RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580646.5

GGA3-209, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 829 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-209ENST00000580646 HIST1H2BLQ99880 126 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 RPH3ALQ9UNE2 315 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 A0A0J9YX75 114 aa7.26□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa7.26□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 TMEM238C9JI98 176 aa7.26□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 H3BMM0 161 aa7.26□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 SLC17A3O00476 420 aa7.26□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 HIST1H2BKO60814 126 aa7.26□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 NDUFB4O95168 129 aa7.26□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 HIST1H2BJP06899 126 aa7.26□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 HIST1H2BOP23527 126 aa7.26□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 HIST1H2BBP33778 126 aa7.26□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 FHITP49789 147 aa7.26□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 HIST1H2BDP58876 126 aa7.26□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 HIST1H2BCP62807 126 aa7.26□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 HIST2H2BEQ16778 126 aa7.26□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 ACTL10Q5JWF8 245 aa7.26□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
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GGA3-209ENST00000580646 CDPF1Q6NVV7 123 aa7.26□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 EBLN2Q6P2I7 272 aa7.26□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 DPPA3Q6W0C5 159 aa7.26□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 Q6ZWC4 215 aa7.26□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 HIST1H2BHQ93079 126 aa7.26□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 TMEM18Q96B42 140 aa7.26□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 C20orf173Q96LM9 149 aa7.26□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 HIST1H2BNQ99877 126 aa7.26□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 HIST1H2BMQ99879 126 aa7.26□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 VAX2Q9UIW0 290 aa7.26□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 TENM2Q9NT68 2774 aa7.26□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 PCLOQ9Y6V0 5065 aa7.26□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 CXorf1O96002 111 aa7.25□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 RPL19P84098 196 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 PET117Q6UWS5 81 aa7.25□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 RNF182Q8N6D2 247 aa7.25□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 LYPD6BQ8NI32 183 aa7.25□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 TMED6Q8WW62 240 aa7.25□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 CSTL1Q9H114 145 aa7.25□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 SLC35B3Q9H1N7 401 aa7.25□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 AAMDCQ9H7C9 122 aa7.25□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 TMEM167BQ9NRX6 74 aa7.25□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa7.25□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 CBY3A6NI87 242 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 KNCNA6PVL3 124 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 OR10J4P0C629 311 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 ARL14EPLP0DKL9 152 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 PTTG1IPP53801 180 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 ZNF726P1Q15940 193 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 GDF5OSQ5U4N7 250 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 IGFL4Q6B9Z1 124 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 ZNF738Q8NE65 137 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 BLNKQ8WV28 456 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 ISOC2Q96AB3 205 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 NUDT11Q96G61 164 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 C20orf144Q9BQM9 153 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 VPS25Q9BRG1 176 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 H3BTX0 84 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 HLA-DMBP28068 263 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 GCHFRP30047 84 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 OR8A1Q8NGG7 326 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 IL17DQ8TAD2 202 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 MBD3L1Q8WWY6 194 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 OVOL2Q9BRP0 275 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 OTORQ9NRC9 128 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 RYR1P21817 5038 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 F6UB75 175 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 AMBPP02760 352 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 AKR1C3P42330 323 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 CNN1P51911 297 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 UBE2G2P60604 165 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 OR5I1Q13606 314 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 ICAM4Q14773 271 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 SOHLH1Q5JUK2 328 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 AMTNQ6UX39 209 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 RNF183Q96D59 192 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 ODF3Q96PU9 254 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 Q9H3A6 140 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 TMEM242Q9NWH2 141 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 STARD9Q9P2P6 4700 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 CSMD3Q7Z407 3707 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 A0A1W2PRE2 83 aa7.21□□□□□ -1.26
GGA3-209ENST00000580646 RBAKDNA6NC62 111 aa7.21□□□□□ -1.26
GGA3-209ENST00000580646 NPIPB6E9PJ23 425 aa7.21□□□□□ -1.26
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