RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 ODF3Q96PU9 254 aa17.04■□□□□ 0.32
CAPNS1-212ENST00000591041 MT-ND6P03923 174 aa17.03■□□□□ 0.32
CAPNS1-212ENST00000591041 S100A8P05109 93 aa17.03■□□□□ 0.32
CAPNS1-212ENST00000591041 LEPP41159 167 aa17.03■□□□□ 0.32
CAPNS1-212ENST00000591041 FOXI2Q6ZQN5 318 aa17.03■□□□□ 0.32
CAPNS1-212ENST00000591041 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa17.03■□□□□ 0.32
CAPNS1-212ENST00000591041 Q8TAT8 98 aa17.03■□□□□ 0.32
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF688P0C7X2 276 aa17.02■□□□□ 0.32
CAPNS1-212ENST00000591041 C8orf49Q96NF6 230 aa17.02■□□□□ 0.32
CAPNS1-212ENST00000591041 SH2D1AO60880 128 aa17.01■□□□□ 0.31
CAPNS1-212ENST00000591041 EDN2P20800 178 aa17.01■□□□□ 0.31
CAPNS1-212ENST00000591041 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
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CAPNS1-212ENST00000591041 SAP30O75446 220 aa16.99■□□□□ 0.31
CAPNS1-212ENST00000591041 GPX1P07203 203 aa16.99■□□□□ 0.31
CAPNS1-212ENST00000591041 TCL1AP56279 114 aa16.99■□□□□ 0.31
CAPNS1-212ENST00000591041 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa16.99■□□□□ 0.31
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM61Q8N0U2 210 aa16.99■□□□□ 0.31
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CAPNS1-212ENST00000591041 S100A6P06703 90 aa16.98■□□□□ 0.31
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A0J9YX75 114 aa16.97■□□□□ 0.31
CAPNS1-212ENST00000591041 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa16.97■□□□□ 0.31
CAPNS1-212ENST00000591041 HIGD1CA8MV81 97 aa16.97■□□□□ 0.31
CAPNS1-212ENST00000591041 CRISP2P16562 243 aa16.97■□□□□ 0.31
CAPNS1-212ENST00000591041 RIGQ13278 110 aa16.97■□□□□ 0.31
CAPNS1-212ENST00000591041 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
CAPNS1-212ENST00000591041 GNB1LQ9BYB4 327 aa16.97■□□□□ 0.31
CAPNS1-212ENST00000591041 GPR61Q9BZJ8 451 aa16.97■□□□□ 0.31
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CAPNS1-212ENST00000591041 HLA-DQA1P01909 254 aa16.95■□□□□ 0.3
CAPNS1-212ENST00000591041 LINC01559Q495D7 138 aa16.95■□□□□ 0.3
CAPNS1-212ENST00000591041 NUP35Q8NFH5 326 aa16.95■□□□□ 0.3
CAPNS1-212ENST00000591041 CRIP1P50238 77 aa16.94■□□□□ 0.3
CAPNS1-212ENST00000591041 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
CAPNS1-212ENST00000591041 F2Z2F3 143 aa16.93■□□□□ 0.3
CAPNS1-212ENST00000591041 RAB4BP61018 213 aa16.93■□□□□ 0.3
CAPNS1-212ENST00000591041 HBBP68871 147 aa16.93■□□□□ 0.3
CAPNS1-212ENST00000591041 FRZBQ92765 325 aa16.93■□□□□ 0.3
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM19A4Q96LR4 140 aa16.93■□□□□ 0.3
CAPNS1-212ENST00000591041 CITED1Q99966 193 aa16.93■□□□□ 0.3
CAPNS1-212ENST00000591041 SELENOKQ9Y6D0 94 aa16.93■□□□□ 0.3
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A1B0GUT8 65 aa16.92■□□□□ 0.3
CAPNS1-212ENST00000591041 TRGC2P03986 189 aa16.92■□□□□ 0.3
CAPNS1-212ENST00000591041 DEFB131AP59861 70 aa16.92■□□□□ 0.3
CAPNS1-212ENST00000591041 APRG1Q8IVJ8 170 aa16.92■□□□□ 0.3
CAPNS1-212ENST00000591041 OR11H12B2RN74 326 aa16.91■□□□□ 0.3
CAPNS1-212ENST00000591041 F6UB75 175 aa16.91■□□□□ 0.3
