RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293861.7

SNRNP25-201, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U11/U12 subunit 25, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene SNRNP25, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25-201ENST00000293861 ODF3Q96PU9 254 aa16.12■□□□□ 0.17
SNRNP25-201ENST00000293861 MSRB1Q9NZV6 116 aa16.12■□□□□ 0.17
SNRNP25-201ENST00000293861 PEMTQ9UBM1 199 aa16.12■□□□□ 0.17
SNRNP25-201ENST00000293861 KLLNB2CW77 178 aa16.11■□□□□ 0.17
SNRNP25-201ENST00000293861 D6R8Y8 96 aa16.11■□□□□ 0.17
SNRNP25-201ENST00000293861 KRTDAPP60985 99 aa16.11■□□□□ 0.17
SNRNP25-201ENST00000293861 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa16.11■□□□□ 0.17
SNRNP25-201ENST00000293861 TEX43Q6ZNM6 134 aa16.11■□□□□ 0.17
SNRNP25-201ENST00000293861 C3orf79P0CE67 100 aa16.11■□□□□ 0.17
SNRNP25-201ENST00000293861 RAB4AP20338 218 aa16.11■□□□□ 0.17
SNRNP25-201ENST00000293861 CACNG7P62955 275 aa16.11■□□□□ 0.17
SNRNP25-201ENST00000293861 Q8N976 141 aa16.11■□□□□ 0.17
SNRNP25-201ENST00000293861 PRELID3AQ96N28 172 aa16.1■□□□□ 0.17
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF688P0C7X2 276 aa16.09■□□□□ 0.17
SNRNP25-201ENST00000293861 RNF185Q96GF1 192 aa16.09■□□□□ 0.17
SNRNP25-201ENST00000293861 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa16.09■□□□□ 0.17
SNRNP25-201ENST00000293861 J3KRW8 73 aa16.09■□□□□ 0.17
SNRNP25-201ENST00000293861 PPBPP02775 128 aa16.09■□□□□ 0.17
SNRNP25-201ENST00000293861 MED14OSP0DP75 135 aa16.09■□□□□ 0.17
SNRNP25-201ENST00000293861 TFPI2P48307 235 aa16.09■□□□□ 0.17
SNRNP25-201ENST00000293861 PSMG4Q5JS54 123 aa16.09■□□□□ 0.17
SNRNP25-201ENST00000293861 OR9G4Q8NGQ1 327 aa16.09■□□□□ 0.17
SNRNP25-201ENST00000293861 SMR3AQ99954 134 aa16.09■□□□□ 0.17
SNRNP25-201ENST00000293861 A0A0J9YX75 114 aa16.08■□□□□ 0.16
SNRNP25-201ENST00000293861 LY6G6DO95868 133 aa16.08■□□□□ 0.16
SNRNP25-201ENST00000293861 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
SNRNP25-201ENST00000293861 OR10AG1Q8NH19 301 aa16.08■□□□□ 0.16
SNRNP25-201ENST00000293861 LINC01006Q8NI28 216 aa16.08■□□□□ 0.16
SNRNP25-201ENST00000293861 PRO1933Q9H354 126 aa16.08■□□□□ 0.16
SNRNP25-201ENST00000293861 TRAV2A0A0B4J234 112 aa16.07■□□□□ 0.16
SNRNP25-201ENST00000293861 CSN3P07498 182 aa16.07■□□□□ 0.16
SNRNP25-201ENST00000293861 CKS2P33552 79 aa16.07■□□□□ 0.16
SNRNP25-201ENST00000293861 JMJD8Q96S16 334 aa16.07■□□□□ 0.16
SNRNP25-201ENST00000293861 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa16.06■□□□□ 0.16
SNRNP25-201ENST00000293861 EBLN2Q6P2I7 272 aa16.06■□□□□ 0.16
SNRNP25-201ENST00000293861 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa16.06■□□□□ 0.16
SNRNP25-201ENST00000293861 AP5S1Q9NUS5 200 aa16.06■□□□□ 0.16
SNRNP25-201ENST00000293861 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa16.06■□□□□ 0.16
SNRNP25-201ENST00000293861 H3BVH4 76 aa16.06■□□□□ 0.16
SNRNP25-201ENST00000293861 LEPP41159 167 aa16.06■□□□□ 0.16
SNRNP25-201ENST00000293861 KIR3DS1Q14943 382 aa16.06■□□□□ 0.16
SNRNP25-201ENST00000293861 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa16.05■□□□□ 0.16
SNRNP25-201ENST00000293861 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa16.05■□□□□ 0.16
SNRNP25-201ENST00000293861 NDUFA7O95182 113 aa16.05■□□□□ 0.16
SNRNP25-201ENST00000293861 ASIPP42127 132 aa16.05■□□□□ 0.16
SNRNP25-201ENST00000293861 FA2HQ7L5A8 372 aa16.05■□□□□ 0.16
SNRNP25-201ENST00000293861 KIR2DL5AQ8N109 375 aa16.05■□□□□ 0.16
SNRNP25-201ENST00000293861 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
SNRNP25-201ENST00000293861 DUX3Q96PT4 197 aa16.05■□□□□ 0.16
