RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565362.5

PDXDC1-211, Transcript of pyridoxal dependent decarboxylase domain containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene PDXDC1, Length 720 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDXDC1-211ENST00000565362 UPK3BQ9BT76 320 aa7.45□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 Q9H8V8 135 aa7.45□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 C7orf71A4D174 169 aa7.44□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 PYYP10082 97 aa7.44□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 CRISP2P16562 243 aa7.44□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 ERCC8Q13216 396 aa7.44□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa7.44□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 GCSAMLQ5JQS6 135 aa7.44□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa7.44□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 C11orf72Q8NBR9 251 aa7.44□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa7.44□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 NPCDR1Q9BY65 106 aa7.44□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa7.44□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 A0A0J9YY99 117 aa7.43□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 NMBP08949 121 aa7.43□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 NHLH2Q02577 135 aa7.43□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 ASAH1Q13510 395 aa7.43□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 ESRGQ1W209 222 aa7.43□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 MZT2BQ6NZ67 158 aa7.43□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 Q6ZTI0 123 aa7.43□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 ZNF680Q8NEM1 530 aa7.43□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 SLC25A2Q9BXI2 301 aa7.43□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 TIMM9Q9Y5J7 89 aa7.43□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 A0A1W2PPQ1 181 aa7.42□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 BTF3P20290 206 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 CD300CQ08708 224 aa7.42□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 BTN1A1Q13410 526 aa7.42□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 TTC32Q5I0X7 151 aa7.42□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa7.42□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 OR5C1Q8NGR4 320 aa7.42□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 S100ZQ8WXG8 99 aa7.42□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 VSIG2Q96IQ7 327 aa7.42□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa7.42□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 NMES1Q9C002 83 aa7.42□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 Q9H3A6 140 aa7.42□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa7.42□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa7.42□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 C16orf90A8MZG2 172 aa7.41□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 E5RGE8 158 aa7.41□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 H0YIZ8 118 aa7.41□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 SPINK4O60575 86 aa7.41□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 CDK2AP2O75956 126 aa7.41□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 SIX6O95475 246 aa7.41□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 NBEAP1P0C6P0 100 aa7.41□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 ICAM4Q14773 271 aa7.41□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 MIR17HGQ75NE6 70 aa7.41□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa7.41□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 THAP6Q8TBB0 222 aa7.41□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 BLNKQ8WV28 456 aa7.41□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.41□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 SLC25A31Q9H0C2 315 aa7.41□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 OR51M1Q9H341 326 aa7.41□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 AAMDCQ9H7C9 122 aa7.41□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 OR5AC2Q9NZP5 309 aa7.41□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 ZNF492Q9P255 531 aa7.41□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 A0A096LPF7 62 aa7.4□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa7.4□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 GPX1P07203 203 aa7.4□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 TCL1AP56279 114 aa7.4□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 TMEM78Q5T7P6 136 aa7.4□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 PRR9Q5T870 116 aa7.4□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 FXYD5Q96DB9 178 aa7.4□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 VGLL1Q99990 258 aa7.4□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 FUT9Q9Y231 359 aa7.4□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 KLF12Q9Y4X4 402 aa7.4□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 FAT1Q14517 4588 aa7.39□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 TRGV2A0A075B6R0 118 aa7.39□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa7.39□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 PRAF2O60831 178 aa7.39□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 UPK1BO75841 260 aa7.39□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 CYCSP99999 105 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 FAM122CQ6P4D5 195 aa7.39□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 Q6ZQT7 251 aa7.39□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 ENKURQ8TC29 256 aa7.39□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 PAXXQ9BUH6 204 aa7.39□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 KCNIP2Q9NS61 270 aa7.39□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa7.38□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 ZNF138P52744 262 aa7.38□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 IFITM3Q01628 133 aa7.38□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 LYPD1Q8N2G4 141 aa7.38□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 PHYHIPLQ96FC7 376 aa7.38□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 ST6GAL2Q96JF0 529 aa7.38□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa7.38□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 RBAKDNA6NC62 111 aa7.37□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 C17orf112F2Z3M2 114 aa7.37□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa7.37□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 RGS13O14921 159 aa7.37□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 OR10J4P0C629 311 aa7.37□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 H2BFSP57053 126 aa7.37□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa7.37□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 SPATA12Q7Z6I5 190 aa7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.1 ms