RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 TMEM18Q96B42 140 aa13.5□□□□□ -0.25
ACTB-201ENST00000331789 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa13.49□□□□□ -0.25
ACTB-201ENST00000331789 MUC21A0A140T8X8 626 aa13.49□□□□□ -0.25
ACTB-201ENST00000331789 RPS20P60866 119 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
ACTB-201ENST00000331789 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
ACTB-201ENST00000331789 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
ACTB-201ENST00000331789 MUC21Q5SSG8 566 aa13.49□□□□□ -0.25
ACTB-201ENST00000331789 Q6AWC8 147 aa13.49□□□□□ -0.25
ACTB-201ENST00000331789 Q6ZQT7 251 aa13.49□□□□□ -0.25
ACTB-201ENST00000331789 DCANP1Q8TF63 244 aa13.49□□□□□ -0.25
ACTB-201ENST00000331789 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
ACTB-201ENST00000331789 NIT2Q9NQR4 276 aa13.49□□□□□ -0.25
ACTB-201ENST00000331789 PCP4L1A6NKN8 68 aa13.49□□□□□ -0.25
ACTB-201ENST00000331789 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa13.49□□□□□ -0.25
ACTB-201ENST00000331789 CDPF1Q6NVV7 123 aa13.49□□□□□ -0.25
ACTB-201ENST00000331789 LINC00477Q96M19 166 aa13.49□□□□□ -0.25
ACTB-201ENST00000331789 RCHY1Q96PM5 261 aa13.49□□□□□ -0.25
ACTB-201ENST00000331789 DUX3Q96PT4 197 aa13.49□□□□□ -0.25
ACTB-201ENST00000331789 MS4A6AQ9H2W1 248 aa13.49□□□□□ -0.25
ACTB-201ENST00000331789 C11orf21Q9P2W6 132 aa13.49□□□□□ -0.25
ACTB-201ENST00000331789 MYO9AB2RTY4 2548 aa13.48□□□□□ -0.25
ACTB-201ENST00000331789 ESDP10768 282 aa13.48□□□□□ -0.25
ACTB-201ENST00000331789 TFPI2P48307 235 aa13.48□□□□□ -0.25
ACTB-201ENST00000331789 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
ACTB-201ENST00000331789 PRR9Q5T870 116 aa13.48□□□□□ -0.25
ACTB-201ENST00000331789 C18orf32Q8TCD1 76 aa13.48□□□□□ -0.25
ACTB-201ENST00000331789 C2orf70A6NJV1 201 aa13.47□□□□□ -0.25
ACTB-201ENST00000331789 LINC01559Q495D7 138 aa13.47□□□□□ -0.25
ACTB-201ENST00000331789 OR8A1Q8NGG7 326 aa13.47□□□□□ -0.25
ACTB-201ENST00000331789 BORCS7Q96B45 105 aa13.47□□□□□ -0.25
ACTB-201ENST00000331789 J3KRW8 73 aa13.47□□□□□ -0.25
ACTB-201ENST00000331789 IGLC6P0CF74 106 aa13.47□□□□□ -0.25
ACTB-201ENST00000331789 ID1P41134 155 aa13.47□□□□□ -0.25
ACTB-201ENST00000331789 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa13.47□□□□□ -0.25
ACTB-201ENST00000331789 OR11H1Q8NG94 326 aa13.47□□□□□ -0.25
ACTB-201ENST00000331789 C4orf3Q8WVX3 66 aa13.47□□□□□ -0.25
ACTB-201ENST00000331789 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa13.46□□□□□ -0.25
ACTB-201ENST00000331789 LINC01619G3V211 115 aa13.46□□□□□ -0.25
ACTB-201ENST00000331789 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa13.46□□□□□ -0.25
ACTB-201ENST00000331789 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
ACTB-201ENST00000331789 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa13.45□□□□□ -0.26
ACTB-201ENST00000331789 OR1N2Q8NGR9 330 aa13.45□□□□□ -0.26
ACTB-201ENST00000331789 LENEPQ9Y5L5 61 aa13.45□□□□□ -0.26
ACTB-201ENST00000331789 A0A1B0GW15 77 aa13.45□□□□□ -0.26
ACTB-201ENST00000331789 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa13.45□□□□□ -0.26
ACTB-201ENST00000331789 GATD1Q8NB37 220 aa13.45□□□□□ -0.26
ACTB-201ENST00000331789 DPF1Q92782 380 aa13.45□□□□□ -0.26
ACTB-201ENST00000331789 CTRLP40313 264 aa13.44□□□□□ -0.26
