RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397023.5

PPARG-208, Transcript of peroxisome proliferator activated receptor gamma, human

TSL 5

Gene PPARG, Length 2,002 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPARG-208	ENST00000397023	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
PPARG-208	ENST00000397023	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PPARG-208	ENST00000397023	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.2
PPARG-208	ENST00000397023	LY6L	H3BQJ8	138 aa		7.52	□□□□□ -1.2
PPARG-208	ENST00000397023	NDUFA3	O95167	84 aa		7.52	□□□□□ -1.2
PPARG-208	ENST00000397023	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.2
PPARG-208	ENST00000397023	TCTA	P57738	103 aa		7.52	□□□□□ -1.2
PPARG-208	ENST00000397023	FXYD7	P58549	80 aa		7.52	□□□□□ -1.2
PPARG-208	ENST00000397023	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		7.52	□□□□□ -1.2
PPARG-208	ENST00000397023	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		7.52	□□□□□ -1.2
PPARG-208	ENST00000397023	PRSS33	Q8NF86	280 aa		7.52	□□□□□ -1.2
PPARG-208	ENST00000397023	FAM57A	Q8TBR7	257 aa		7.52	□□□□□ -1.2
PPARG-208	ENST00000397023	HIST1H4G	Q99525	98 aa		7.52	□□□□□ -1.2
PPARG-208	ENST00000397023	CAD	P27708	2225 aa		7.52	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		7.52	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023		K7ERJ3	54 aa		7.52	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	SLC25A16	P16260	332 aa		7.52	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	BSPH1	Q075Z2	132 aa		7.52	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		7.52	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		7.52	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		7.51	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		7.51	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		7.51	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		7.51	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	TMEM160	Q9NX00	188 aa		7.51	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		7.51	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	FRY	Q5TBA9	3013 aa		7.51	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	OR11H12	B2RN74	326 aa		7.51	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023		H7C1H1	209 aa		7.51	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	DTX2	Q86UW9	622 aa		7.51	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		7.51	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	DEFB124	Q8NES8	71 aa		7.51	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	OR11H1	Q8NG94	326 aa		7.51	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	OR11H2	Q8NH07	326 aa		7.51	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	MRAP2	Q96G30	205 aa		7.51	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		7.51	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		7.5	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		7.5	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		7.5	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023		F8VRH5	84 aa		7.5	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	PLXNB1	O43157	2135 aa		7.5	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	WFDC2	Q14508	124 aa		7.5	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		7.5	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		7.5	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		7.49	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		7.49	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		7.49	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	LINC01549	A6NIU2	74 aa		7.49	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023		H3BMG7	143 aa		7.49	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	TIMM23	O14925	209 aa		7.49	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		7.49	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	PRO0461	Q9UI25	63 aa		7.49	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		7.49	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	PLCE1	Q9P212	2302 aa		7.49	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023		B9A039	149 aa		7.49	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	APOM	O95445	188 aa		7.49	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	CKS1B	P61024	79 aa		7.49	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	KLRD1	Q13241	179 aa		7.49	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	SCGB2A2	Q13296	93 aa		7.49	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		7.49	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	ETDB	Q3ZM63	59 aa		7.49	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		7.49	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023		Q8TAT8	98 aa		7.49	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		7.49	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		7.49	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		7.49	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	DPM3	Q9P2X0	92 aa		7.49	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	COX7A1	P24310	79 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	PRRG2	O14669	202 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	NRAC	Q8N912	160 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	CACNA1H	O95180	2353 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	OOSP1	A8MZH6	123 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023		F8W735	103 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	ZNF575	Q86XF7	245 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	CFHR4	Q92496	578 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	C20orf78	Q9BR46	151 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PPARG-208	ENST00000397023	PPP1R17	O96001	155 aa		7.46	□□□□□ -1.22
PPARG-208	ENST00000397023	IGHG4	P01861	327 aa		7.46	□□□□□ -1.22
PPARG-208	ENST00000397023	FOXI1	Q12951	378 aa		7.46	□□□□□ -1.22
PPARG-208	ENST00000397023	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		7.46	□□□□□ -1.22
PPARG-208	ENST00000397023	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		7.46	□□□□□ -1.22
PPARG-208	ENST00000397023	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		7.46	□□□□□ -1.22
PPARG-208	ENST00000397023	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		7.46	□□□□□ -1.22
PPARG-208	ENST00000397023	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		7.46	□□□□□ -1.22
PPARG-208	ENST00000397023	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		7.46	□□□□□ -1.22
PPARG-208	ENST00000397023	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		7.46	□□□□□ -1.22

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