RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496569.1

HDLBP-246, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 4

Gene HDLBP, Length 374 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-246ENST00000496569 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa8.51□□□□□ -1.05
HDLBP-246ENST00000496569 F6UZH7 168 aa8.51□□□□□ -1.05
HDLBP-246ENST00000496569 SMLR1H3BR10 107 aa8.51□□□□□ -1.05
HDLBP-246ENST00000496569 RGS13O14921 159 aa8.51□□□□□ -1.05
HDLBP-246ENST00000496569 IGHV3-53P01767 116 aa8.51□□□□□ -1.05
HDLBP-246ENST00000496569 Q6ZR54 194 aa8.51□□□□□ -1.05
HDLBP-246ENST00000496569 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa8.51□□□□□ -1.05
HDLBP-246ENST00000496569 OTORQ9NRC9 128 aa8.51□□□□□ -1.05
HDLBP-246ENST00000496569 LINC00588Q9Y4M8 146 aa8.51□□□□□ -1.05
HDLBP-246ENST00000496569 PCLOQ9Y6V0 5065 aa8.51□□□□□ -1.05
HDLBP-246ENST00000496569 TCL1AP56279 114 aa8.5□□□□□ -1.05
HDLBP-246ENST00000496569 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
HDLBP-246ENST00000496569 ZNF266Q14584 549 aa8.5□□□□□ -1.05
HDLBP-246ENST00000496569 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa8.5□□□□□ -1.05
HDLBP-246ENST00000496569 RNF212Q495C1 297 aa8.5□□□□□ -1.05
HDLBP-246ENST00000496569 LYPD1Q8N2G4 141 aa8.5□□□□□ -1.05
HDLBP-246ENST00000496569 ZNF680Q8NEM1 530 aa8.5□□□□□ -1.05
HDLBP-246ENST00000496569 OR2T35Q8NGX2 323 aa8.5□□□□□ -1.05
HDLBP-246ENST00000496569 RAB24Q969Q5 203 aa8.5□□□□□ -1.05
HDLBP-246ENST00000496569 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
HDLBP-246ENST00000496569 TVP23CQ96ET8 276 aa8.5□□□□□ -1.05
HDLBP-246ENST00000496569 TRGV2A0A075B6R0 118 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-246ENST00000496569 A0A1B0GVY2 172 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-246ENST00000496569 RBAKDNA6NC62 111 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-246ENST00000496569 STAG3L2P0CL84 134 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-246ENST00000496569 STAG3L3P0CL85 134 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-246ENST00000496569 RGS21Q2M5E4 152 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-246ENST00000496569 LGALS9BQ3B8N2 356 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-246ENST00000496569 PQLC2Q6ZP29 291 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-246ENST00000496569 OR2G3Q8NGZ4 309 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-246ENST00000496569 ZNRF2Q8NHG8 242 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-246ENST00000496569 CMTM2Q8TAZ6 248 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-246ENST00000496569 ARPC5LQ9BPX5 153 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-246ENST00000496569 LINC00467Q9BRT7 94 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-246ENST00000496569 MDFICQ9P1T7 246 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-246ENST00000496569 NAGKQ9UJ70 344 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-246ENST00000496569 TNFSF18Q9UNG2 199 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-246ENST00000496569 PRSS29PA6NIE9 313 aa8.48□□□□□ -1.05
HDLBP-246ENST00000496569 SPINK4O60575 86 aa8.48□□□□□ -1.05
HDLBP-246ENST00000496569 NMBP08949 121 aa8.48□□□□□ -1.05
HDLBP-246ENST00000496569 GCHFRP30047 84 aa8.48□□□□□ -1.05
HDLBP-246ENST00000496569 ZNF726P1Q15940 193 aa8.48□□□□□ -1.05
HDLBP-246ENST00000496569 TMEM183BQ1AE95 376 aa8.48□□□□□ -1.05
HDLBP-246ENST00000496569 IQCF2Q8IXL9 164 aa8.48□□□□□ -1.05
HDLBP-246ENST00000496569 TMEM183AQ8IXX5 376 aa8.48□□□□□ -1.05
HDLBP-246ENST00000496569 RXFP4Q8TDU9 374 aa8.48□□□□□ -1.05
HDLBP-246ENST00000496569 VSIG2Q96IQ7 327 aa8.48□□□□□ -1.05
HDLBP-246ENST00000496569 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
HDLBP-246ENST00000496569 ZNF415Q09FC8 603 aa8.47□□□□□ -1.05
