RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200		H3BNG1	76 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	SPINK4	O60575	86 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	CCL18	P55774	89 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1W2PPV4	95 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	RGS13	O14921	159 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PPP4C-205	ENST00000563200		Q6ZNX1	250 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	TMED6	Q8WW62	240 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A0J9YY99	117 aa		15.13	■□□□□ 0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	15.13	■□□□□ 0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	ASB13	Q8WXK3	278 aa		15.13	■□□□□ 0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		15.12	■□□□□ 0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	PGP	A6NDG6	321 aa		15.12	■□□□□ 0.01
PPP4C-205	ENST00000563200		Q6AWC8	147 aa		15.12	■□□□□ 0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		15.12	■□□□□ 0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		15.12	■□□□□ 0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	HYLS1	Q96M11	299 aa		15.12	■□□□□ 0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	15.12	■□□□□ 0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		15.11	■□□□□ 0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	SSX7	Q7RTT5	188 aa		15.11	■□□□□ 0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		15.11	■□□□□ 0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		15.1	■□□□□ 0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	15.1	■□□□□ 0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	ATP6V0C	P27449	155 aa		15.1	■□□□□ 0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	RGS21	Q2M5E4	152 aa		15.1	■□□□□ 0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		15.1	■□□□□ 0.01
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1B0GVG6	124 aa		15.09	■□□□□ 0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	STAG3L2	P0CL84	134 aa		15.09	■□□□□ 0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	STAG3L3	P0CL85	134 aa		15.09	■□□□□ 0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		15.09	■□□□□ 0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	15.09	■□□□□ 0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		15.09	■□□□□ 0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		15.09	■□□□□ 0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	SUN5	Q8TC36	379 aa		15.09	■□□□□ 0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	RNF222	A6NCQ9	220 aa		15.09	■□□□□ 0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	SERF2	P84101	59 aa		15.09	■□□□□ 0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		15.09	■□□□□ 0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		15.09	■□□□□ 0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		15.09	■□□□□ 0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	ESRG	Q1W209	222 aa		15.08	■□□□□ 0
PPP4C-205	ENST00000563200	MUC21	Q5SSG8	566 aa		15.08	■□□□□ 0
PPP4C-205	ENST00000563200	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		15.08	■□□□□ 0
PPP4C-205	ENST00000563200	RAB24	Q969Q5	203 aa		15.08	■□□□□ 0
PPP4C-205	ENST00000563200	TVP23C	Q96ET8	276 aa		15.08	■□□□□ 0
PPP4C-205	ENST00000563200	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		15.08	■□□□□ 0
PPP4C-205	ENST00000563200	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	15.08	■□□□□ 0
PPP4C-205	ENST00000563200	TDRG1	Q3Y452	100 aa		15.07	■□□□□ 0
PPP4C-205	ENST00000563200	UPK3B	Q9BT76	320 aa		15.07	■□□□□ 0
PPP4C-205	ENST00000563200	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		15.07	■□□□□ 0
PPP4C-205	ENST00000563200	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		15.07	■□□□□ 0
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A096LPF7	62 aa		15.06	■□□□□ 0
PPP4C-205	ENST00000563200	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		15.06	■□□□□ 0
PPP4C-205	ENST00000563200		G3V3Q6	166 aa		15.06	■□□□□ 0
PPP4C-205	ENST00000563200	MB	P02144	154 aa		15.06	■□□□□ 0
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF415	Q09FC8	603 aa		15.06	■□□□□ 0
PPP4C-205	ENST00000563200		Q9H8V8	135 aa		15.06	■□□□□ 0
PPP4C-205	ENST00000563200	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		15.06	■□□□□ 0
PPP4C-205	ENST00000563200	GNG5	P63218	68 aa		15.05	■□□□□ -0
PPP4C-205	ENST00000563200	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	15.05	■□□□□ -0
PPP4C-205	ENST00000563200	GCHFR	P30047	84 aa		15.04	■□□□□ -0
PPP4C-205	ENST00000563200	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	15.04	■□□□□ -0
PPP4C-205	ENST00000563200	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		15.04	■□□□□ -0
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		15.03	■□□□□ -0
PPP4C-205	ENST00000563200	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	15.03	■□□□□ -0
PPP4C-205	ENST00000563200	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		15.02	■□□□□ -0
PPP4C-205	ENST00000563200	IGHV3-53	P01767	116 aa		15.02	■□□□□ -0
PPP4C-205	ENST00000563200	FHL2	Q14192	279 aa		15.02	■□□□□ -0
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		15.02	■□□□□ -0
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		15.02	■□□□□ -0
PPP4C-205	ENST00000563200	C6orf223	Q8N319	242 aa		15.02	■□□□□ -0
PPP4C-205	ENST00000563200	RASL10A	Q92737	203 aa		15.02	■□□□□ -0
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM210A	Q96ND0	272 aa		15.02	■□□□□ -0
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		15.02	■□□□□ -0
PPP4C-205	ENST00000563200	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		15.01	□□□□□ -0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		15.01	□□□□□ -0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	TCRA	P04437	139 aa		15.01	□□□□□ -0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		15.01	□□□□□ -0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	SPX	Q9BT56	116 aa		15.01	□□□□□ -0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	TREM1	Q9NP99	234 aa		15.01	□□□□□ -0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	PRO0255	Q9UI72	69 aa		15.01	□□□□□ -0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		15.01	□□□□□ -0.01
PPP4C-205	ENST00000563200		F6UZH7	168 aa		15	□□□□□ -0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	CXorf1	O96002	111 aa		15	□□□□□ -0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		15	□□□□□ -0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		15	□□□□□ -0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	GGTLC3	B5MD39	225 aa		15	□□□□□ -0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	PAX4	O43316	350 aa		15	□□□□□ -0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	GNRH2	O43555	120 aa		15	□□□□□ -0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	CRYBA4	P53673	196 aa		15	□□□□□ -0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF726P1	Q15940	193 aa		15	□□□□□ -0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	SGK494	Q96LW2	274 aa		15	□□□□□ -0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	NAGK	Q9UJ70	344 aa		15	□□□□□ -0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	RYR1	P21817	5038 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		14.99	□□□□□ -0.01

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93.6 ms