RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535535.5

LMO3-212, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-212ENST00000535535 THAP8Q8NA92 274 aa6.03□□□□□ -1.44
LMO3-212ENST00000535535 OR2T10Q8NGZ9 312 aa6.03□□□□□ -1.44
LMO3-212ENST00000535535 FMC1Q96HJ9 113 aa6.03□□□□□ -1.44
LMO3-212ENST00000535535 PRELID3AQ96N28 172 aa6.03□□□□□ -1.44
LMO3-212ENST00000535535 C20orf78Q9BR46 151 aa6.03□□□□□ -1.44
LMO3-212ENST00000535535 NMES1Q9C002 83 aa6.03□□□□□ -1.44
LMO3-212ENST00000535535 IMUPQ9GZP8 106 aa6.03□□□□□ -1.44
LMO3-212ENST00000535535 MANBALQ9NQG1 85 aa6.03□□□□□ -1.44
LMO3-212ENST00000535535 TAAR3PQ9P1P4 343 aa6.03□□□□□ -1.44
LMO3-212ENST00000535535 WDR83OSQ9Y284 106 aa6.03□□□□□ -1.44
LMO3-212ENST00000535535 OR2W1Q9Y3N9 320 aa6.03□□□□□ -1.44
LMO3-212ENST00000535535 KCNE3Q9Y6H6 103 aa6.03□□□□□ -1.44
LMO3-212ENST00000535535 PXMP4Q9Y6I8 212 aa6.03□□□□□ -1.44
LMO3-212ENST00000535535 ZNF737O75373 536 aa6.02□□□□□ -1.44
LMO3-212ENST00000535535 COL8A2P25067 703 aa6.02□□□□□ -1.44
LMO3-212ENST00000535535 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.44
LMO3-212ENST00000535535 ARFRP1Q13795 201 aa6.02□□□□□ -1.44
LMO3-212ENST00000535535 C12orf74Q32Q52 190 aa6.02□□□□□ -1.44
LMO3-212ENST00000535535 ANKRD29Q8N6D5 301 aa6.02□□□□□ -1.44
LMO3-212ENST00000535535 OR10AC1Q8NH08 325 aa6.02□□□□□ -1.44
LMO3-212ENST00000535535 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa6.02□□□□□ -1.44
LMO3-212ENST00000535535 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.44
LMO3-212ENST00000535535 ZNF665Q9H7R5 613 aa6.02□□□□□ -1.44
LMO3-212ENST00000535535 RYR3Q15413 4870 aa6.02□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.02□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 TRACP01848 142 aa6.02□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 ZNF688P0C7X2 276 aa6.02□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 UBE2E1P51965 193 aa6.02□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 ETDBQ3ZM63 59 aa6.02□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 Q6ZRU5 148 aa6.02□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 LHFPL1Q86WI0 220 aa6.02□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 UBE2E2Q96LR5 201 aa6.02□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 Q9H8V8 135 aa6.02□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa6.02□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 TRAV27A0A087WT01 109 aa6.01□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa6.01□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 AAED1Q7RTV5 226 aa6.01□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 OR10G8Q8NGN5 311 aa6.01□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa6.01□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 CARD19Q96LW7 228 aa6.01□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 AMELYQ99218 206 aa6.01□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 RTL8AQ9BWD3 113 aa6.01□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 TM2D1Q9BX74 207 aa6.01□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 DOCK11Q5JSL3 2073 aa6.01□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 COL7A1Q02388 2944 aa6.01□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 CRISP2P16562 243 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 MDKP21741 143 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 TMEM256Q8N2U0 113 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 PRR26Q8N8Z3 221 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 ZNF563Q8TA94 476 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP6□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 BORCS8Q96FH0 119 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 GFI1Q99684 422 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 SDF2L1Q9HCN8 221 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 NRN1Q9NPD7 142 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 TENM3Q9P273 2699 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa5.99□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa5.99□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 FCN1O00602 326 aa5.99□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 PLXNB1O43157 2135 aa5.99□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 SMIM13P0DJ93 91 aa5.99□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 PYYP10082 97 aa5.99□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 DUTP33316 252 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 RPL38P63173 70 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 PSMG4Q5JS54 123 aa5.99□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 TMEM136Q6ZRR5 245 aa5.99□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 MDP1Q86V88 176 aa5.99□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 KCNS1Q96KK3 526 aa5.99□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 TRBV19A0A075B6N1 114 aa5.98□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 KNCNA6PVL3 124 aa5.98□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 CD3DP04234 171 aa5.98□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 IGLL1P15814 213 aa5.98□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 APOC4P55056 127 aa5.98□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 ARL16Q0P5N6 197 aa5.98□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 FUT5Q11128 374 aa5.98□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 EBI3Q14213 229 aa5.98□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 WFDC2Q14508 124 aa5.98□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 LCE1EQ5T753 118 aa5.98□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 SPATA12Q7Z6I5 190 aa5.98□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 BAGE3Q86Y29 109 aa5.98□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 BAGE2Q86Y30 109 aa5.98□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 LINC01561Q8N1V8 128 aa5.98□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 FAM24AA6NFZ4 105 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 SMKR1H3BMG3 65 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 SERF1AO75920 110 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 CA6P23280 308 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 CLDN17P56750 224 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-212ENST00000535535 RTL8BQ17RB0 113 aa5.97□□□□□ -1.45
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