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CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
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CAPNS1-212ENST00000591041 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
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CAPNS1-212ENST00000591041 PGLYRP4Q96LB8 373 aa16.91■□□□□ 0.3
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM110AQ9BQ89 295 aa16.91■□□□□ 0.3
CAPNS1-212ENST00000591041 SNURFLB1AK76 121 aa16.9■□□□□ 0.3
CAPNS1-212ENST00000591041 IGLV1-51P01701 117 aa16.9■□□□□ 0.3
CAPNS1-212ENST00000591041 HLA-DRB4P13762 266 aa16.9■□□□□ 0.3
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP10-3P60369 221 aa16.9■□□□□ 0.3
CAPNS1-212ENST00000591041 C9orf66Q5T8R8 295 aa16.9■□□□□ 0.3
CAPNS1-212ENST00000591041 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa16.9■□□□□ 0.3
CAPNS1-212ENST00000591041 LINC00482Q8N8I6 264 aa16.9■□□□□ 0.3
CAPNS1-212ENST00000591041 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa16.9■□□□□ 0.3
CAPNS1-212ENST00000591041 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa16.9■□□□□ 0.3
CAPNS1-212ENST00000591041 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
CAPNS1-212ENST00000591041 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
CAPNS1-212ENST00000591041 CDKN1BP46527 198 aa16.89■□□□□ 0.29
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
CAPNS1-212ENST00000591041 CLUHP3Q96NS8 147 aa16.89■□□□□ 0.29
CAPNS1-212ENST00000591041 TPPP3Q9BW30 176 aa16.89■□□□□ 0.29
CAPNS1-212ENST00000591041 MAP6D1Q9H9H5 199 aa16.89■□□□□ 0.29
CAPNS1-212ENST00000591041 KLLNB2CW77 178 aa16.88■□□□□ 0.29
CAPNS1-212ENST00000591041 SPINK4O60575 86 aa16.88■□□□□ 0.29
CAPNS1-212ENST00000591041 FABP9Q0Z7S8 132 aa16.88■□□□□ 0.29
CAPNS1-212ENST00000591041 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa16.88■□□□□ 0.29
CAPNS1-212ENST00000591041 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
CAPNS1-212ENST00000591041 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa16.87■□□□□ 0.29
CAPNS1-212ENST00000591041 C7orf71A4D174 169 aa16.87■□□□□ 0.29
CAPNS1-212ENST00000591041 CD33P20138 364 aa16.87■□□□□ 0.29
CAPNS1-212ENST00000591041 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM159AQ6UWV7 190 aa16.87■□□□□ 0.29
CAPNS1-212ENST00000591041 GTSF1Q8WW33 167 aa16.87■□□□□ 0.29
CAPNS1-212ENST00000591041 APCSP02743 223 aa16.86■□□□□ 0.29
CAPNS1-212ENST00000591041 SMIM15Q7Z3B0 74 aa16.86■□□□□ 0.29
CAPNS1-212ENST00000591041 STHQ8IWL8 128 aa16.86■□□□□ 0.29
CAPNS1-212ENST00000591041 ZFP82Q8N141 532 aa16.86■□□□□ 0.29
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
CAPNS1-212ENST00000591041 ANK2Q01484 3957 aa16.86■□□□□ 0.29
CAPNS1-212ENST00000591041 S100A4P26447 101 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
CAPNS1-212ENST00000591041 CTRLP40313 264 aa16.85■□□□□ 0.29
CAPNS1-212ENST00000591041 ASIPP42127 132 aa16.85■□□□□ 0.29
CAPNS1-212ENST00000591041 CACNG7P62955 275 aa16.85■□□□□ 0.29
CAPNS1-212ENST00000591041 NAGKQ9UJ70 344 aa16.85■□□□□ 0.29
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