RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547541.1

TARBP2-208, Transcript of TARBP2, RISC loading complex RNA binding subunit, human

TSL 3

Gene TARBP2, Length 430 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARBP2-208	ENST00000547541	HIGD1C	A8MV81	97 aa		7.55	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	MT-ND6	P03923	174 aa		7.55	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	TFPI2	P48307	235 aa		7.55	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		7.55	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	PSMG4	Q5JS54	123 aa		7.55	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		7.55	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		7.55	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	NUP35	Q8NFH5	326 aa		7.55	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	NEU1	Q99519	415 aa		7.55	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		7.55	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541		A0A1B0GW15	77 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	TRGC2	P03986	189 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	ZNF688	P0C7X2	276 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	LEP	P41159	167 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	LINC01559	Q495D7	138 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	CITED1	Q99966	193 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541		A8MTW9	85 aa		7.53	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541		F2Z2F3	143 aa		7.53	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	PHOX2A	O14813	284 aa		7.53	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	IGLV1-51	P01701	117 aa		7.53	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	PF4	P02776	101 aa		7.53	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	S100A8	P05109	93 aa		7.53	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	GPX1	P07203	203 aa		7.53	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	TSPO	P30536	169 aa		7.53	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	INSL3	P51460	131 aa		7.53	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	TCL1A	P56279	114 aa		7.53	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		7.53	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		7.53	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		7.53	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	GTSF1	Q8WW33	167 aa		7.53	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		7.53	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
TARBP2-208	ENST00000547541	KLLN	B2CW77	178 aa		7.52	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541		F6UB75	175 aa		7.52	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541	HLA-DQA1	P01909	254 aa		7.52	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541	ORM1	P02763	201 aa		7.52	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541	RIPPLY3	P57055	190 aa		7.52	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541	RIG	Q13278	110 aa		7.52	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		7.52	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541	BORCS7	Q96B45	105 aa		7.52	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541	CUBN	O60494	3623 aa		7.52	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541		A0A1B0GUT8	65 aa		7.51	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541		A0A1B0GXF2	115 aa		7.51	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541	SAP30	O75446	220 aa		7.51	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541	S100A6	P06703	90 aa		7.51	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541	IGLC6	P0CF74	106 aa		7.51	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541	HLA-DRB4	P13762	266 aa		7.51	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541	DEFB131A	P59861	70 aa		7.51	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		7.51	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		7.51	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		7.51	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541	GATD1	Q8NB37	220 aa		7.51	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541	FRZB	Q92765	325 aa		7.51	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		7.51	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		7.51	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		7.51	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		7.51	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541	ATR	Q13535	2644 aa		7.5	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		7.5	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541	SNURFL	B1AK76	121 aa		7.5	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541		H3BMM0	161 aa		7.5	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541	HIST1H2BK	O60814	126 aa		7.5	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		7.5	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541	TRGC1	P0CF51	173 aa		7.5	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541	MED14OS	P0DP75	135 aa		7.5	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541	HIST1H2BO	P23527	126 aa		7.5	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541	HIST1H2BB	P33778	126 aa		7.5	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541	CDKN1B	P46527	198 aa		7.5	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541	HIST1H2BD	P58876	126 aa		7.5	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541	HIST1H2BC	P62807	126 aa		7.5	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541	HBB	P68871	147 aa		7.5	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		7.5	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		7.5	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541	ZNF575	Q86XF7	245 aa		7.5	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		7.5	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541	KCNS1	Q96KK3	526 aa		7.5	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		7.5	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		7.5	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541	C7orf71	A4D174	169 aa		7.49	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541	SPINK4	O60575	86 aa		7.49	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541	AMBP	P02760	352 aa		7.49	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541	GZMB	P10144	247 aa		7.49	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541	CD33	P20138	364 aa		7.49	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541	CTRL	P40313	264 aa		7.49	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541	DEFB1	P60022	68 aa		7.49	□□□□□ -1.21
TARBP2-208	ENST00000547541	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		7.49	□□□□□ -1.21

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