RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MUC21Q5SSG8 566 aa10.78□□□□□ -0.68
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR1L4Q8NGR5 311 aa10.78□□□□□ -0.68
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RAB2BQ8WUD1 216 aa10.78□□□□□ -0.68
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RMI2Q96E14 147 aa10.78□□□□□ -0.68
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PFDN5Q99471 154 aa10.78□□□□□ -0.68
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PAXXQ9BUH6 204 aa10.78□□□□□ -0.68
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GGACTQ9BVM4 153 aa10.78□□□□□ -0.68
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SH3BGRL3Q9H299 93 aa10.78□□□□□ -0.68
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AAMDCQ9H7C9 122 aa10.78□□□□□ -0.68
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SSSCA1O60232 199 aa10.77□□□□□ -0.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RAB31Q13636 194 aa10.77□□□□□ -0.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRADC1Q9BSG0 188 aa10.77□□□□□ -0.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GTSF1LQ9H1H1 148 aa10.77□□□□□ -0.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GGTLC3B5MD39 225 aa10.76□□□□□ -0.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NDUFB4O95168 129 aa10.76□□□□□ -0.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SFT2D2O95562 160 aa10.76□□□□□ -0.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM183BQ1AE95 376 aa10.76□□□□□ -0.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM159AQ6UWV7 190 aa10.76□□□□□ -0.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM183AQ8IXX5 376 aa10.76□□□□□ -0.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MGST2Q99735 147 aa10.76□□□□□ -0.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa10.75□□□□□ -0.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 M0R2P5 195 aa10.75□□□□□ -0.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAUP35544 74 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CAMLGP49069 296 aa10.75□□□□□ -0.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF138P52744 262 aa10.75□□□□□ -0.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BAK1Q16611 211 aa10.75□□□□□ -0.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM122CQ6P4D5 195 aa10.75□□□□□ -0.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC25A29Q8N8R3 303 aa10.75□□□□□ -0.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM14CQ9P0S9 112 aa10.75□□□□□ -0.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa10.74□□□□□ -0.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TSC22D2O75157 780 aa10.74□□□□□ -0.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TAS2R30P59541 319 aa10.74□□□□□ -0.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF266Q14584 549 aa10.74□□□□□ -0.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RHOHQ15669 191 aa10.74□□□□□ -0.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa10.74□□□□□ -0.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa10.73□□□□□ -0.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CTDSP2O14595 271 aa10.73□□□□□ -0.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CIDEAO60543 219 aa10.73□□□□□ -0.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PPP1R1AQ13522 171 aa10.73□□□□□ -0.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 VWC2Q2TAL6 325 aa10.73□□□□□ -0.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DIRAS2Q96HU8 199 aa10.73□□□□□ -0.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RPH3ALQ9UNE2 315 aa10.73□□□□□ -0.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 Q6AWC8 147 aa10.72□□□□□ -0.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa10.72□□□□□ -0.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SOSTQ9BQB4 213 aa10.72□□□□□ -0.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SEC11BP0C7V7 166 aa10.71□□□□□ -0.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CTF1Q16619 201 aa10.71□□□□□ -0.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C14orf177Q52M58 125 aa10.71□□□□□ -0.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MIC13Q5XKP0 118 aa10.71□□□□□ -0.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NRARPQ7Z6K4 114 aa10.71□□□□□ -0.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 Q8N3U1 123 aa10.71□□□□□ -0.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa10.71□□□□□ -0.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 Q8TAT8 98 aa10.71□□□□□ -0.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC39A9Q9NUM3 307 aa10.71□□□□□ -0.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa10.7□□□□□ -0.7
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ATP6V1G2O95670 118 aa10.7□□□□□ -0.7
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR10J4P0C629 311 aa10.7□□□□□ -0.7
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARL16Q0P5N6 197 aa10.7□□□□□ -0.7
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR51M1Q9H341 326 aa10.7□□□□□ -0.7
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DPH3P1Q9H4G8 78 aa10.7□□□□□ -0.7
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TNXBP22105 4242 aa10.69□□□□□ -0.7
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A0D9SG52 128 aa10.69□□□□□ -0.7
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PYYP10082 97 aa10.69□□□□□ -0.7
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FFAR4Q5NUL3 377 aa10.69□□□□□ -0.7
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MCFD2Q8NI22 146 aa10.69□□□□□ -0.7
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ATP5SQ99766 215 aa10.69□□□□□ -0.7
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RBAKDNA6NC62 111 aa10.68□□□□□ -0.7
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RPL29P47914 159 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AP3S2P59780 193 aa10.68□□□□□ -0.7
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NAGKQ9UJ70 344 aa10.68□□□□□ -0.7
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LENEPQ9Y5L5 61 aa10.68□□□□□ -0.7
RFX3-AS1-201ENST00000423112 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa10.68□□□□□ -0.7
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GAS8-AS1O95177 125 aa10.67□□□□□ -0.7
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SCGB1D2O95969 90 aa10.67□□□□□ -0.7
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C2orf50Q96LR7 162 aa10.67□□□□□ -0.7
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C20orf85Q9H1P6 137 aa10.67□□□□□ -0.7
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A087WWC5 75 aa10.66□□□□□ -0.7
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C5orf51A6NDU8 294 aa10.66□□□□□ -0.7
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GNRH2O43555 120 aa10.66□□□□□ -0.7
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MGST1P10620 155 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CSN1S1P47710 185 aa10.66□□□□□ -0.7
RFX3-AS1-201ENST00000423112 WDR83OSQ9Y284 106 aa10.66□□□□□ -0.7
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NBEAP1P0C6P0 100 aa10.65□□□□□ -0.7
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CFAP126Q5VTH2 177 aa10.65□□□□□ -0.7
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UQCC1Q9NVA1 299 aa10.65□□□□□ -0.7
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C9orf170A2RU37 121 aa10.64□□□□□ -0.71
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C7orf66A4D0T2 115 aa10.64□□□□□ -0.71
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF876PQ49A33 203 aa10.64□□□□□ -0.71
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TOMM5Q8N4H5 51 aa10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.5 ms