RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 NPIPB6E9PJ23 425 aa5.66□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 C17orf112F2Z3M2 114 aa5.66□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 MPDU1O75352 247 aa5.66□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP5.66□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 UPK1BO75841 260 aa5.66□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 IGHV3-53P01767 116 aa5.66□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 CD300CQ08708 224 aa5.66□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 VWC2Q2TAL6 325 aa5.66□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 Q6ZTI0 123 aa5.66□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 SCGB1C1Q8TD33 95 aa5.66□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 HYLS1Q96M11 299 aa5.66□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 C20orf144Q9BQM9 153 aa5.66□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 PAXXQ9BUH6 204 aa5.66□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 SLC25A2Q9BXI2 301 aa5.66□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa5.66□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 OR51M1Q9H341 326 aa5.66□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa5.66□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa5.66□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 LINC00588Q9Y4M8 146 aa5.66□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 ABCA13Q86UQ4 5058 aa5.66□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa5.65□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 NDUFB4O95168 129 aa5.65□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 IFNA5P01569 189 aa5.65□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 NBEAP1P0C6P0 100 aa5.65□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 M6PRP20645 277 aa5.65□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 CSN1S1P47710 185 aa5.65□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 DEFA1P59665 94 aa5.65□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 DEFA3P59666 94 aa5.65□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 RANP62826 216 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 CYCSP99999 105 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 FFAR4Q5NUL3 377 aa5.65□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 MUC21Q5SSG8 566 aa5.65□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 Q6ZR54 194 aa5.65□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF575Q86XF7 245 aa5.65□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 Q8TAT8 98 aa5.65□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 LINC00477Q96M19 166 aa5.65□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 VGLL1Q99990 258 aa5.65□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 ARPC5LQ9BPX5 153 aa5.65□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 PYGO2Q9BRQ0 406 aa5.65□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 KCNIP2Q9NS61 270 aa5.65□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM14CQ9P0S9 112 aa5.65□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 PRELID1Q9Y255 219 aa5.65□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 A0A096LPF7 62 aa5.64□□□□□ -1.51
CTPS1-209ENST00000480420 A0A1B0GVY2 172 aa5.64□□□□□ -1.51
CTPS1-209ENST00000480420 H0YIZ8 118 aa5.64□□□□□ -1.51
CTPS1-209ENST00000480420 PRAF2O60831 178 aa5.64□□□□□ -1.51
CTPS1-209ENST00000480420 HOXA5P20719 270 aa5.64□□□□□ -1.51
CTPS1-209ENST00000480420 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
CTPS1-209ENST00000480420 TNP2Q05952 138 aa5.64□□□□□ -1.51
CTPS1-209ENST00000480420 IL15RAQ13261 267 aa5.64□□□□□ -1.51
CTPS1-209ENST00000480420 C6orf223Q8N319 242 aa5.64□□□□□ -1.51
CTPS1-209ENST00000480420 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF680Q8NEM1 530 aa5.64□□□□□ -1.51
CTPS1-209ENST00000480420 ZNRF2Q8NHG8 242 aa5.64□□□□□ -1.51
CTPS1-209ENST00000480420 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa5.64□□□□□ -1.51
CTPS1-209ENST00000480420 NMES1Q9C002 83 aa5.64□□□□□ -1.51
CTPS1-209ENST00000480420 Q9H8V8 135 aa5.64□□□□□ -1.51
CTPS1-209ENST00000480420 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
CTPS1-209ENST00000480420 NAGKQ9UJ70 344 aa5.64□□□□□ -1.51
CTPS1-209ENST00000480420 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa5.64□□□□□ -1.51
CTPS1-209ENST00000480420 FUT9Q9Y231 359 aa5.64□□□□□ -1.51
CTPS1-209ENST00000480420 KLF12Q9Y4X4 402 aa5.64□□□□□ -1.51
CTPS1-209ENST00000480420 PKHD1P08F94 4074 aa5.64□□□□□ -1.51
CTPS1-209ENST00000480420 C16orf90A8MZG2 172 aa5.63□□□□□ -1.51
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF253O75346 499 aa5.63□□□□□ -1.51
CTPS1-209ENST00000480420 LORP23490 312 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
CTPS1-209ENST00000480420 H2BFSP57053 126 aa5.63□□□□□ -1.51
CTPS1-209ENST00000480420 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
CTPS1-209ENST00000480420 IFITM3Q01628 133 aa5.63□□□□□ -1.51
CTPS1-209ENST00000480420 PDE6HQ13956 83 aa5.63□□□□□ -1.51
CTPS1-209ENST00000480420 Q6ZQT7 251 aa5.63□□□□□ -1.51
CTPS1-209ENST00000480420 RXFP4Q8TDU9 374 aa5.63□□□□□ -1.51
CTPS1-209ENST00000480420 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
CTPS1-209ENST00000480420 PHYHIPLQ96FC7 376 aa5.63□□□□□ -1.51
CTPS1-209ENST00000480420 ODF3Q96PU9 254 aa5.63□□□□□ -1.51
CTPS1-209ENST00000480420 ATP5SQ99766 215 aa5.63□□□□□ -1.51
CTPS1-209ENST00000480420 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
CTPS1-209ENST00000480420 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa5.63□□□□□ -1.51
CTPS1-209ENST00000480420 MBD2Q9UBB5 411 aa5.63□□□□□ -1.51
CTPS1-209ENST00000480420 VPS13DQ5THJ4 4388 aa5.63□□□□□ -1.51
CTPS1-209ENST00000480420 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa5.62□□□□□ -1.51
CTPS1-209ENST00000480420 A0A1W2PPV4 95 aa5.62□□□□□ -1.51
CTPS1-209ENST00000480420 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
CTPS1-209ENST00000480420 PAX4O43316 350 aa5.62□□□□□ -1.51
CTPS1-209ENST00000480420 MPC2O95563 127 aa5.62□□□□□ -1.51
CTPS1-209ENST00000480420 PET100P0DJ07 73 aa5.62□□□□□ -1.51
CTPS1-209ENST00000480420 MED14OSP0DP75 135 aa5.62□□□□□ -1.51
CTPS1-209ENST00000480420 RPL12P30050 165 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF138P52744 262 aa5.62□□□□□ -1.51
CTPS1-209ENST00000480420 ESRGQ1W209 222 aa5.62□□□□□ -1.51
CTPS1-209ENST00000480420 PRR9Q5T870 116 aa5.62□□□□□ -1.51
CTPS1-209ENST00000480420 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa5.62□□□□□ -1.51
CTPS1-209ENST00000480420 LINC00299Q6ZSB3 139 aa5.62□□□□□ -1.51
CTPS1-209ENST00000480420 CMTM2Q8TAZ6 248 aa5.62□□□□□ -1.51
CTPS1-209ENST00000480420 FXYD5Q96DB9 178 aa5.62□□□□□ -1.51
CTPS1-209ENST00000480420 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa5.62□□□□□ -1.51
CTPS1-209ENST00000480420 C8orf49Q96NF6 230 aa5.62□□□□□ -1.51
CTPS1-209ENST00000480420 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
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