RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384109.1

RNU6-1029P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1029, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1029P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1029P-201ENST00000384109 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1029P-201ENST00000384109 PHBP35232 272 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1029P-201ENST00000384109 HBBP68871 147 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1029P-201ENST00000384109 NEDD8Q15843 81 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1029P-201ENST00000384109 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1029P-201ENST00000384109 C1orf140Q5VVS0 124 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1029P-201ENST00000384109 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1029P-201ENST00000384109 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1029P-201ENST00000384109 SSR3Q9UNL2 185 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1029P-201ENST00000384109 TPRKBQ9Y3C4 175 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1029P-201ENST00000384109 STAB1Q9NY15 2570 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1029P-201ENST00000384109 CELSR2Q9HCU4 2923 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1029P-201ENST00000384109 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1029P-201ENST00000384109 CST7O76096 145 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1029P-201ENST00000384109 EVI2AP22794 236 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1029P-201ENST00000384109 RPL35P42766 123 aaKnown RBP-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1029P-201ENST00000384109 FADDQ13158 208 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1029P-201ENST00000384109 SNCBQ16143 134 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1029P-201ENST00000384109 FKBP1CQ5VVH2 108 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1029P-201ENST00000384109 PLEKHB2Q96CS7 222 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1029P-201ENST00000384109 OR4C12Q96R67 309 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1029P-201ENST00000384109 OR2H1Q9GZK4 316 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1029P-201ENST00000384109 SH3BGRL3Q9H299 93 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1029P-201ENST00000384109 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1029P-201ENST00000384109 USH2AO75445 5202 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1029P-201ENST00000384109 RTL9Q8NET4 1388 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1029P-201ENST00000384109 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1029P-201ENST00000384109 TANC1Q9C0D5 1861 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1029P-201ENST00000384109 ATG12O94817 140 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1029P-201ENST00000384109 GYPBP06028 91 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1029P-201ENST00000384109 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1029P-201ENST00000384109 Q5BKY6 102 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1029P-201ENST00000384109 NUP35Q8NFH5 326 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1029P-201ENST00000384109 AP1S3Q96PC3 154 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1029P-201ENST00000384109 PBDC1Q9BVG4 233 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1029P-201ENST00000384109 POLQO75417 2590 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1029P-201ENST00000384109 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 TMED2Q15363 201 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 NEK7Q8TDX7 302 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 LINC00208Q96KT6 92 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 MCEEQ96PE7 176 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 RTL8AQ9BWD3 113 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 USP54Q70EL1 1684 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 DSPPQ9NZW4 1301 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 MT-ND6P03923 174 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 FABP4P15090 132 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 HSD11B1P28845 292 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 PPP1R2P41236 205 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 ZNF56Q15929 161 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 HACD4Q5VWC8 232 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 CCL4L1Q8NHW4 92 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 CEP19Q96LK0 163 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 PROK2Q9HC23 129 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 SPTBN4Q9H254 2564 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 HMCN2Q8NDA2 5059 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 RTL8BQ17RB0 113 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 OR5AK2Q8NH90 309 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 F8P00451 2351 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 ABCA1O95477 2261 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 MYH1P12882 1939 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 TMEM210A6NLX4 147 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 TRACP01848 142 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 CAPZBP47756 277 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 FXYD3Q14802 87 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 IZUMO2Q6UXV1 221 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 VMO1Q7Z5L0 202 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 DEFB132Q7Z7B7 95 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 CROCCP2Q86T23 111 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 OR4B1Q8NGF8 309 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 MYO7AQ13402 2215 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 JMJD1CQ15652 2540 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 A0A1W2PRS3 328 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 C5orf58C9J3I9 102 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 H3BQV1 296 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 IFNA1P01562 189 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 CSAG1Q6PB30 78 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 C5orf56Q8N8D9 126 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 TMEM229BQ8NBD8 167 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 OR13C6PQ8NH95 151 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 GINS3Q9BRX5 216 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 SS18L2Q9UHA2 77 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 UBR4Q5T4S7 5183 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 ABCA13Q86UQ4 5058 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 TNXBP22105 4242 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-1029P-201ENST00000384109 A0A1W2PPB8 328 aa-0.34□□□□□ -2.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.6 ms