RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 GAGE10A6NGK3 116 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 SCGB2A1O75556 95 aa9.91□□□□□ -0.82
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PRAME-213ENST00000492657 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa9.91□□□□□ -0.82
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PRAME-213ENST00000492657 H3BUX3 64 aa9.87□□□□□ -0.83
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PRAME-213ENST00000492657 LINC01545Q5VT33 79 aa9.86□□□□□ -0.83
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PRAME-213ENST00000492657 AP1S3Q96PC3 154 aa9.86□□□□□ -0.83
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PRAME-213ENST00000492657 FAM104BQ5XKR9 115 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-213ENST00000492657 PCP2Q8IVA1 136 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-213ENST00000492657 KLK15Q9H2R5 256 aa9.85□□□□□ -0.83
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PRAME-213ENST00000492657 TWIST1Q15672 202 aa9.85□□□□□ -0.83
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PRAME-213ENST00000492657 C8orf86Q6ZUL3 223 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-213ENST00000492657 PRELID3AQ96N28 172 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-213ENST00000492657 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-213ENST00000492657 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa9.85□□□□□ -0.83
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PRAME-213ENST00000492657 U3KQE9 123 aa9.84□□□□□ -0.83
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PRAME-213ENST00000492657 GTSF1LQ9H1H1 148 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAME-213ENST00000492657 MS4A6AQ9H2W1 248 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAME-213ENST00000492657 K7ERJ3 54 aa9.83□□□□□ -0.84
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PRAME-213ENST00000492657 A0A096LNJ9 63 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 GAS8-AS1O95177 125 aa9.83□□□□□ -0.84
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