RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		10.55	□□□□□ -0.72
PTPA-222	ENST00000445241	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		10.55	□□□□□ -0.72
PTPA-222	ENST00000445241	NUPR2	A6NF83	97 aa		10.54	□□□□□ -0.72
PTPA-222	ENST00000445241	KLLN	B2CW77	178 aa		10.54	□□□□□ -0.72
PTPA-222	ENST00000445241	DIRC3	C9JPN6	131 aa		10.54	□□□□□ -0.72
PTPA-222	ENST00000445241		H7BYZ3	331 aa		10.54	□□□□□ -0.72
PTPA-222	ENST00000445241	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	10.54	□□□□□ -0.72
PTPA-222	ENST00000445241	TAS2R60	P59551	318 aa		10.54	□□□□□ -0.72
PTPA-222	ENST00000445241	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	10.54	□□□□□ -0.72
PTPA-222	ENST00000445241	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	10.54	□□□□□ -0.72
PTPA-222	ENST00000445241	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		10.54	□□□□□ -0.72
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF492	Q9P255	531 aa		10.54	□□□□□ -0.72
PTPA-222	ENST00000445241	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		10.53	□□□□□ -0.72
PTPA-222	ENST00000445241	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		10.53	□□□□□ -0.72
PTPA-222	ENST00000445241		A0A1W2PRE2	83 aa		10.53	□□□□□ -0.72
PTPA-222	ENST00000445241	PGP	A6NDG6	321 aa		10.53	□□□□□ -0.72
PTPA-222	ENST00000445241	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	10.53	□□□□□ -0.72
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF726P1	Q15940	193 aa		10.53	□□□□□ -0.72
PTPA-222	ENST00000445241	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		10.53	□□□□□ -0.72
PTPA-222	ENST00000445241	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	10.52	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	C11orf94	C9JXX5	98 aa		10.52	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	DEFB4A	O15263	64 aa		10.52	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	10.52	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF138	P52744	262 aa		10.52	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	ERCC8	Q13216	396 aa		10.52	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	10.52	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		10.52	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		10.52	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	SSX7	Q7RTT5	188 aa		10.52	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	VGLL1	Q99990	258 aa		10.52	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		10.52	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		10.52	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		10.51	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	C7orf71	A4D174	169 aa		10.51	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		10.51	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	CXorf65	A6NEN9	183 aa		10.51	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	10.51	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241		K7EQM0	130 aa		10.51	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	10.51	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	RAB5C	P51148	216 aa		10.51	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		10.51	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	SLC51B	Q86UW2	128 aa		10.51	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	LINC01587	Q99440	93 aa		10.51	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		10.51	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		10.51	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		10.51	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		10.51	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		10.51	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	10.51	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		10.5	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		10.5	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		10.5	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	C16orf74	Q96GX8	76 aa		10.5	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		10.49	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	GPX1	P07203	203 aa		10.49	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	FHIT	P49789	147 aa		10.49	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	ZFP69	Q49AA0	526 aa		10.49	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	DKK2	Q9UBU2	259 aa		10.49	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	LYRM9	A8MSI8	78 aa		10.48	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	GGTLC3	B5MD39	225 aa		10.48	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	TCRA	P04437	139 aa		10.48	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	PMS2P11	Q13670	270 aa		10.48	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		10.48	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		10.48	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		10.48	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	ATG101	Q9BSB4	218 aa		10.48	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	EPDR1	Q9UM22	224 aa		10.48	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	TENM2	Q9NT68	2774 aa		10.48	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		10.47	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	FAM74A7	A6NL05	159 aa		10.47	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	PPT1	P50897	306 aa		10.47	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	TCTA	P57738	103 aa		10.47	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	KIR3DS1	Q14943	382 aa		10.47	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		10.47	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		10.47	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		10.47	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	CELA1	Q9UNI1	258 aa		10.47	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		10.46	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		10.46	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		10.46	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	CD300C	Q08708	224 aa		10.46	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	C12orf74	Q32Q52	190 aa		10.46	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		10.46	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		10.46	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241		Q6AWC8	147 aa		10.46	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		10.46	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		10.46	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		10.46	□□□□□ -0.73

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.5 ms