HDLBP-246ENST00000496569 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
HDLBP-246ENST00000496569 Q6AWC8 147 aa8.47□□□□□ -1.05
HDLBP-246ENST00000496569 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
HDLBP-246ENST00000496569 C8orf49Q96NF6 230 aa8.47□□□□□ -1.05
HDLBP-246ENST00000496569 A0A096LPF7 62 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-246ENST00000496569 GGTLC3B5MD39 225 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-246ENST00000496569 ARPC5O15511 151 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-246ENST00000496569 SFTA3P0C7M3 94 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-246ENST00000496569 ESRGQ1W209 222 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-246ENST00000496569 LINC00336Q6ZUF6 198 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-246ENST00000496569 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-246ENST00000496569 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-246ENST00000496569 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-246ENST00000496569 GNRH2O43555 120 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-246ENST00000496569 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-246ENST00000496569 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-246ENST00000496569 CCL18P55774 89 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-246ENST00000496569 UBE2G2P60604 165 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-246ENST00000496569 FAM74A1Q5RGS3 127 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-246ENST00000496569 TMEM75Q8N9X5 138 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-246ENST00000496569 TREM1Q9NP99 234 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-246ENST00000496569 CYTL1Q9NRR1 136 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-246ENST00000496569 C11orf21Q9P2W6 132 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-246ENST00000496569 TCRAP04437 139 aa8.44□□□□□ -1.06
HDLBP-246ENST00000496569 TYMSP04818 313 aa8.44□□□□□ -1.06
HDLBP-246ENST00000496569 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
HDLBP-246ENST00000496569 SERF2P84101 59 aa8.44□□□□□ -1.06
HDLBP-246ENST00000496569 C1orf134Q5TEV5 83 aa8.44□□□□□ -1.06
HDLBP-246ENST00000496569 FAM159AQ6UWV7 190 aa8.44□□□□□ -1.06
HDLBP-246ENST00000496569 C5orf17Q8NAS9 161 aa8.44□□□□□ -1.06
HDLBP-246ENST00000496569 SUN5Q8TC36 379 aa8.44□□□□□ -1.06
HDLBP-246ENST00000496569 TMED6Q8WW62 240 aa8.44□□□□□ -1.06
HDLBP-246ENST00000496569 ZNF479Q96JC4 524 aa8.44□□□□□ -1.06
HDLBP-246ENST00000496569 ST6GAL2Q96JF0 529 aa8.44□□□□□ -1.06
HDLBP-246ENST00000496569 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
HDLBP-246ENST00000496569 LENEPQ9Y5L5 61 aa8.44□□□□□ -1.06
HDLBP-246ENST00000496569 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa8.43□□□□□ -1.06
HDLBP-246ENST00000496569 TRAV34A0A0B4J273 112 aa8.43□□□□□ -1.06
HDLBP-246ENST00000496569 CXorf1O96002 111 aa8.43□□□□□ -1.06
HDLBP-246ENST00000496569 TNP2Q05952 138 aa8.43□□□□□ -1.06
HDLBP-246ENST00000496569 FHL2Q14192 279 aa8.43□□□□□ -1.06
HDLBP-246ENST00000496569 PRNTQ86SH4 94 aa8.43□□□□□ -1.06
HDLBP-246ENST00000496569 ASB13Q8WXK3 278 aa8.43□□□□□ -1.06
HDLBP-246ENST00000496569 LINC00479Q96M42 142 aa8.43□□□□□ -1.06
HDLBP-246ENST00000496569 C18orf15Q96N68 181 aa8.43□□□□□ -1.06
HDLBP-246ENST00000496569 PSG8Q9UQ74 426 aa8.43□□□□□ -1.06
HDLBP-246ENST00000496569 LRP1BQ9NZR2 4599 aa8.43□□□□□ -1.06
HDLBP-246ENST00000496569 TRGV11A0A075B6L2 103 aa8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-246ENST00000496569 TRAV21A0A0B4J279 112 aa8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-246ENST00000496569 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-246ENST00000496569 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa8.42□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.9 ms