RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	NMB	P08949	121 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SSR4-208	ENST00000471880	STAG3L2	P0CL84	134 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SSR4-208	ENST00000471880	STAG3L3	P0CL85	134 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SSR4-208	ENST00000471880	GCHFR	P30047	84 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SSR4-208	ENST00000471880	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SSR4-208	ENST00000471880		Q6ZQT7	251 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SSR4-208	ENST00000471880	SGK494	Q96LW2	274 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SSR4-208	ENST00000471880	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SSR4-208	ENST00000471880	NACA	E9PAV3	2078 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SSR4-208	ENST00000471880		A0A0J9YY99	117 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
SSR4-208	ENST00000471880		Q6ZTI0	123 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SSR4-208	ENST00000471880	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SSR4-208	ENST00000471880	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SSR4-208	ENST00000471880		F6UZH7	168 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SSR4-208	ENST00000471880		K7EQM0	130 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF415	Q09FC8	603 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SSR4-208	ENST00000471880	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SSR4-208	ENST00000471880	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SSR4-208	ENST00000471880	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SSR4-208	ENST00000471880	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SSR4-208	ENST00000471880	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SSR4-208	ENST00000471880	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SSR4-208	ENST00000471880		G3V3Q6	166 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SSR4-208	ENST00000471880	TAAR5	O14804	337 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SSR4-208	ENST00000471880	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SSR4-208	ENST00000471880	UBE2G2	P60604	165 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SSR4-208	ENST00000471880	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SSR4-208	ENST00000471880	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SSR4-208	ENST00000471880	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SSR4-208	ENST00000471880	SSX7	Q7RTT5	188 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SSR4-208	ENST00000471880	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SSR4-208	ENST00000471880	TREM1	Q9NP99	234 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SSR4-208	ENST00000471880	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SSR4-208	ENST00000471880	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SSR4-208	ENST00000471880	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SSR4-208	ENST00000471880	IFNA7	P01567	189 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SSR4-208	ENST00000471880	IGHV3-53	P01767	116 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SSR4-208	ENST00000471880	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SSR4-208	ENST00000471880	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SSR4-208	ENST00000471880	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SSR4-208	ENST00000471880	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SSR4-208	ENST00000471880	TCL1A	P56279	114 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SSR4-208	ENST00000471880	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
SSR4-208	ENST00000471880	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		10.38	□□□□□ -0.75
SSR4-208	ENST00000471880	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		10.38	□□□□□ -0.75
SSR4-208	ENST00000471880	TCRA	P04437	139 aa		10.38	□□□□□ -0.75
SSR4-208	ENST00000471880	HOXA5	P20719	270 aa		10.38	□□□□□ -0.75
SSR4-208	ENST00000471880	CCL18	P55774	89 aa		10.38	□□□□□ -0.75
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF726P1	Q15940	193 aa		10.38	□□□□□ -0.75
SSR4-208	ENST00000471880	RNF212	Q495C1	297 aa		10.38	□□□□□ -0.75
SSR4-208	ENST00000471880	PRNT	Q86SH4	94 aa		10.38	□□□□□ -0.75
SSR4-208	ENST00000471880	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		10.38	□□□□□ -0.75
SSR4-208	ENST00000471880	TMED6	Q8WW62	240 aa		10.38	□□□□□ -0.75
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
SSR4-208	ENST00000471880	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		10.37	□□□□□ -0.75
SSR4-208	ENST00000471880	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		10.37	□□□□□ -0.75
SSR4-208	ENST00000471880	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		10.37	□□□□□ -0.75
SSR4-208	ENST00000471880	GGTLC3	B5MD39	225 aa		10.37	□□□□□ -0.75
SSR4-208	ENST00000471880	PFDN1	O60925	122 aa		10.37	□□□□□ -0.75
SSR4-208	ENST00000471880	ZFP69	Q49AA0	526 aa		10.37	□□□□□ -0.75
SSR4-208	ENST00000471880		Q6AWC8	147 aa		10.37	□□□□□ -0.75
SSR4-208	ENST00000471880	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		10.37	□□□□□ -0.75
SSR4-208	ENST00000471880	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		10.37	□□□□□ -0.75
SSR4-208	ENST00000471880	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		10.37	□□□□□ -0.75
SSR4-208	ENST00000471880	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		10.37	□□□□□ -0.75
SSR4-208	ENST00000471880	EPDR1	Q9UM22	224 aa		10.37	□□□□□ -0.75
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1B0GV50	99 aa		10.36	□□□□□ -0.75
SSR4-208	ENST00000471880	SPINK4	O60575	86 aa		10.36	□□□□□ -0.75
SSR4-208	ENST00000471880	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
SSR4-208	ENST00000471880	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		10.36	□□□□□ -0.75
SSR4-208	ENST00000471880	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		10.36	□□□□□ -0.75
SSR4-208	ENST00000471880	STOML3	Q8TAV4	291 aa		10.36	□□□□□ -0.75
SSR4-208	ENST00000471880	C8orf49	Q96NF6	230 aa		10.36	□□□□□ -0.75
SSR4-208	ENST00000471880	PSG8	Q9UQ74	426 aa		10.36	□□□□□ -0.75
SSR4-208	ENST00000471880		A0A0D9SG52	128 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF345	Q14585	488 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SSR4-208	ENST00000471880	TVP23C	Q96ET8	276 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SSR4-208	ENST00000471880	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SSR4-208	ENST00000471880	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SSR4-208	ENST00000471880	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1W2PRE2	83 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SSR4-208	ENST00000471880	BCL2L11	O43521	198 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SSR4-208	ENST00000471880	GNRH2	O43555	120 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SSR4-208	ENST00000471880	GCG	P01275	180 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SSR4-208	ENST00000471880	PPT1	P50897	306 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SSR4-208	ENST00000471880	CST9LP1	Q5W188	147 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SSR4-208	ENST00000471880	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SSR4-208	ENST00000471880	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SSR4-208	ENST00000471880	SUN5	Q8TC36	379 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SSR4-208	ENST00000471880	HMSD	A8MTL9	139 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SSR4-208	ENST00000471880	PAX4	O43316	350 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SSR4-208	ENST00000471880	FHIT	P49789	147 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SSR4-208	ENST00000471880	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SSR4-208	ENST00000471880	SMUG1	Q53HV7	270 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SSR4-208	ENST00000471880	KCNS1	Q96KK3	526 aa		10.33	□□□□□ -0.76

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 298.8 ms