ACTB-201ENST00000331789 FAM19A4Q96LR4 140 aa13.44□□□□□ -0.26
ACTB-201ENST00000331789 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
ACTB-201ENST00000331789 PAFAH1B2P68402 229 aa13.43□□□□□ -0.26
ACTB-201ENST00000331789 C11orf44Q8N8P7 122 aa13.43□□□□□ -0.26
ACTB-201ENST00000331789 K7EQG2 157 aa13.43□□□□□ -0.26
ACTB-201ENST00000331789 LY6G6DO95868 133 aa13.43□□□□□ -0.26
ACTB-201ENST00000331789 ZNF688P0C7X2 276 aa13.43□□□□□ -0.26
ACTB-201ENST00000331789 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
ACTB-201ENST00000331789 SAMD13Q5VXD3 122 aa13.43□□□□□ -0.26
ACTB-201ENST00000331789 KCNS1Q96KK3 526 aa13.43□□□□□ -0.26
ACTB-201ENST00000331789 TMEM160Q9NX00 188 aa13.43□□□□□ -0.26
ACTB-201ENST00000331789 KIR3DS1Q14943 382 aa13.42□□□□□ -0.26
ACTB-201ENST00000331789 PSMG4Q5JS54 123 aa13.42□□□□□ -0.26
ACTB-201ENST00000331789 ZNF493Q6ZR52 646 aa13.42□□□□□ -0.26
ACTB-201ENST00000331789 SAMD10Q9BYL1 202 aa13.42□□□□□ -0.26
ACTB-201ENST00000331789 GPX1P07203 203 aa13.41□□□□□ -0.26
ACTB-201ENST00000331789 CD28P10747 220 aa13.41□□□□□ -0.26
ACTB-201ENST00000331789 CD33P20138 364 aa13.41□□□□□ -0.26
ACTB-201ENST00000331789 NTF3P20783 257 aa13.41□□□□□ -0.26
ACTB-201ENST00000331789 SCGB2A2Q13296 93 aa13.41□□□□□ -0.26
ACTB-201ENST00000331789 TWIST1Q15672 202 aa13.41□□□□□ -0.26
ACTB-201ENST00000331789 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
ACTB-201ENST00000331789 MSRB1Q9NZV6 116 aa13.41□□□□□ -0.26
ACTB-201ENST00000331789 M0QZ24 198 aa13.41□□□□□ -0.26
ACTB-201ENST00000331789 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
ACTB-201ENST00000331789 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
ACTB-201ENST00000331789 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
ACTB-201ENST00000331789 A0A1W2PRX2 142 aa13.4□□□□□ -0.26
ACTB-201ENST00000331789 PMCHP20382 165 aa13.4□□□□□ -0.26
ACTB-201ENST00000331789 Q6ZWC4 215 aa13.4□□□□□ -0.26
ACTB-201ENST00000331789 LINC01006Q8NI28 216 aa13.4□□□□□ -0.26
ACTB-201ENST00000331789 WFDC12Q8WWY7 111 aa13.4□□□□□ -0.26
ACTB-201ENST00000331789 MTORP42345 2549 aa13.4□□□□□ -0.26
ACTB-201ENST00000331789 HILS1P60008 231 aa13.39□□□□□ -0.27
ACTB-201ENST00000331789 NIT1Q86X76 327 aa13.39□□□□□ -0.27
ACTB-201ENST00000331789 FAM19A2Q8N3H0 131 aa13.39□□□□□ -0.27
ACTB-201ENST00000331789 OR9G4Q8NGQ1 327 aa13.39□□□□□ -0.27
ACTB-201ENST00000331789 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa13.39□□□□□ -0.27
ACTB-201ENST00000331789 C16orf95Q9H693 158 aa13.39□□□□□ -0.27
ACTB-201ENST00000331789 NAGKQ9UJ70 344 aa13.39□□□□□ -0.27
ACTB-201ENST00000331789 CUBNO60494 3623 aa13.39□□□□□ -0.27
ACTB-201ENST00000331789 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
ACTB-201ENST00000331789 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
ACTB-201ENST00000331789 AMN1Q8IY45 258 aa13.39□□□□□ -0.27
ACTB-201ENST00000331789 RAX2Q96IS3 184 aa13.39□□□□□ -0.27
ACTB-201ENST00000331789 TRAV21A0A0B4J279 112 aa13.38□□□□□ -0.27
ACTB-201ENST00000331789 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
ACTB-201ENST00000331789 AMTP48728 403 aa13.38□□□□□ -0.27
ACTB-201ENST00000331789 FAM104BQ5XKR9 115 aa13.38□□□□□ -0.27
ACTB-201ENST00000331789 APRG1Q8IVJ8 170 aa13.38□□□□□ -0.27
ACTB-201ENST00000331789 CNFNQ9BYD5 112 aa13.38□□□□□ -0.27
ACTB-201ENST00000331789 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 259.8 ms