RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429285.6

NCOR2-208, Transcript of nuclear receptor corepressor 2, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NCOR2, Length 8,475 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NCOR2-208	ENST00000429285	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		10.87	□□□□□ -0.67
NCOR2-208	ENST00000429285		A0A087WWL8	130 aa		10.87	□□□□□ -0.67
NCOR2-208	ENST00000429285		A0A1W2PPI3	338 aa		10.87	□□□□□ -0.67
NCOR2-208	ENST00000429285	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		10.87	□□□□□ -0.67
NCOR2-208	ENST00000429285	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
NCOR2-208	ENST00000429285	CRYBA4	P53673	196 aa		10.86	□□□□□ -0.67
NCOR2-208	ENST00000429285	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		10.86	□□□□□ -0.67
NCOR2-208	ENST00000429285	SMKR1	H3BMG3	65 aa		10.86	□□□□□ -0.67
NCOR2-208	ENST00000429285	EREG	O14944	169 aa		10.86	□□□□□ -0.67
NCOR2-208	ENST00000429285	CDKN1A	P38936	164 aa		10.86	□□□□□ -0.67
NCOR2-208	ENST00000429285	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		10.86	□□□□□ -0.67
NCOR2-208	ENST00000429285		A0A0A6YYD4	124 aa		10.86	□□□□□ -0.67
NCOR2-208	ENST00000429285	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		10.86	□□□□□ -0.67
NCOR2-208	ENST00000429285		F6UB75	175 aa		10.85	□□□□□ -0.67
NCOR2-208	ENST00000429285	CD24	P25063	80 aa		10.85	□□□□□ -0.67
NCOR2-208	ENST00000429285	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		10.85	□□□□□ -0.67
NCOR2-208	ENST00000429285		Q8TAT8	98 aa		10.85	□□□□□ -0.67
NCOR2-208	ENST00000429285	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	10.85	□□□□□ -0.67	2e-6	■■■□□ 15.6
NCOR2-208	ENST00000429285	HERVK_113	P63121	156 aa		10.85	□□□□□ -0.67
NCOR2-208	ENST00000429285	IL15RA	Q13261	267 aa		10.85	□□□□□ -0.67
NCOR2-208	ENST00000429285	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		10.85	□□□□□ -0.67
NCOR2-208	ENST00000429285	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		10.85	□□□□□ -0.67
NCOR2-208	ENST00000429285	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	10.85	□□□□□ -0.67
NCOR2-208	ENST00000429285	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	10.85	□□□□□ -0.67
NCOR2-208	ENST00000429285	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		10.85	□□□□□ -0.67
NCOR2-208	ENST00000429285	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	10.85	□□□□□ -0.67
NCOR2-208	ENST00000429285	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	10.85	□□□□□ -0.67
NCOR2-208	ENST00000429285	LYZL4	Q96KX0	146 aa		10.85	□□□□□ -0.67
NCOR2-208	ENST00000429285	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		10.85	□□□□□ -0.67
NCOR2-208	ENST00000429285	IGHV3-53	P01767	116 aa		10.85	□□□□□ -0.67
NCOR2-208	ENST00000429285	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		10.84	□□□□□ -0.67
NCOR2-208	ENST00000429285	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
NCOR2-208	ENST00000429285	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		10.84	□□□□□ -0.67
NCOR2-208	ENST00000429285	ORMDL1	Q9P0S3	153 aa		10.84	□□□□□ -0.67
NCOR2-208	ENST00000429285	MP68	P56378	58 aa		10.84	□□□□□ -0.67
NCOR2-208	ENST00000429285	NOTCH4	Q99466	2003 aa		10.84	□□□□□ -0.67
NCOR2-208	ENST00000429285	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		10.84	□□□□□ -0.67
NCOR2-208	ENST00000429285	KNCN	A6PVL3	124 aa		10.84	□□□□□ -0.67
NCOR2-208	ENST00000429285		H0YJW9	148 aa		10.84	□□□□□ -0.67
NCOR2-208	ENST00000429285	PFN2	P35080	140 aa		10.84	□□□□□ -0.67
NCOR2-208	ENST00000429285	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		10.83	□□□□□ -0.68
NCOR2-208	ENST00000429285	TMEM243	Q9BU79	118 aa		10.83	□□□□□ -0.68
NCOR2-208	ENST00000429285	RNF114	Q9Y508	228 aa		10.83	□□□□□ -0.68
NCOR2-208	ENST00000429285	RHOH	Q15669	191 aa		10.83	□□□□□ -0.68
NCOR2-208	ENST00000429285	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		10.83	□□□□□ -0.68
NCOR2-208	ENST00000429285	CELA3A	P09093	270 aa		10.83	□□□□□ -0.68
NCOR2-208	ENST00000429285	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		10.83	□□□□□ -0.68
NCOR2-208	ENST00000429285	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		10.83	□□□□□ -0.68
NCOR2-208	ENST00000429285	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		10.83	□□□□□ -0.68