SNRNP25-201ENST00000293861 BTF3P20290 206 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SNRNP25-201ENST00000293861 DDTP30046 118 aa16.04■□□□□ 0.16
SNRNP25-201ENST00000293861 SPANXN1Q5VSR9 72 aa16.04■□□□□ 0.16
SNRNP25-201ENST00000293861 SMIM15Q7Z3B0 74 aa16.04■□□□□ 0.16
SNRNP25-201ENST00000293861 SCRT2Q9NQ03 307 aa16.04■□□□□ 0.16
SNRNP25-201ENST00000293861 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa16.04■□□□□ 0.16
SNRNP25-201ENST00000293861 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SNRNP25-201ENST00000293861 CD28P10747 220 aa16.04■□□□□ 0.16
SNRNP25-201ENST00000293861 FHL3Q13643 280 aa16.04■□□□□ 0.16
SNRNP25-201ENST00000293861 PMCHL1Q16048 86 aa16.04■□□□□ 0.16
SNRNP25-201ENST00000293861 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SNRNP25-201ENST00000293861 LEPROTL1O95214 131 aa16.03■□□□□ 0.16
SNRNP25-201ENST00000293861 NPYP01303 97 aa16.03■□□□□ 0.16
SNRNP25-201ENST00000293861 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SNRNP25-201ENST00000293861 FOXI2Q6ZQN5 318 aa16.03■□□□□ 0.16
SNRNP25-201ENST00000293861 RAX2Q96IS3 184 aa16.03■□□□□ 0.16
SNRNP25-201ENST00000293861 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SNRNP25-201ENST00000293861 TCF21O43680 179 aa16.02■□□□□ 0.16
SNRNP25-201ENST00000293861 HIVEP2P31629 2446 aa16.02■□□□□ 0.15
SNRNP25-201ENST00000293861 C7orf71A4D174 169 aa16.02■□□□□ 0.15
SNRNP25-201ENST00000293861 CRXO43186 299 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
SNRNP25-201ENST00000293861 EVI2AP22794 236 aa16.02■□□□□ 0.15
SNRNP25-201ENST00000293861 S100A4P26447 101 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
SNRNP25-201ENST00000293861 TMEM70Q9BUB7 260 aa16.02■□□□□ 0.15
SNRNP25-201ENST00000293861 SMKR1H3BMG3 65 aa16.01■□□□□ 0.15
SNRNP25-201ENST00000293861 NCR2O95944 276 aa16■□□□□ 0.15
SNRNP25-201ENST00000293861 TDRG1Q3Y452 100 aa16■□□□□ 0.15
SNRNP25-201ENST00000293861 C20orf144Q9BQM9 153 aa16■□□□□ 0.15
SNRNP25-201ENST00000293861 VAMP8Q9BV40 100 aa16■□□□□ 0.15
SNRNP25-201ENST00000293861 MTORP42345 2549 aa16■□□□□ 0.15
SNRNP25-201ENST00000293861 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SNRNP25-201ENST00000293861 TSPOP30536 169 aa16■□□□□ 0.15
SNRNP25-201ENST00000293861 FAM159AQ6UWV7 190 aa16■□□□□ 0.15
SNRNP25-201ENST00000293861 DYNLRB2Q8TF09 96 aa16■□□□□ 0.15
SNRNP25-201ENST00000293861 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
SNRNP25-201ENST00000293861 HSPB8Q9UJY1 196 aa16■□□□□ 0.15
SNRNP25-201ENST00000293861 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa15.99■□□□□ 0.15
SNRNP25-201ENST00000293861 CCL24O00175 119 aa15.99■□□□□ 0.15
SNRNP25-201ENST00000293861 GNRH2O43555 120 aa15.99■□□□□ 0.15
SNRNP25-201ENST00000293861 C11orf44Q8N8P7 122 aa15.99■□□□□ 0.15
SNRNP25-201ENST00000293861 MAP1LC3AQ9H492 121 aa15.99■□□□□ 0.15
SNRNP25-201ENST00000293861 AGRNO00468 2067 aa15.99■□□□□ 0.15
SNRNP25-201ENST00000293861 LINC01546A6NGU7 62 aa15.98■□□□□ 0.15
SNRNP25-201ENST00000293861 A8MTW9 85 aa15.98■□□□□ 0.15
SNRNP25-201ENST00000293861 CDKN1BP46527 198 aa15.98■□□□□ 0.15
SNRNP25-201ENST00000293861 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa15.98■□□□□ 0.15
SNRNP25-201ENST00000293861 TMEM61Q8N0U2 210 aa15.98■□□□□ 0.15
SNRNP25-201ENST00000293861 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa15.98■□□□□ 0.15
SNRNP25-201ENST00000293861 A0A1W2PRX2 142 aa15.98■□□□□ 0.15
SNRNP25-201ENST00000293861 NXPH4O95158 308 aa15.98■□□□□ 0.15
SNRNP25-201ENST00000293861 TNFRSF6BO95407 300 aa15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 129.4 ms