RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560971.1

GCSHP2-201, Transcript of glycine cleavage system protein H pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene GCSHP2, Length 527 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP2-201ENST00000560971 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa13.14□□□□□ -0.31
GCSHP2-201ENST00000560971 SNURFLB1AK76 121 aa13.14□□□□□ -0.31
GCSHP2-201ENST00000560971 FHITP49789 147 aa13.14□□□□□ -0.31
GCSHP2-201ENST00000560971 TMUB2Q71RG4 321 aa13.14□□□□□ -0.31
GCSHP2-201ENST00000560971 C5orf17Q8NAS9 161 aa13.14□□□□□ -0.31
GCSHP2-201ENST00000560971 TMED6Q8WW62 240 aa13.14□□□□□ -0.31
GCSHP2-201ENST00000560971 TVP23CQ96ET8 276 aa13.14□□□□□ -0.31
GCSHP2-201ENST00000560971 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa13.14□□□□□ -0.31
GCSHP2-201ENST00000560971 LENEPQ9Y5L5 61 aa13.14□□□□□ -0.31
GCSHP2-201ENST00000560971 DNAH6Q9C0G6 4158 aa13.13□□□□□ -0.31
GCSHP2-201ENST00000560971 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa13.13□□□□□ -0.31
GCSHP2-201ENST00000560971 RGS13O14921 159 aa13.13□□□□□ -0.31
GCSHP2-201ENST00000560971 TCRAP04437 139 aa13.13□□□□□ -0.31
GCSHP2-201ENST00000560971 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa13.13□□□□□ -0.31
GCSHP2-201ENST00000560971 C11orf72Q8NBR9 251 aa13.13□□□□□ -0.31
GCSHP2-201ENST00000560971 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa13.12□□□□□ -0.31
GCSHP2-201ENST00000560971 GAGE12BA1L429 117 aa13.12□□□□□ -0.31
GCSHP2-201ENST00000560971 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa13.12□□□□□ -0.31
GCSHP2-201ENST00000560971 PFDN1O60925 122 aa13.12□□□□□ -0.31
GCSHP2-201ENST00000560971 GAGE7O76087 117 aa13.12□□□□□ -0.31
GCSHP2-201ENST00000560971 GAGE12FP0CL80 117 aa13.12□□□□□ -0.31
GCSHP2-201ENST00000560971 GAGE12GP0CL81 117 aa13.12□□□□□ -0.31
GCSHP2-201ENST00000560971 GAGE12IP0CL82 117 aa13.12□□□□□ -0.31
GCSHP2-201ENST00000560971 UBE2G2P60604 165 aa13.12□□□□□ -0.31
GCSHP2-201ENST00000560971 MUC21Q5SSG8 566 aa13.12□□□□□ -0.31
GCSHP2-201ENST00000560971 TMEM88Q6PEY1 159 aa13.12□□□□□ -0.31
GCSHP2-201ENST00000560971 TCTE3Q8IZS6 198 aa13.12□□□□□ -0.31
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF680Q8NEM1 530 aa13.12□□□□□ -0.31
GCSHP2-201ENST00000560971 FAM210BQ96KR6 192 aa13.12□□□□□ -0.31
GCSHP2-201ENST00000560971 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa13.12□□□□□ -0.31
GCSHP2-201ENST00000560971 EPDR1Q9UM22 224 aa13.12□□□□□ -0.31
GCSHP2-201ENST00000560971 A0A1W2PRE2 83 aa13.11□□□□□ -0.31
GCSHP2-201ENST00000560971 F5H768 121 aa13.11□□□□□ -0.31
GCSHP2-201ENST00000560971 F6UZH7 168 aa13.11□□□□□ -0.31
GCSHP2-201ENST00000560971 ATP5G1P05496 136 aa13.11□□□□□ -0.31
GCSHP2-201ENST00000560971 SEC11BP0C7V7 166 aa13.11□□□□□ -0.31
GCSHP2-201ENST00000560971 ATP5G3P48201 142 aa13.11□□□□□ -0.31
GCSHP2-201ENST00000560971 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
GCSHP2-201ENST00000560971 Q6AWC8 147 aa13.11□□□□□ -0.31
GCSHP2-201ENST00000560971 Q6ZTI0 123 aa13.11□□□□□ -0.31
GCSHP2-201ENST00000560971 LINC00612Q8N6U2 182 aa13.11□□□□□ -0.31
GCSHP2-201ENST00000560971 KLF12Q9Y4X4 402 aa13.11□□□□□ -0.31
GCSHP2-201ENST00000560971 TREM1Q9NP99 234 aa13.1□□□□□ -0.31
GCSHP2-201ENST00000560971 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
GCSHP2-201ENST00000560971 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa13.09□□□□□ -0.31
GCSHP2-201ENST00000560971 IGLV2-11P01706 119 aa13.09□□□□□ -0.31
GCSHP2-201ENST00000560971 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
