RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477529.1

SRRT-210, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 540 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-210ENST00000477529 LINC00467Q9BRT7 94 aa9.95□□□□□ -0.82
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SRRT-210ENST00000477529 ZNF680Q8NEM1 530 aa9.94□□□□□ -0.82
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SRRT-210ENST00000477529 C18orf15Q96N68 181 aa9.87□□□□□ -0.83
SRRT-210ENST00000477529 NDFIP1Q9BT67 221 aa9.87□□□□□ -0.83
SRRT-210ENST00000477529 NAGKQ9UJ70 344 aa9.87□□□□□ -0.83
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SRRT-210ENST00000477529 TRAV21A0A0B4J279 112 aa9.86□□□□□ -0.83
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SRRT-210ENST00000477529 DPPA3Q6W0C5 159 aa9.86□□□□□ -0.83
SRRT-210ENST00000477529 PRNTQ86SH4 94 aa9.86□□□□□ -0.83
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SRRT-210ENST00000477529 LINC00479Q96M42 142 aa9.86□□□□□ -0.83
SRRT-210ENST00000477529 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
SRRT-210ENST00000477529 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
SRRT-210ENST00000477529 MDFICQ9P1T7 246 aa9.86□□□□□ -0.83
SRRT-210ENST00000477529 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa9.86□□□□□ -0.83
SRRT-210ENST00000477529 TRGV11A0A075B6L2 103 aa9.85□□□□□ -0.83
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