NCOR2-208	ENST00000429285	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		10.83	□□□□□ -0.68
NCOR2-208	ENST00000429285	TIAF1	O95411	115 aa		10.83	□□□□□ -0.68
NCOR2-208	ENST00000429285	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		10.83	□□□□□ -0.68
NCOR2-208	ENST00000429285		H3BMG7	143 aa		10.82	□□□□□ -0.68
NCOR2-208	ENST00000429285	NPY	P01303	97 aa		10.82	□□□□□ -0.68
NCOR2-208	ENST00000429285	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		10.82	□□□□□ -0.68
NCOR2-208	ENST00000429285	CRYGS	P22914	178 aa		10.82	□□□□□ -0.68
NCOR2-208	ENST00000429285	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		10.82	□□□□□ -0.68
NCOR2-208	ENST00000429285	NDP	Q00604	133 aa		10.82	□□□□□ -0.68
NCOR2-208	ENST00000429285	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		10.82	□□□□□ -0.68
NCOR2-208	ENST00000429285	PIP4P2	Q8N4L2	257 aa		10.82	□□□□□ -0.68
NCOR2-208	ENST00000429285	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		10.82	□□□□□ -0.68
NCOR2-208	ENST00000429285	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		10.82	□□□□□ -0.68
NCOR2-208	ENST00000429285	HERV-K104	P63124	156 aa		10.82	□□□□□ -0.68
NCOR2-208	ENST00000429285	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		10.82	□□□□□ -0.68
NCOR2-208	ENST00000429285	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		10.82	□□□□□ -0.68
NCOR2-208	ENST00000429285	GAS1	P54826	345 aa		10.82	□□□□□ -0.68
NCOR2-208	ENST00000429285	SVIP	Q8NHG7	77 aa		10.82	□□□□□ -0.68
NCOR2-208	ENST00000429285	NTF4	P34130	210 aa		10.81	□□□□□ -0.68
NCOR2-208	ENST00000429285	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		10.81	□□□□□ -0.68
NCOR2-208	ENST00000429285	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		10.81	□□□□□ -0.68
NCOR2-208	ENST00000429285	GFI1	Q99684	422 aa		10.81	□□□□□ -0.68
NCOR2-208	ENST00000429285		B5MCH6	92 aa		10.81	□□□□□ -0.68
NCOR2-208	ENST00000429285	NPS	P0C0P6	89 aa		10.81	□□□□□ -0.68
NCOR2-208	ENST00000429285	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
NCOR2-208	ENST00000429285	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		10.81	□□□□□ -0.68
NCOR2-208	ENST00000429285	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		10.81	□□□□□ -0.68
NCOR2-208	ENST00000429285	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		10.81	□□□□□ -0.68
NCOR2-208	ENST00000429285	CFHR2	P36980	270 aa		10.81	□□□□□ -0.68
NCOR2-208	ENST00000429285	QRFP	P83859	136 aa		10.81	□□□□□ -0.68
NCOR2-208	ENST00000429285	CFHR4	Q92496	578 aa		10.81	□□□□□ -0.68
NCOR2-208	ENST00000429285	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		10.8	□□□□□ -0.68
NCOR2-208	ENST00000429285	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
NCOR2-208	ENST00000429285	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		10.8	□□□□□ -0.68
NCOR2-208	ENST00000429285	IGHV1-46	P01743	117 aa		10.8	□□□□□ -0.68
NCOR2-208	ENST00000429285	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		10.8	□□□□□ -0.68
NCOR2-208	ENST00000429285	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		10.8	□□□□□ -0.68
NCOR2-208	ENST00000429285	GATA3	P23771	443 aa		10.8	□□□□□ -0.68
NCOR2-208	ENST00000429285	SEC61G	P60059	68 aa		10.8	□□□□□ -0.68
NCOR2-208	ENST00000429285	ADCYAP1	P18509	176 aa		10.8	□□□□□ -0.68
NCOR2-208	ENST00000429285	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		10.8	□□□□□ -0.68
NCOR2-208	ENST00000429285	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
NCOR2-208	ENST00000429285	C15orf62	A8K5M9	175 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NCOR2-208	ENST00000429285	IGKV1-5	P01602	117 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NCOR2-208	ENST00000429285	RNF152	Q8N8N0	203 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NCOR2-208	ENST00000429285	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NCOR2-208	ENST00000429285	DEFB130B	P0DP73	79 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NCOR2-208	ENST00000429285	DEFB130A	P0DP74	79 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NCOR2-208	ENST00000429285	TMEM178B	H3BS89	294 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NCOR2-208	ENST00000429285	PDE6G	P18545	87 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NCOR2-208	ENST00000429285	CFHR1	Q03591	330 aa		10.79	□□□□□ -0.68

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