RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 CENPXA8MT69 81 aa11.6□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 KLLNB2CW77 178 aa11.6□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 CCSO14618 274 aa11.6□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 MPDU1O75352 247 aa11.6□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 CST7O76096 145 aa11.6□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 IFNA5P01569 189 aa11.6□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 GPX1P07203 203 aa11.6□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 CAV2P51636 162 aa11.6□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 TCL1AP56279 114 aa11.6□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 ZNF846Q147U1 533 aa11.6□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 NFE4Q86UQ8 179 aa11.6□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 ST6GAL2Q96JF0 529 aa11.6□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa11.6□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 UQCC1Q9NVA1 299 aa11.6□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 TIMM9Q9Y5J7 89 aa11.6□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 FAM25EA8MYX2 175 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 LYPD5Q6UWN5 251 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 FRZBQ92765 325 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 FAM19A4Q96LR4 140 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 C20orf85Q9H1P6 137 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 SLC39A9Q9NUM3 307 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 PRO0255Q9UI72 69 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 PRELID1Q9Y255 219 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 WDR83OSQ9Y284 106 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 FAM24AA6NFZ4 105 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 RGS13O14921 159 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 DNAH10OSP0CZ25 163 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 RPL29P47914 159 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 BAXQ07812 192 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 Q5VSD8 79 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 BLNKQ8WV28 456 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 HHLA3Q9XRX5 114 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 A0A087WTM6 91 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 PRAF2O60831 178 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 NDUFB4O95168 129 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 PYYP10082 97 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 BTCP35070 178 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 CRYBA4P53673 196 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 SLAQ13239 276 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 C8orf49Q96NF6 230 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 ARPC5LQ9BPX5 153 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 TMEM14CQ9P0S9 112 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 CRISP2P16562 243 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 KRTAP10-1P60331 282 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 CNPY1Q3B7I2 92 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 TMEM78Q5T7P6 136 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 AAMDCQ9H7C9 122 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 LY96Q9Y6Y9 160 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 C5orf51A6NDU8 294 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 S100A11P31949 105 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 PDE6HQ13956 83 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 FHL2Q14192 279 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 ICAM4Q14773 271 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 VWC2Q2TAL6 325 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 PRR9Q5T870 116 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 Q6ZQT7 251 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 NEGR1Q7Z3B1 354 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 VGLL1Q99990 258 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 E5RGE8 158 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 NMBP08949 121 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 FGF7P21781 194 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 SULT1A1P50225 295 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 FAM122CQ6P4D5 195 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 S100A10P60903 97 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 ZNF415Q09FC8 603 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 C11orf1Q9H5F2 150 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 MSRB1Q9NZV6 116 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 ZNF492Q9P255 531 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-214ENST00000548849 IGSF23A1L1A6 192 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-214ENST00000548849 EVI2AP22794 236 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-214ENST00000548849 SRIP30626 198 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-214ENST00000548849 HBG1P69891 147 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-214ENST00000548849 HBG2P69892 147 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-214ENST00000548849 GCSAMLQ5JQS6 135 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-214ENST00000548849 STX12Q86Y82 276 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-214ENST00000548849 TMEM252Q8N6L7 170 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-214ENST00000548849 CHAC2Q8WUX2 184 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-214ENST00000548849 C2orf50Q96LR7 162 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-214ENST00000548849 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
CS-214ENST00000548849 K7EQD1 137 aa11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 197 ms