RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa10.53□□□□□ -0.72
CSAG1-201ENST00000361211 LINC00612Q8N6U2 182 aa10.53□□□□□ -0.72
CSAG1-201ENST00000361211 TVP23CQ96ET8 276 aa10.53□□□□□ -0.72
CSAG1-201ENST00000361211 SGK494Q96LW2 274 aa10.53□□□□□ -0.72
CSAG1-201ENST00000361211 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa10.53□□□□□ -0.72
CSAG1-201ENST00000361211 LENEPQ9Y5L5 61 aa10.53□□□□□ -0.72
CSAG1-201ENST00000361211 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa10.52□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 A0A0D9SG52 128 aa10.52□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 CBY3A6NI87 242 aa10.52□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 SNURFLB1AK76 121 aa10.52□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 F6UZH7 168 aa10.52□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 RGS13O14921 159 aa10.52□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 FHITP49789 147 aa10.52□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 C5orf17Q8NAS9 161 aa10.52□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 TMED6Q8WW62 240 aa10.52□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa10.51□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 GAGE12BA1L429 117 aa10.51□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 F5H768 121 aa10.51□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 GAGE7O76087 117 aa10.51□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 TCRAP04437 139 aa10.51□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 ATP5G1P05496 136 aa10.51□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 GAGE12FP0CL80 117 aa10.51□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 GAGE12GP0CL81 117 aa10.51□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 GAGE12IP0CL82 117 aa10.51□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 ATP5G3P48201 142 aa10.51□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 UBE2G2P60604 165 aa10.51□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 MUC21Q5SSG8 566 aa10.51□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 Q6AWC8 147 aa10.51□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF680Q8NEM1 530 aa10.51□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 FAM210BQ96KR6 192 aa10.51□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 KLF12Q9Y4X4 402 aa10.51□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa10.5□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 TCL1AP56279 114 aa10.5□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 Q6ZTI0 123 aa10.5□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 TMUB2Q71RG4 321 aa10.5□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 TCTE3Q8IZS6 198 aa10.5□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa10.5□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 EPDR1Q9UM22 224 aa10.5□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa10.49□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 A0A1W2PRE2 83 aa10.49□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 IGLV2-11P01706 119 aa10.49□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 SEC11BP0C7V7 166 aa10.49□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 C8orf49Q96NF6 230 aa10.49□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 TREM1Q9NP99 234 aa10.49□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa10.48□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 FAM74A7A6NL05 159 aa10.48□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa10.48□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 PSG8Q9UQ74 426 aa10.48□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa10.47□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 SPINK4O60575 86 aa10.47□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 PFDN1O60925 122 aa10.47□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 HOXA5P20719 270 aa10.47□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 FAM213BQ8TBF2 198 aa10.47□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 LINC00479Q96M42 142 aa10.47□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 ATG101Q9BSB4 218 aa10.47□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 MDFICQ9P1T7 246 aa10.47□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 NAGKQ9UJ70 344 aa10.47□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 TRAV34A0A0B4J273 112 aa10.46□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 P0DMU3 169 aa10.46□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 FAM231AP0DMU4 169 aa10.46□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 FAM231CP0DMU5 169 aa10.46□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 TPT1P13693 172 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF415Q09FC8 603 aa10.46□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM183BQ1AE95 376 aa10.46□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 PRNTQ86SH4 94 aa10.46□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM183AQ8IXX5 376 aa10.46□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM75Q8N9X5 138 aa10.46□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
CSAG1-201ENST00000361211 DNAH2Q9P225 4427 aa10.45□□□□□ -0.74
CSAG1-201ENST00000361211 TRAV21A0A0B4J279 112 aa10.45□□□□□ -0.74
CSAG1-201ENST00000361211 A0A1B0GV50 99 aa10.45□□□□□ -0.74
CSAG1-201ENST00000361211 K7EQM0 130 aa10.45□□□□□ -0.74
CSAG1-201ENST00000361211 PEX7O00628 323 aa10.45□□□□□ -0.74
CSAG1-201ENST00000361211 IFNA7P01567 189 aa10.45□□□□□ -0.74
CSAG1-201ENST00000361211 C1QBP02746 253 aa10.45□□□□□ -0.74
CSAG1-201ENST00000361211 OR5I1Q13606 314 aa10.45□□□□□ -0.74
CSAG1-201ENST00000361211 FAM159AQ6UWV7 190 aa10.45□□□□□ -0.74
CSAG1-201ENST00000361211 POM121L12Q8N7R1 296 aa10.45□□□□□ -0.74
CSAG1-201ENST00000361211 C15orf53Q8NAA6 179 aa10.45□□□□□ -0.74
CSAG1-201ENST00000361211 STOML3Q8TAV4 291 aa10.45□□□□□ -0.74
CSAG1-201ENST00000361211 NDFIP1Q9BT67 221 aa10.45□□□□□ -0.74
CSAG1-201ENST00000361211 FRAS1Q86XX4 4008 aa10.45□□□□□ -0.74
CSAG1-201ENST00000361211 TRGV11A0A075B6L2 103 aa10.44□□□□□ -0.74
CSAG1-201ENST00000361211 TRGV2A0A075B6R0 118 aa10.44□□□□□ -0.74
CSAG1-201ENST00000361211 UMAD1C9J7I0 102 aa10.44□□□□□ -0.74
CSAG1-201ENST00000361211 GNRH2O43555 120 aa10.44□□□□□ -0.74
CSAG1-201ENST00000361211 NUDT3O95989 172 aa10.44□□□□□ -0.74
CSAG1-201ENST00000361211 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
CSAG1-201ENST00000361211 TDRG1Q3Y452 100 aa10.44□□□□□ -0.74
CSAG1-201ENST00000361211 MBD3L1Q8WWY6 194 aa10.44□□□□□ -0.74
CSAG1-201ENST00000361211 C11orf21Q9P2W6 132 aa10.44□□□□□ -0.74
CSAG1-201ENST00000361211 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 126.1 ms