RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481037.5

RBM39-232, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 3

Gene RBM39, Length 687 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-232ENST00000481037 C1orf137Q5JT78 98 aa3.12□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 C1orf100Q5SVJ3 147 aa3.12□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 STEAP1BQ6NZ63 245 aa3.12□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa3.12□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 NIT1Q86X76 327 aa3.12□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa3.12□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 BEST4Q8NFU0 473 aa3.12□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 OR4C5Q8NGB2 326 aa3.12□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 OR10G4Q8NGN3 311 aa3.12□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 LRRC20Q8TCA0 184 aa3.12□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 PLGRKTQ9HBL7 147 aa3.12□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 AMBNQ9NP70 447 aa3.12□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 ENY2Q9NPA8 101 aa3.12□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa3.12□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 KMT2DO14686 5537 aa3.11□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa3.11□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 PGPA6NDG6 321 aa3.11□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 CRPP02741 224 aa3.11□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 F2RP25116 425 aa3.11□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 ARPC4P59998 168 aa3.11□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 TSPAN5P62079 268 aa3.11□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 ZNF90Q03938 601 aa3.11□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 Q0VG73 95 aa3.11□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa3.11□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 HSD17B12Q53GQ0 312 aa3.11□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 ATRAIDQ6UW56 229 aa3.11□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 TMEM17Q86X19 198 aa3.11□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 PPDPFQ9H3Y8 114 aa3.11□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 LINC00846Q9NV44 126 aa3.11□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 A0A087WX48 190 aa3.1□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 ZFP92A6NM28 416 aa3.1□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 SNTNA6NMZ2 147 aa3.1□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 SLC17A2O00624 439 aa3.1□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 LIMS3P0CW19 117 aa3.1□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 LIMS4P0CW20 117 aa3.1□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 SLC25A4P12235 298 aa3.1□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 CXCL3P19876 107 aa3.1□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 HLA-DMAP28067 261 aa3.1□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 LEPP41159 167 aa3.1□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 WNT4P56705 351 aa3.1□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 BTN1A1Q13410 526 aa3.1□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 SS18Q15532 418 aa3.1□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 CNIH2Q6PI25 160 aa3.1□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 KCNIP4Q6PIL6 250 aa3.1□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 Q6ZS49 121 aa3.1□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 LINC00173Q6ZV60 143 aa3.1□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 SLC25A29Q8N8R3 303 aa3.1□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 OR52I1Q8NGK6 324 aa3.1□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 PRADC1Q9BSG0 188 aa3.1□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 PDCD10Q9BUL8 212 aa3.1□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa3.09□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 TRAV4A0A0B4J268 109 aa3.09□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 SNRPGP15A8MWD9 76 aa3.09□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 WBP4O75554 376 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 PPYP01298 95 aa3.09□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 GADD45AP24522 165 aa3.09□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 HTR2BP41595 481 aa3.09□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 ETV1P50549 477 aa3.09□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 ELOBQ15370 118 aa3.09□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 MSMO1Q15800 293 aa3.09□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 ENHOQ6UWT2 76 aa3.09□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa3.09□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 DEFB107AQ8IZN7 70 aa3.09□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 BPIFCQ8NFQ6 507 aa3.09□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 OR10R2Q8NGX6 335 aa3.09□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 SUN5Q8TC36 379 aa3.09□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 TMBIM4Q9HC24 238 aa3.09□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 EHFQ9NZC4 300 aa3.09□□□□□ -1.91
RBM39-232ENST00000481037 TRAV18A0A075B6X5 111 aa3.08□□□□□ -1.92
RBM39-232ENST00000481037 A0A096LNI7 61 aa3.08□□□□□ -1.92
RBM39-232ENST00000481037 C7orf71A4D174 169 aa3.08□□□□□ -1.92
RBM39-232ENST00000481037 MPDU1O75352 247 aa3.08□□□□□ -1.92
RBM39-232ENST00000481037 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
RBM39-232ENST00000481037 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
RBM39-232ENST00000481037 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
RBM39-232ENST00000481037 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
RBM39-232ENST00000481037 DTYMKP23919 212 aa3.08□□□□□ -1.92
RBM39-232ENST00000481037 RAB31Q13636 194 aa3.08□□□□□ -1.92
RBM39-232ENST00000481037 RHOHQ15669 191 aa3.08□□□□□ -1.92
RBM39-232ENST00000481037 C2orf76Q3KRA6 126 aa3.08□□□□□ -1.92
RBM39-232ENST00000481037 ETFRF1Q6IPR1 90 aa3.08□□□□□ -1.92
RBM39-232ENST00000481037 C15orf54Q8N8G6 183 aa3.08□□□□□ -1.92
RBM39-232ENST00000481037 OR10G9Q8NGN4 311 aa3.08□□□□□ -1.92
RBM39-232ENST00000481037 CANT1Q8WVQ1 401 aa3.08□□□□□ -1.92
RBM39-232ENST00000481037 MRGPRFQ96AM1 343 aa3.08□□□□□ -1.92
RBM39-232ENST00000481037 CIB1Q99828 191 aa3.08□□□□□ -1.92
RBM39-232ENST00000481037 C20orf85Q9H1P6 137 aa3.08□□□□□ -1.92
RBM39-232ENST00000481037 SH3BGRL3Q9H299 93 aa3.08□□□□□ -1.92
RBM39-232ENST00000481037 ANXA10Q9UJ72 324 aa3.08□□□□□ -1.92
RBM39-232ENST00000481037 SSR3Q9UNL2 185 aa3.08□□□□□ -1.92
RBM39-232ENST00000481037 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 512.1 ms