RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589252.5

ATP5A1-208, Transcript of ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, human

TSL 5

Gene ATP5A1, Length 662 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP5A1-208	ENST00000589252	NUDT3	O95989	172 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ATP5A1-208	ENST00000589252	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
ATP5A1-208	ENST00000589252	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ATP5A1-208	ENST00000589252	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ATP5A1-208	ENST00000589252	PAXX	Q9BUH6	204 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ATP5A1-208	ENST00000589252	MBD2	Q9UBB5	411 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ATP5A1-208	ENST00000589252	FUT9	Q9Y231	359 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ATP5A1-208	ENST00000589252	SNURFL	B1AK76	121 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ATP5A1-208	ENST00000589252	RTL8C	O15255	209 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ATP5A1-208	ENST00000589252	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
ATP5A1-208	ENST00000589252	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ATP5A1-208	ENST00000589252	BTN1A1	Q13410	526 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ATP5A1-208	ENST00000589252	FXYD5	Q96DB9	178 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ATP5A1-208	ENST00000589252	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ATP5A1-208	ENST00000589252	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ATP5A1-208	ENST00000589252	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ATP5A1-208	ENST00000589252	ATG101	Q9BSB4	218 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ATP5A1-208	ENST00000589252	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ATP5A1-208	ENST00000589252	GAGE12B	A1L429	117 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ATP5A1-208	ENST00000589252	KLLN	B2CW77	178 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ATP5A1-208	ENST00000589252	OR7C2	O60412	319 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ATP5A1-208	ENST00000589252	GAGE7	O76087	117 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ATP5A1-208	ENST00000589252	GAGE12F	P0CL80	117 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ATP5A1-208	ENST00000589252	GAGE12G	P0CL81	117 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ATP5A1-208	ENST00000589252	GAGE12I	P0CL82	117 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ATP5A1-208	ENST00000589252	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
ATP5A1-208	ENST00000589252	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ATP5A1-208	ENST00000589252		Q6ZR54	194 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ATP5A1-208	ENST00000589252	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ATP5A1-208	ENST00000589252	RNF141	Q8WVD5	230 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ATP5A1-208	ENST00000589252	BATF3	Q9NR55	127 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ATP5A1-208	ENST00000589252	CD300C	Q08708	224 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ATP5A1-208	ENST00000589252	LINC00477	Q96M19	166 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ATP5A1-208	ENST00000589252	VGLL1	Q99990	258 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ATP5A1-208	ENST00000589252	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATP5A1-208	ENST00000589252	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ATP5A1-208	ENST00000589252	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATP5A1-208	ENST00000589252	PRR9	Q5T870	116 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATP5A1-208	ENST00000589252	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATP5A1-208	ENST00000589252	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATP5A1-208	ENST00000589252	ZNF503	Q96F45	646 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATP5A1-208	ENST00000589252	ALG5	Q9Y673	324 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATP5A1-208	ENST00000589252		A0A1B0GVY2	172 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ATP5A1-208	ENST00000589252	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	13.62	□□□□□ -0.23
ATP5A1-208	ENST00000589252	IFNA5	P01569	189 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ATP5A1-208	ENST00000589252	CRISP2	P16562	243 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ATP5A1-208	ENST00000589252	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
ATP5A1-208	ENST00000589252	OR5I1	Q13606	314 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ATP5A1-208	ENST00000589252		Q8TAT8	98 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ATP5A1-208	ENST00000589252	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ATP5A1-208	ENST00000589252	GPX1	P07203	203 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ATP5A1-208	ENST00000589252	HOXA5	P20719	270 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ATP5A1-208	ENST00000589252		Q6ZTI0	123 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ATP5A1-208	ENST00000589252	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ATP5A1-208	ENST00000589252	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ATP5A1-208	ENST00000589252	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ATP5A1-208	ENST00000589252	WFDC1	Q9HC57	220 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ATP5A1-208	ENST00000589252	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ATP5A1-208	ENST00000589252	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ATP5A1-208	ENST00000589252	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
ATP5A1-208	ENST00000589252	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
ATP5A1-208	ENST00000589252	KHDC3L	Q587J8	217 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ATP5A1-208	ENST00000589252		Q6ZQT7	251 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ATP5A1-208	ENST00000589252	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
ATP5A1-208	ENST00000589252	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ATP5A1-208	ENST00000589252		Q9H3A6	140 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ATP5A1-208	ENST00000589252	ZNF492	Q9P255	531 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ATP5A1-208	ENST00000589252		A0A0J9YY99	117 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ATP5A1-208	ENST00000589252	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ATP5A1-208	ENST00000589252	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ATP5A1-208	ENST00000589252	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ATP5A1-208	ENST00000589252	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ATP5A1-208	ENST00000589252	M6PR	P20645	277 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ATP5A1-208	ENST00000589252	CSN1S1	P47710	185 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ATP5A1-208	ENST00000589252	ZNF138	P52744	262 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ATP5A1-208	ENST00000589252	CCL18	P55774	89 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ATP5A1-208	ENST00000589252	TAS2R45	P59539	299 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ATP5A1-208	ENST00000589252	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ATP5A1-208	ENST00000589252	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ATP5A1-208	ENST00000589252	RGS13	O14921	159 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ATP5A1-208	ENST00000589252	NMB	P08949	121 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ATP5A1-208	ENST00000589252	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ATP5A1-208	ENST00000589252	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ATP5A1-208	ENST00000589252	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ATP5A1-208	ENST00000589252	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ATP5A1-208	ENST00000589252	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ATP5A1-208	ENST00000589252	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATP5A1-208	ENST00000589252	PTTG1	O95997	202 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATP5A1-208	ENST00000589252	TCL1A	P56279	114 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATP5A1-208	ENST00000589252	RAB2A	P61019	212 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATP5A1-208	ENST00000589252	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATP5A1-208	ENST00000589252	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATP5A1-208	ENST00000589252	RYR1	P21817	5038 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATP5A1-208	ENST00000589252	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATP5A1-208	ENST00000589252	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ATP5A1-208	ENST00000589252	SSX7	Q7RTT5	188 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATP5A1-208	ENST00000589252	HYLS1	Q96M11	299 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATP5A1-208	ENST00000589252	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATP5A1-208	ENST00000589252	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATP5A1-208	ENST00000589252	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		13.54	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.3 ms