RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486829.1

ARHGEF3-211, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 3

Gene ARHGEF3, Length 428 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-211ENST00000486829 TM2D3Q9BRN9 247 aa8.35□□□□□ -1.07
ARHGEF3-211ENST00000486829 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa8.35□□□□□ -1.07
ARHGEF3-211ENST00000486829 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa8.35□□□□□ -1.07
ARHGEF3-211ENST00000486829 COL7A1Q02388 2944 aa8.34□□□□□ -1.07
ARHGEF3-211ENST00000486829 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa8.34□□□□□ -1.07
ARHGEF3-211ENST00000486829 C7orf71A4D174 169 aa8.34□□□□□ -1.07
ARHGEF3-211ENST00000486829 H7BYZ3 331 aa8.34□□□□□ -1.07
ARHGEF3-211ENST00000486829 GNG4P50150 75 aa8.34□□□□□ -1.07
ARHGEF3-211ENST00000486829 FXYD7P58549 80 aa8.34□□□□□ -1.07
ARHGEF3-211ENST00000486829 DEFB135Q30KP9 77 aa8.34□□□□□ -1.07
ARHGEF3-211ENST00000486829 SMUG1Q53HV7 270 aa8.34□□□□□ -1.07
ARHGEF3-211ENST00000486829 GFI1BQ5VTD9 330 aa8.34□□□□□ -1.07
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ARHGEF3-211ENST00000486829 COX8CQ7Z4L0 72 aa8.34□□□□□ -1.07
ARHGEF3-211ENST00000486829 BAGE2Q86Y30 109 aa8.34□□□□□ -1.07
ARHGEF3-211ENST00000486829 TMEM183AQ8IXX5 376 aa8.34□□□□□ -1.07
ARHGEF3-211ENST00000486829 ZMAT4Q9H898 229 aa8.34□□□□□ -1.07
ARHGEF3-211ENST00000486829 C9JCJ5 164 aa8.33□□□□□ -1.08
ARHGEF3-211ENST00000486829 SPRY2O43597 315 aa8.33□□□□□ -1.08
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ARHGEF3-211ENST00000486829 CENPWQ5EE01 88 aa8.33□□□□□ -1.08
ARHGEF3-211ENST00000486829 Q6AWC8 147 aa8.33□□□□□ -1.08
ARHGEF3-211ENST00000486829 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
ARHGEF3-211ENST00000486829 TVP23CQ96ET8 276 aa8.33□□□□□ -1.08
ARHGEF3-211ENST00000486829 ASCL2Q99929 193 aa8.33□□□□□ -1.08
ARHGEF3-211ENST00000486829 TMEM208Q9BTX3 173 aa8.33□□□□□ -1.08
ARHGEF3-211ENST00000486829 DERL1Q9BUN8 251 aa8.33□□□□□ -1.08
ARHGEF3-211ENST00000486829 PARLQ9H300 379 aa8.33□□□□□ -1.08
ARHGEF3-211ENST00000486829 BIN3Q9NQY0 253 aa8.33□□□□□ -1.08
ARHGEF3-211ENST00000486829 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa8.33□□□□□ -1.08
ARHGEF3-211ENST00000486829 DNAH9Q9NYC9 4486 aa8.33□□□□□ -1.08
ARHGEF3-211ENST00000486829 TRAV21A0A0B4J279 112 aa8.32□□□□□ -1.08
ARHGEF3-211ENST00000486829 LINC00862A6NCI5 91 aa8.32□□□□□ -1.08
ARHGEF3-211ENST00000486829 SMIM9A6NGZ8 99 aa8.32□□□□□ -1.08
ARHGEF3-211ENST00000486829 J3KRW8 73 aa8.32□□□□□ -1.08
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ARHGEF3-211ENST00000486829 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
ARHGEF3-211ENST00000486829 BTN1A1Q13410 526 aa8.32□□□□□ -1.08
ARHGEF3-211ENST00000486829 NEU1Q99519 415 aa8.32□□□□□ -1.08
ARHGEF3-211ENST00000486829 OVOL2Q9BRP0 275 aa8.32□□□□□ -1.08
ARHGEF3-211ENST00000486829 PYGO2Q9BRQ0 406 aa8.32□□□□□ -1.08
ARHGEF3-211ENST00000486829 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa8.31□□□□□ -1.08
ARHGEF3-211ENST00000486829 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
ARHGEF3-211ENST00000486829 GCGP01275 180 aa8.31□□□□□ -1.08
ARHGEF3-211ENST00000486829 CEBPGP53567 150 aa8.31□□□□□ -1.08
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ARHGEF3-211ENST00000486829 KIR3DS1Q14943 382 aa8.31□□□□□ -1.08
