RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 PRR25Q96S07 402 aa16.19■□□□□ 0.18
CCSAP-203ENST00000366687 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa16.19■□□□□ 0.18
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF726P1Q15940 193 aa16.18■□□□□ 0.18
CCSAP-203ENST00000366687 SPXQ9BT56 116 aa16.18■□□□□ 0.18
CCSAP-203ENST00000366687 TPSG1Q9NRR2 321 aa16.18■□□□□ 0.18
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF664Q8N3J9 261 aa16.18■□□□□ 0.18
CCSAP-203ENST00000366687 SS18Q15532 418 aa16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-203ENST00000366687 SIGMAR1Q99720 223 aa16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-203ENST00000366687 VOPP1Q96AW1 172 aa16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-203ENST00000366687 H3BRN7 92 aa16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-203ENST00000366687 IGLC1P0CG04 106 aa16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-203ENST00000366687 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-203ENST00000366687 KNCNA6PVL3 124 aa16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-203ENST00000366687 C2orf66Q6UXQ4 117 aa16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-203ENST00000366687 Q96MF0 132 aa16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-203ENST00000366687 ESDP10768 282 aa16.16■□□□□ 0.18
CCSAP-203ENST00000366687 C8orf49Q96NF6 230 aa16.16■□□□□ 0.18
CCSAP-203ENST00000366687 MED13Q9UHV7 2174 aa16.16■□□□□ 0.18
CCSAP-203ENST00000366687 A8MWP6 167 aa16.16■□□□□ 0.18
CCSAP-203ENST00000366687 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
CCSAP-203ENST00000366687 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa16.16■□□□□ 0.18
CCSAP-203ENST00000366687 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
CCSAP-203ENST00000366687 CUL9Q8IWT3 2517 aa16.16■□□□□ 0.18
CCSAP-203ENST00000366687 NOTCH4Q99466 2003 aa16.16■□□□□ 0.18
CCSAP-203ENST00000366687 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa16.15■□□□□ 0.18
CCSAP-203ENST00000366687 LEPROTO15243 131 aa16.15■□□□□ 0.18
CCSAP-203ENST00000366687 PLCE1Q9P212 2302 aa16.15■□□□□ 0.18
CCSAP-203ENST00000366687 DLEU1O43261 78 aa16.15■□□□□ 0.18
CCSAP-203ENST00000366687 CHAC1Q9BUX1 264 aa16.15■□□□□ 0.18
CCSAP-203ENST00000366687 HAPLN4Q86UW8 402 aa16.14■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 KIR3DS1Q14943 382 aa16.14■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa16.14■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa16.14■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 CDKN1BP46527 198 aa16.14■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 THAP8Q8NA92 274 aa16.14■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 C11orf52Q96A22 123 aa16.14■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 STPG4Q8N801 248 aa16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 Q8N8P6 123 aa16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 TSC2P49815 1807 aa16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 CD5LO43866 347 aa16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 V9GYV3 84 aa16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 C8orf31Q8N9H6 132 aa16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 MGAMO43451 1857 aa16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 NLRC5Q86WI3 1866 aa16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 WIPF3A6NGB9 483 aa16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 SLX1AQ9BQ83 275 aa16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 OVOL2Q9BRP0 275 aa16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 ELANEP08246 267 aa16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 C2orf82Q6UX34 121 aa16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 K7EM74 188 aa16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 IL15RAQ13261 267 aa16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM141Q96I45 108 aa16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 HELZP42694 1942 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 WDR81Q562E7 1941 aa16.11■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 NEGR1Q7Z3B1 354 aa16.11■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa16.11■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 KLK9Q9UKQ9 250 aa16.11■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 SDHAF1A6NFY7 115 aa16.11■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 C22orf46C9J442 243 aa16.11■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 PRR20EP86478 221 aa16.11■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 PRR20CP86479 221 aa16.11■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 PRR20DP86480 221 aa16.11■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 PRR20BP86481 221 aa16.11■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 PRR20AP86496 221 aa16.11■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 C20orf144Q9BQM9 153 aa16.11■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 SONP18583 2426 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 GAGE12JA6NER3 117 aa16.11■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 PSCAO43653 123 aa16.11■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 GAGE1Q13065 139 aa16.11■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 GAGE4Q13068 117 aa16.11■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 GAGE5Q13069 117 aa16.11■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 CSPG4Q6UVK1 2322 aa16.11■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 RNF138Q8WVD3 245 aa16.1■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa16.1■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 I3L3M4 83 aa16.1■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 GAGE2BQ13066 116 aa16.1■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 GAGE2EQ4V326 116 aa16.1■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 PRSS57Q6UWY2 283 aa16.1■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 GAGE2DQ9UEU5 116 aa16.1■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 A0A1B0GUS0 222 aa16.09■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 IGFL2Q6UWQ7 119 aa16.09■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 FXYD5Q96DB9 178 aa16.09■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF491Q8N8L2 437 aa16.09■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 PMVKQ15126 192 aa16.09■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 C11orf53Q8IXP5 236 aa16.09■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 ANAPC13Q9BS18 74 aa16.09■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa16.08■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 J3QKU1 62 aa16.08■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 MYO18BQ8IUG5 2567 aa16.08■□□□□ 0.17
CCSAP-203ENST00000366687 SHISA9B4DS77 424 aa16.08■□□□□ 0.16
CCSAP-203ENST00000366687 DAD1P61803 113 aa16.08■□□□□ 0.16
CCSAP-203ENST00000366687 PRSS33Q8NF86 280 aa16.08■□□□□ 0.16
CCSAP-203ENST00000366687 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa16.08■□□□□ 0.16
CCSAP-203ENST00000366687 SLAQ13239 276 aa16.08■□□□□ 0.16
CCSAP-203ENST00000366687 UBE2V1Q13404 147 aa16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52 ms