RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411398.1

RNU6-1052P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1052, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1052P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1052P-201ENST00000411398 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa-2.01□□□□□ -2.73
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TRIOO75962 3097 aa-2.01□□□□□ -2.73
RNU6-1052P-201ENST00000411398 LRP6O75581 1613 aa-2.01□□□□□ -2.73
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ARL5CA6NH57 179 aa-2.01□□□□□ -2.73
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ORM1P02763 201 aa-2.01□□□□□ -2.73
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RPL5P46777 297 aaKnown RBP-2.01□□□□□ -2.73
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PIGPP57054 158 aa-2.01□□□□□ -2.73
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP-2.01□□□□□ -2.73
RNU6-1052P-201ENST00000411398 HIST1H3AP68431 136 aa-2.01□□□□□ -2.73
RNU6-1052P-201ENST00000411398 KLRD1Q13241 179 aa-2.01□□□□□ -2.73
RNU6-1052P-201ENST00000411398 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP-2.01□□□□□ -2.73
RNU6-1052P-201ENST00000411398 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa-2.01□□□□□ -2.73
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CLEC2AQ6UVW9 174 aa-2.01□□□□□ -2.73
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SERPINB11Q96P15 392 aa-2.01□□□□□ -2.73
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ATG5Q9H1Y0 275 aa-2.01□□□□□ -2.73
RNU6-1052P-201ENST00000411398 IFT172Q9UG01 1749 aa-2.01□□□□□ -2.73
RNU6-1052P-201ENST00000411398 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP-2.01□□□□□ -2.73
RNU6-1052P-201ENST00000411398 FAM135BQ49AJ0 1406 aa-2.01□□□□□ -2.73
RNU6-1052P-201ENST00000411398 FMN1Q68DA7 1419 aa-2.01□□□□□ -2.73
RNU6-1052P-201ENST00000411398 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa-2.01□□□□□ -2.73
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ERCC6L2Q5T890 1561 aa-2.02□□□□□ -2.73
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP-2.02□□□□□ -2.73
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa-2.02□□□□□ -2.73
RNU6-1052P-201ENST00000411398 A0A1B0GW15 77 aa-2.02□□□□□ -2.73
RNU6-1052P-201ENST00000411398 FTCDNL1E5RQL4 147 aa-2.02□□□□□ -2.73
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MKRN2OSH3BPM6 223 aa-2.02□□□□□ -2.73
RNU6-1052P-201ENST00000411398 IFNA4P05014 189 aa-2.02□□□□□ -2.73
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CCKP06307 115 aa-2.02□□□□□ -2.73
RNU6-1052P-201ENST00000411398 OR5G3P0C626 314 aa-2.02□□□□□ -2.73
RNU6-1052P-201ENST00000411398 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP-2.02□□□□□ -2.73
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ATP5J2P56134 94 aa-2.02□□□□□ -2.73
RNU6-1052P-201ENST00000411398 UBE2BP63146 152 aa-2.02□□□□□ -2.73
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP-2.02□□□□□ -2.73
RNU6-1052P-201ENST00000411398 VMA21Q3ZAQ7 101 aa-2.02□□□□□ -2.73
RNU6-1052P-201ENST00000411398 LYRM7Q5U5X0 104 aa-2.02□□□□□ -2.73
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP-2.02□□□□□ -2.73
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP-2.02□□□□□ -2.73
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa-2.02□□□□□ -2.73
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa-2.03□□□□□ -2.73
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RAB19A4D1S5 217 aa-2.03□□□□□ -2.73
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NPFFO15130 113 aa-2.03□□□□□ -2.73
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CRYZL1O95825 349 aa-2.03□□□□□ -2.73
RNU6-1052P-201ENST00000411398 GALP22466 123 aa-2.03□□□□□ -2.73
RNU6-1052P-201ENST00000411398 DNAJB13P59910 316 aa-2.03□□□□□ -2.73
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RSU1Q15404 277 aa-2.03□□□□□ -2.73
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP-2.03□□□□□ -2.73
RNU6-1052P-201ENST00000411398 LYPD5Q6UWN5 251 aa-2.03□□□□□ -2.73
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP-2.03□□□□□ -2.73
RNU6-1052P-201ENST00000411398 DEFB105AQ8NG35 78 aa-2.03□□□□□ -2.73
RNU6-1052P-201ENST00000411398 OR8J3Q8NGG0 315 aa-2.03□□□□□ -2.73
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CCDC90BQ9GZT6 254 aa-2.03□□□□□ -2.73
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MAP1LC3AQ9H492 121 aa-2.03□□□□□ -2.73
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ROBO3Q96MS0 1386 aa-2.03□□□□□ -2.73
RNU6-1052P-201ENST00000411398 LRRC37A2A6NM11 1700 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-1052P-201ENST00000411398 DEGS1O15121 323 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-1052P-201ENST00000411398 BIRC5O15392 142 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ATP6V1G2O95670 118 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-1052P-201ENST00000411398 STAG3L2P0CL84 134 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ANXA8P13928 327 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-1052P-201ENST00000411398 IDO1P14902 403 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SLAMF1Q13291 335 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ANXA8L1Q5VT79 327 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-1052P-201ENST00000411398 OR6V1Q8N148 313 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ANKRD29Q8N6D5 301 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-1052P-201ENST00000411398 OR4S1Q8NGB4 309 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NPCDR1Q9BY65 106 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-1052P-201ENST00000411398 C1orf109Q9NX04 203 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CEP164Q9UPV0 1460 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-1052P-201ENST00000411398 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NRXN2Q9P2S2 1712 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1052P-201ENST00000411398 H0YGG7 62 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1052P-201ENST00000411398 K7EP34 96 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ATP5HO75947 161 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1052P-201ENST00000411398 STAG3L3P0CL85 134 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CAPZBP47756 277 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PSME3P61289 254 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NAA20P61599 178 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TMED1Q13445 227 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PMAIP1Q13794 54 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RHOHQ15669 191 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1052P-201ENST00000411398 Q5VV11 94 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CLEC6AQ6EIG7 209 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1052P-201ENST00000411398 GPATCH11Q8N954 259 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TMEM229BQ8NBD8 167 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SMIM19Q96E16 107 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TVP23BQ9NYZ1 205 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1052P-201ENST00000411398 VPS29Q9UBQ0 182 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1052P-201ENST00000411398 GAPVD1Q14C86 1478 aa-2.06□□□□□ -2.74
RNU6-1052P-201ENST00000411398 KIF27Q86VH2 1401 aa-2.06□□□□□ -2.74
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NSD3Q9BZ95 1437 aa-2.06□□□□□ -2.74
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa-2.06□□□□□ -2.74
RNU6-1052P-201ENST00000411398 H0YJX3 145 aa-2.06□□□□□ -2.74
RNU6-1052P-201ENST00000411398 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP-2.06□□□□□ -2.74
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP-2.06□□□□□ -2.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.7 ms