8.29□□□□□ -1.08
DDX39B-210ENST00000431908 PARLQ9H300 379 aa8.29□□□□□ -1.08
DDX39B-210ENST00000431908 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa8.29□□□□□ -1.08
DDX39B-210ENST00000431908 DNAH17Q9UFH2 4485 aa8.29□□□□□ -1.08
DDX39B-210ENST00000431908 FAT2Q9NYQ8 4349 aa8.28□□□□□ -1.08
DDX39B-210ENST00000431908 A0A0J9YY99 117 aa8.28□□□□□ -1.08
DDX39B-210ENST00000431908 GAGE12BA1L429 117 aa8.28□□□□□ -1.08
DDX39B-210ENST00000431908 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
DDX39B-210ENST00000431908 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP8.28□□□□□ -1.08
DDX39B-210ENST00000431908 GAGE7O76087 117 aa8.28□□□□□ -1.08
DDX39B-210ENST00000431908 GAGE12FP0CL80 117 aa8.28□□□□□ -1.08
DDX39B-210ENST00000431908 GAGE12GP0CL81 117 aa8.28□□□□□ -1.08
DDX39B-210ENST00000431908 GAGE12IP0CL82 117 aa8.28□□□□□ -1.08
DDX39B-210ENST00000431908 S100A12P80511 92 aa8.28□□□□□ -1.08
DDX39B-210ENST00000431908 FABP9Q0Z7S8 132 aa8.28□□□□□ -1.08
DDX39B-210ENST00000431908 ADIRFQ15847 76 aa8.28□□□□□ -1.08
DDX39B-210ENST00000431908 MIC13Q5XKP0 118 aa8.28□□□□□ -1.08
DDX39B-210ENST00000431908 PATE2Q6UY27 113 aa8.28□□□□□ -1.08
DDX39B-210ENST00000431908 OR1L4Q8NGR5 311 aa8.28□□□□□ -1.08
DDX39B-210ENST00000431908 C12orf57Q99622 126 aa8.28□□□□□ -1.08
DDX39B-210ENST00000431908 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa8.28□□□□□ -1.08
DDX39B-210ENST00000431908 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa8.27□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 H3BNG1 76 aa8.27□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 J3KRW8 73 aa8.27□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 S100A9P06702 114 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 PFN1P07737 140 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 HOXA5P20719 270 aa8.27□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 S100PP25815 95 aa8.27□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 IQCF2Q8IXL9 164 aa8.27□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 BTF3L4Q96K17 158 aa8.27□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 PFDN5Q99471 154 aa8.27□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 PKHD1P08F94 4074 aa8.27□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 DNAH2Q9P225 4427 aa8.27□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 PKD1P98161 4303 aa8.27□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 TRGV2A0A075B6R0 118 aa8.26□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa8.26□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 A0A1W2PPQ1 181 aa8.26□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 PPP1R2P9O14990 202 aa8.26□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 BTF3P20290 206 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 GCHFRP30047 84 aa8.26□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 GCSAMLQ5JQS6 135 aa8.26□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 GFI1BQ5VTD9 330 aa8.26□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 SPATA12Q7Z6I5 190 aa8.26□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 IMMP2LQ96T52 175 aa8.26□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa8.26□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 PCLOQ9Y6V0 5065 aa8.26□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 H3BTX0 84 aa8.25□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 EREGO14944 169 aa8.25□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 ARL14EPLP0DKL9 152 aa8.25□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 C11orf52Q96A22 123 aa8.25□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 ODF3Q96PU9 254 aa8.25□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 Q9H3A6 140 aa8.25□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 LY96Q9Y6Y9 160 aa8.25□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 TRGC2P03986 189 aa8.24□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 ESRGQ1W209 222 aa8.24□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 CST9LP1Q5W188 147 aa8.24□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 LINC00612Q8N6U2 182 aa8.24□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 TMEM37Q8WXS4 190 aa8.24□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 UPK3BQ9BT76 320 aa8.24□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 TMEM167BQ9NRX6 74 aa8.24□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 PRAC2D3DTV9 90 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 NPIPB6E9PJ23 425 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 SLC17A3O00476 420 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 PHOX2AO14813 284 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 HIST1H2BKO60814 126 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 ZNF253O75346 499 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 TYMSP04818 313 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 HIST1H2BJP06899 126 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 CT45A10P0DMU9 189 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 IGLC2P0DOY2 106 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 HIST1H2BOP23527 126 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 HIST1H2BBP33778 126 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 NDUFA6P56556 154 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 HIST1H2BDP58876 126 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 UBE2G2P60604 165 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 HIST1H2BCP62807 126 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 KIR3DS1Q14943 382 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 HIST2H2BEQ16778 126 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 KCNIP4Q6PIL6 250 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 LINC01551Q86U37 167 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 HIST1H2BHQ93079 126 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 LINC00477Q96M19 166 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 HIST1H2BNQ99877 126 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 HIST1H2BMQ99879 126 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-210ENST00000431908 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa8.23□□□□□ -1.09
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