GCSHP2-201ENST00000560971 FAM213BQ8TBF2 198 aa13.09□□□□□ -0.31
GCSHP2-201ENST00000560971 FAM74A7A6NL05 159 aa13.08□□□□□ -0.32
GCSHP2-201ENST00000560971 K7EQM0 130 aa13.08□□□□□ -0.32
GCSHP2-201ENST00000560971 IFNA7P01567 189 aa13.08□□□□□ -0.32
GCSHP2-201ENST00000560971 TCL1AP56279 114 aa13.08□□□□□ -0.32
GCSHP2-201ENST00000560971 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa13.08□□□□□ -0.32
GCSHP2-201ENST00000560971 LINC00479Q96M42 142 aa13.08□□□□□ -0.32
GCSHP2-201ENST00000560971 C8orf49Q96NF6 230 aa13.08□□□□□ -0.32
GCSHP2-201ENST00000560971 ATG101Q9BSB4 218 aa13.08□□□□□ -0.32
GCSHP2-201ENST00000560971 PSG8Q9UQ74 426 aa13.08□□□□□ -0.32
GCSHP2-201ENST00000560971 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa13.07□□□□□ -0.32
GCSHP2-201ENST00000560971 UMAD1C9J7I0 102 aa13.07□□□□□ -0.32
GCSHP2-201ENST00000560971 TPT1P13693 172 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
GCSHP2-201ENST00000560971 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
GCSHP2-201ENST00000560971 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
GCSHP2-201ENST00000560971 PRNTQ86SH4 94 aa13.07□□□□□ -0.32
GCSHP2-201ENST00000560971 SFT2D1Q8WV19 159 aa13.07□□□□□ -0.32
GCSHP2-201ENST00000560971 MDFICQ9P1T7 246 aa13.07□□□□□ -0.32
GCSHP2-201ENST00000560971 NAGKQ9UJ70 344 aa13.07□□□□□ -0.32
GCSHP2-201ENST00000560971 TRAV34A0A0B4J273 112 aa13.06□□□□□ -0.32
GCSHP2-201ENST00000560971 A0A1B0GV50 99 aa13.06□□□□□ -0.32
GCSHP2-201ENST00000560971 SPINK4O60575 86 aa13.06□□□□□ -0.32
GCSHP2-201ENST00000560971 C1QBP02746 253 aa13.06□□□□□ -0.32
GCSHP2-201ENST00000560971 HOXA5P20719 270 aa13.06□□□□□ -0.32
GCSHP2-201ENST00000560971 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
GCSHP2-201ENST00000560971 FAM159AQ6UWV7 190 aa13.06□□□□□ -0.32
GCSHP2-201ENST00000560971 AKAP14Q86UN6 197 aa13.06□□□□□ -0.32
GCSHP2-201ENST00000560971 TMEM75Q8N9X5 138 aa13.06□□□□□ -0.32
GCSHP2-201ENST00000560971 STOML3Q8TAV4 291 aa13.06□□□□□ -0.32
GCSHP2-201ENST00000560971 MBD3L1Q8WWY6 194 aa13.06□□□□□ -0.32
GCSHP2-201ENST00000560971 NDFIP1Q9BT67 221 aa13.06□□□□□ -0.32
GCSHP2-201ENST00000560971 DNAH10Q8IVF4 4471 aa13.05□□□□□ -0.32
GCSHP2-201ENST00000560971 TRAV21A0A0B4J279 112 aa13.05□□□□□ -0.32
GCSHP2-201ENST00000560971 P0DMU3 169 aa13.05□□□□□ -0.32
GCSHP2-201ENST00000560971 FAM231AP0DMU4 169 aa13.05□□□□□ -0.32
GCSHP2-201ENST00000560971 FAM231CP0DMU5 169 aa13.05□□□□□ -0.32
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
GCSHP2-201ENST00000560971 OR5I1Q13606 314 aa13.05□□□□□ -0.32
GCSHP2-201ENST00000560971 TMEM183BQ1AE95 376 aa13.05□□□□□ -0.32
GCSHP2-201ENST00000560971 TMEM183AQ8IXX5 376 aa13.05□□□□□ -0.32
GCSHP2-201ENST00000560971 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
GCSHP2-201ENST00000560971 TRGV2A0A075B6R0 118 aa13.04□□□□□ -0.32
GCSHP2-201ENST00000560971 PEX7O00628 323 aa13.04□□□□□ -0.32
GCSHP2-201ENST00000560971 GNRH2O43555 120 aa13.04□□□□□ -0.32
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF415Q09FC8 603 aa13.04□□□□□ -0.32
GCSHP2-201ENST00000560971 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
GCSHP2-201ENST00000560971 TDRG1Q3Y452 100 aa13.03□□□□□ -0.32
GCSHP2-201ENST00000560971 CST9LP1Q5W188 147 aa13.03□□□□□ -0.32
GCSHP2-201ENST00000560971 DPPA3Q6W0C5 159 aa13.03□□□□□ -0.32
GCSHP2-201ENST00000560971 POM121L12Q8N7R1 296 aa13.03□□□□□ -0.32
GCSHP2-201ENST00000560971 C15orf53Q8NAA6 179 aa13.03□□□□□ -0.32
GCSHP2-201ENST00000560971 TRGV11A0A075B6L2 103 aa13.02□□□□□ -0.33
GCSHP2-201ENST00000560971 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms