RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527224.1

PACS1-205, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene PACS1, Length 3,024 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-205ENST00000527224 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PACS1-205ENST00000527224 FOLR3P41439 243 aa14.58□□□□□ -0.08
PACS1-205ENST00000527224 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.08
PACS1-205ENST00000527224 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PACS1-205ENST00000527224 PLEKHB2Q96CS7 222 aa14.58□□□□□ -0.08
PACS1-205ENST00000527224 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PACS1-205ENST00000527224 Q8TAT8 98 aa14.57□□□□□ -0.08
PACS1-205ENST00000527224 RAB9BQ9NP90 201 aa14.57□□□□□ -0.08
PACS1-205ENST00000527224 ATP5LO75964 103 aa14.57□□□□□ -0.08
PACS1-205ENST00000527224 RNF185Q96GF1 192 aa14.57□□□□□ -0.08
PACS1-205ENST00000527224 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PACS1-205ENST00000527224 VKORC1Q9BQB6 163 aa14.56□□□□□ -0.08
PACS1-205ENST00000527224 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa14.55□□□□□ -0.08
PACS1-205ENST00000527224 CGB3P0DN86 165 aa14.55□□□□□ -0.08
PACS1-205ENST00000527224 CGB7P0DN87 165 aa14.55□□□□□ -0.08
PACS1-205ENST00000527224 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
PACS1-205ENST00000527224 Q6ZS92 163 aa14.55□□□□□ -0.08
PACS1-205ENST00000527224 AAMDCQ9H7C9 122 aa14.55□□□□□ -0.08
PACS1-205ENST00000527224 TMEM78Q5T7P6 136 aa14.55□□□□□ -0.08
PACS1-205ENST00000527224 MYOZ3Q8TDC0 251 aa14.55□□□□□ -0.08
PACS1-205ENST00000527224 RAXQ9Y2V3 346 aa14.55□□□□□ -0.08
PACS1-205ENST00000527224 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa14.55□□□□□ -0.08
PACS1-205ENST00000527224 TMEM262E9PQX1 116 aa14.55□□□□□ -0.08
PACS1-205ENST00000527224 CFIP05156 583 aa14.55□□□□□ -0.08
PACS1-205ENST00000527224 IGHV1-2P23083 117 aa14.55□□□□□ -0.08
PACS1-205ENST00000527224 TRGV9Q99603 122 aa14.55□□□□□ -0.08
PACS1-205ENST00000527224 RASL11BQ9BPW5 248 aa14.55□□□□□ -0.08
PACS1-205ENST00000527224 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PACS1-205ENST00000527224 SRRM5B3KS81 715 aa14.54□□□□□ -0.08
PACS1-205ENST00000527224 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PACS1-205ENST00000527224 UBE2D3P61077 147 aa14.54□□□□□ -0.08
PACS1-205ENST00000527224 UBE2D2P62837 147 aa14.54□□□□□ -0.08
PACS1-205ENST00000527224 SIT1Q9Y3P8 196 aa14.54□□□□□ -0.08
PACS1-205ENST00000527224 LOC400499M0QZD8 3231 aa14.54□□□□□ -0.08
PACS1-205ENST00000527224 C9JAW5 83 aa14.54□□□□□ -0.08
PACS1-205ENST00000527224 K7ESF4 209 aa14.54□□□□□ -0.08
PACS1-205ENST00000527224 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PACS1-205ENST00000527224 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa14.54□□□□□ -0.08
PACS1-205ENST00000527224 TTTY12Q9BZ98 90 aa14.53□□□□□ -0.08
PACS1-205ENST00000527224 ONECUT1Q9UBC0 465 aa14.53□□□□□ -0.08
PACS1-205ENST00000527224 TRBV19A0A075B6N1 114 aa14.53□□□□□ -0.08
PACS1-205ENST00000527224 ZNF815PA8K554 130 aa14.53□□□□□ -0.08
PACS1-205ENST00000527224 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa14.53□□□□□ -0.08
PACS1-205ENST00000527224 ROS1P08922 2347 aa14.53□□□□□ -0.08
PACS1-205ENST00000527224 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa14.52□□□□□ -0.08
PACS1-205ENST00000527224 H7C2G1 150 aa14.52□□□□□ -0.08
PACS1-205ENST00000527224 FAM216BQ8N7L0 139 aa14.52□□□□□ -0.08
PACS1-205ENST00000527224 OR11H6Q8NGC7 330 aa14.52□□□□□ -0.08
PACS1-205ENST00000527224 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
PACS1-205ENST00000527224 PSMG4Q5JS54 123 aa14.52□□□□□ -0.08
PACS1-205ENST00000527224 IGFL4Q6B9Z1 124 aa14.52□□□□□ -0.08
PACS1-205ENST00000527224 CHCHD5Q9BSY4 110 aa14.52□□□□□ -0.08
PACS1-205ENST00000527224 DEFB127Q9H1M4 99 aa14.52□□□□□ -0.08
PACS1-205ENST00000527224 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PACS1-205ENST00000527224 SLC25A20O43772 301 aa14.51□□□□□ -0.09
PACS1-205ENST00000527224 ORM1P02763 201 aa14.51□□□□□ -0.09
PACS1-205ENST00000527224 CCL13Q99616 98 aa14.51□□□□□ -0.09
PACS1-205ENST00000527224 PATE3B3GLJ2 98 aa14.51□□□□□ -0.09
PACS1-205ENST00000527224 SPRY3O43610 288 aa14.51□□□□□ -0.09
PACS1-205ENST00000527224 TMEM155Q4W5P6 130 aa14.51□□□□□ -0.09
PACS1-205ENST00000527224 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PACS1-205ENST00000527224 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PACS1-205ENST00000527224 NGBQ9NPG2 151 aa14.51□□□□□ -0.09
PACS1-205ENST00000527224 MGAQ8IWI9 3026 aa14.51□□□□□ -0.09
PACS1-205ENST00000527224 FCN3O75636 299 aa14.5□□□□□ -0.09
PACS1-205ENST00000527224 S4R3C0 116 aa14.5□□□□□ -0.09
PACS1-205ENST00000527224 NCOR1O75376 2440 aa14.5□□□□□ -0.09
PACS1-205ENST00000527224 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa14.5□□□□□ -0.09
PACS1-205ENST00000527224 J3KRW8 73 aa14.5□□□□□ -0.09
PACS1-205ENST00000527224 C15orf53Q8NAA6 179 aa14.5□□□□□ -0.09
PACS1-205ENST00000527224 PRADC1Q9BSG0 188 aa14.5□□□□□ -0.09
PACS1-205ENST00000527224 VCX2Q9H322 139 aa14.5□□□□□ -0.09
PACS1-205ENST00000527224 U3KQA8 63 aa14.5□□□□□ -0.09
PACS1-205ENST00000527224 ZZEF1O43149 2961 aa14.5□□□□□ -0.09
PACS1-205ENST00000527224 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa14.5□□□□□ -0.09
PACS1-205ENST00000527224 ENSAO43768 121 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PACS1-205ENST00000527224 UBE2D1P51668 147 aa14.5□□□□□ -0.09
PACS1-205ENST00000527224 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PACS1-205ENST00000527224 SLC25A16P16260 332 aa14.49□□□□□ -0.09
PACS1-205ENST00000527224 MED13Q9UHV7 2174 aa14.49□□□□□ -0.09
PACS1-205ENST00000527224 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa14.49□□□□□ -0.09
PACS1-205ENST00000527224 THBDP07204 575 aa14.49□□□□□ -0.09
PACS1-205ENST00000527224 MSMPQ1L6U9 139 aa14.49□□□□□ -0.09
PACS1-205ENST00000527224 NDUFA11Q86Y39 141 aa14.49□□□□□ -0.09
PACS1-205ENST00000527224 LPAL2Q16609 132 aa14.48□□□□□ -0.09
PACS1-205ENST00000527224 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa14.48□□□□□ -0.09
PACS1-205ENST00000527224 CCL3L1P16619 93 aa14.48□□□□□ -0.09
PACS1-205ENST00000527224 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
PACS1-205ENST00000527224 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa14.48□□□□□ -0.09
PACS1-205ENST00000527224 RASL10AQ92737 203 aa14.48□□□□□ -0.09
PACS1-205ENST00000527224 TPRP12270 2363 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
PACS1-205ENST00000527224 GPR179Q6PRD1 2367 aa14.48□□□□□ -0.09
PACS1-205ENST00000527224 TRGV3P03979 118 aa14.47□□□□□ -0.09
PACS1-205ENST00000527224 CD7P09564 240 aa14.47□□□□□ -0.09
PACS1-205ENST00000527224 CECR9P0C854 216 aa14.47□□□□□ -0.09
PACS1-205ENST00000527224 PLNP26678 52 aa14.47□□□□□ -0.09
PACS1-205ENST00000527224 DTX2Q86UW9 622 aa14.47□□□□□ -0.09
PACS1-205ENST00000527224 EMP1P54849 157 aa14.47□□□□□ -0.09
PACS1-205ENST00000527224 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa14.47□□□□□ -0.09
PACS1-205ENST00000527224 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
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