RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 RPL32P62910 135 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
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PTPRM-211ENST00000580170 SUMO4Q6EEV6 95 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRM-211ENST00000580170 WIPF3A6NGB9 483 aa16.96■□□□□ 0.31
PTPRM-211ENST00000580170 PFN2P35080 140 aa16.96■□□□□ 0.31
PTPRM-211ENST00000580170 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
PTPRM-211ENST00000580170 RLFQ13129 1914 aa16.96■□□□□ 0.31
PTPRM-211ENST00000580170 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa16.96■□□□□ 0.31
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PTPRM-211ENST00000580170 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa16.95■□□□□ 0.3
PTPRM-211ENST00000580170 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa16.95■□□□□ 0.3
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PTPRM-211ENST00000580170 DEFB125Q8N687 156 aa16.95■□□□□ 0.3
PTPRM-211ENST00000580170 C11orf52Q96A22 123 aa16.95■□□□□ 0.3
PTPRM-211ENST00000580170 K7EN84 100 aa16.95■□□□□ 0.3
PTPRM-211ENST00000580170 IGLV1-44P01699 117 aa16.95■□□□□ 0.3
PTPRM-211ENST00000580170 K7ENP7 123 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRM-211ENST00000580170 IGLV3-1P01715 115 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRM-211ENST00000580170 IGHG4P01861 327 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRM-211ENST00000580170 ZNRF2Q8NHG8 242 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRM-211ENST00000580170 IGLC1P0CG04 106 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRM-211ENST00000580170 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRM-211ENST00000580170 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRM-211ENST00000580170 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRM-211ENST00000580170 VOPP1Q96AW1 172 aa16.93■□□□□ 0.3
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PTPRM-211ENST00000580170 LTAP01374 205 aa16.92■□□□□ 0.3
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PTPRM-211ENST00000580170 K7EM74 188 aa16.92■□□□□ 0.3
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PTPRM-211ENST00000580170 IGFL3Q6UXB1 125 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRM-211ENST00000580170 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
PTPRM-211ENST00000580170 SMIM2Q9BVW6 85 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRM-211ENST00000580170 F5H768 121 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRM-211ENST00000580170 F8VRH5 84 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRM-211ENST00000580170 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRM-211ENST00000580170 NDUFA12Q9UI09 145 aa16.92■□□□□ 0.3
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PTPRM-211ENST00000580170 DKK2Q9UBU2 259 aa16.91■□□□□ 0.3
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PTPRM-211ENST00000580170 RS1O15537 224 aa16.91■□□□□ 0.3
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PTPRM-211ENST00000580170 PRR20DP86480 221 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRM-211ENST00000580170 PRR20BP86481 221 aa16.9■□□□□ 0.3
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PTPRM-211ENST00000580170 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
PTPRM-211ENST00000580170 C17orf77Q96MU5 243 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRM-211ENST00000580170 IL15RAQ13261 267 aa16.89■□□□□ 0.29
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PTPRM-211ENST00000580170 CRLF1O75462 422 aa16.88■□□□□ 0.29
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PTPRM-211ENST00000580170 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRM-211ENST00000580170 J3QQQ9 107 aa16.87■□□□□ 0.29
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PTPRM-211ENST00000580170 ZNF491Q8N8L2 437 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRM-211ENST00000580170 Q96MF0 132 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRM-211ENST00000580170 DSCR8Q96T75 97 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRM-211ENST00000580170 C20orf78Q9BR46 151 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRM-211ENST00000580170 LYPD6BQ8NI32 183 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRM-211ENST00000580170 FAM215AQ9Y5M1 114 aa16.85■□□□□ 0.29
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PTPRM-211ENST00000580170 CFC1P0CG37 223 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRM-211ENST00000580170 NLRC5Q86WI3 1866 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRM-211ENST00000580170 POU2AF1Q16633 256 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRM-211ENST00000580170 HELZP42694 1942 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
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PTPRM-211ENST00000580170 ZNF747Q9BV97 191 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRM-211ENST00000580170 PCP2Q8IVA1 136 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRM-211ENST00000580170 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
PTPRM-211ENST00000580170 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRM-211ENST00000580170 NKAPP1Q8N9T2 125 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRM-211ENST00000580170 DYNAPQ8N1N2 210 aa16.83■□□□□ 0.29
PTPRM-211ENST00000580170 WDR81Q562E7 1941 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRM-211ENST00000580170 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
PTPRM-211ENST00000580170 TRAV25A0A0B4J276 109 aa16.83■□□□□ 0.28
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PTPRM-211ENST00000580170 MYO7BQ6PIF6 2116 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRM-211ENST00000580170 IGLL5B9A064 214 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRM-211ENST00000580170 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
PTPRM-211ENST00000580170 NDUFC2O95298 119 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRM-211ENST00000580170 HERVK_113P63121 156 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRM-211ENST00000580170 SCRT2Q9NQ03 307 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRM-211ENST00000580170 ACYP1P07311 99 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRM-211ENST00000580170 J3KT08 172 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRM-211ENST00000580170 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
PTPRM-211ENST00000580170 C3orf56Q8N813 242 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRM-211ENST00000580170 KAAG1Q9UBP8 84 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRM-211ENST00000580170 CEP250Q9BV73 2442 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRM-211ENST00000580170 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
PTPRM-211ENST00000580170 GNRH2O43555 120 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRM-211ENST00000580170 AKAP6Q13023 2319 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRM-211ENST00000580170 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
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