ARHGEF3-211ENST00000486829 ZNF674Q2M3X9 581 aa8.31□□□□□ -1.08
ARHGEF3-211ENST00000486829 FAM162BQ5T6X4 162 aa8.31□□□□□ -1.08
ARHGEF3-211ENST00000486829 PRR9Q5T870 116 aa8.31□□□□□ -1.08
ARHGEF3-211ENST00000486829 C1orf158Q8N1D5 194 aa8.31□□□□□ -1.08
ARHGEF3-211ENST00000486829 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
ARHGEF3-211ENST00000486829 C8orf49Q96NF6 230 aa8.31□□□□□ -1.08
ARHGEF3-211ENST00000486829 LINC01587Q99440 93 aa8.31□□□□□ -1.08
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ARHGEF3-211ENST00000486829 LINC00467Q9BRT7 94 aa8.31□□□□□ -1.08
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ARHGEF3-211ENST00000486829 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa8.31□□□□□ -1.08
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ARHGEF3-211ENST00000486829 ZNF727A8MUV8 499 aa8.3□□□□□ -1.08
ARHGEF3-211ENST00000486829 MIFP14174 115 aa8.3□□□□□ -1.08
ARHGEF3-211ENST00000486829 SOHLH1Q5JUK2 328 aa8.3□□□□□ -1.08
ARHGEF3-211ENST00000486829 COMMD7Q86VX2 200 aa8.3□□□□□ -1.08
ARHGEF3-211ENST00000486829 OR11H2Q8NH07 326 aa8.3□□□□□ -1.08
ARHGEF3-211ENST00000486829 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa8.3□□□□□ -1.08
ARHGEF3-211ENST00000486829 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
ARHGEF3-211ENST00000486829 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa8.29□□□□□ -1.08
ARHGEF3-211ENST00000486829 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa8.29□□□□□ -1.08
ARHGEF3-211ENST00000486829 C9JQL5 133 aa8.29□□□□□ -1.08
ARHGEF3-211ENST00000486829 EREGO14944 169 aa8.29□□□□□ -1.08
ARHGEF3-211ENST00000486829 SFTA3P0C7M3 94 aa8.29□□□□□ -1.08
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ARHGEF3-211ENST00000486829 RRN3P1Q2M238 152 aa8.29□□□□□ -1.08
ARHGEF3-211ENST00000486829 TDRG1Q3Y452 100 aa8.29□□□□□ -1.08
ARHGEF3-211ENST00000486829 FAM159AQ6UWV7 190 aa8.29□□□□□ -1.08
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ARHGEF3-211ENST00000486829 KCNS1Q96KK3 526 aa8.29□□□□□ -1.08
ARHGEF3-211ENST00000486829 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa8.28□□□□□ -1.08
ARHGEF3-211ENST00000486829 TMEM189A5PLL7 270 aa8.28□□□□□ -1.08
ARHGEF3-211ENST00000486829 IGLV2-8P01709 118 aa8.28□□□□□ -1.08
ARHGEF3-211ENST00000486829 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
ARHGEF3-211ENST00000486829 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa8.28□□□□□ -1.08
ARHGEF3-211ENST00000486829 ZNF493Q6ZR52 646 aa8.28□□□□□ -1.08
ARHGEF3-211ENST00000486829 RETNQ9HD89 108 aa8.28□□□□□ -1.08
ARHGEF3-211ENST00000486829 NAT8Q9UHE5 227 aa8.28□□□□□ -1.08
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ARHGEF3-211ENST00000486829 TRGV11A0A075B6L2 103 aa8.27□□□□□ -1.09
ARHGEF3-211ENST00000486829 SH2D1AO60880 128 aa8.27□□□□□ -1.09
ARHGEF3-211ENST00000486829 MGST1P10620 155 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
ARHGEF3-211ENST00000486829 TMEM241Q24JQ0 296 aa8.27□□□□□ -1.09
ARHGEF3-211ENST00000486829 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
ARHGEF3-211ENST00000486829 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
ARHGEF3-211ENST00000486829 C16orf74Q96GX8 76 aa8.27□□□□□ -1.09
ARHGEF3-211ENST00000486829 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
ARHGEF3-211ENST00000486829 SDF2L1Q9HCN8 221 aa8.27□□□□□ -1.09
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