RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616449.1

ACSS3-208, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 3, human

Gene ACSS3, Length 3,833 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACSS3-208	ENST00000616449	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ACSS3-208	ENST00000616449	TOMM40	O96008	361 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ACSS3-208	ENST00000616449	IGLV2-23	P01705	113 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ACSS3-208	ENST00000616449	IGLV2-8	P01709	118 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ACSS3-208	ENST00000616449	IGLC2	P0DOY2	106 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ACSS3-208	ENST00000616449	IGLC3	P0DOY3	106 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ACSS3-208	ENST00000616449	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ACSS3-208	ENST00000616449	TMEM160	Q9NX00	188 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ACSS3-208	ENST00000616449	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ACSS3-208	ENST00000616449	FNDC10	F2Z333	226 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ACSS3-208	ENST00000616449	DLX6	P56179	175 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ACSS3-208	ENST00000616449	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ACSS3-208	ENST00000616449	METTL26	Q96S19	204 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ACSS3-208	ENST00000616449	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ACSS3-208	ENST00000616449	LRBA	P50851	2863 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ACSS3-208	ENST00000616449	IGKV1-17	P01599	117 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ACSS3-208	ENST00000616449	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
ACSS3-208	ENST00000616449	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
ACSS3-208	ENST00000616449	SH2D1A	O60880	128 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ACSS3-208	ENST00000616449	CR1L	Q2VPA4	569 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ACSS3-208	ENST00000616449	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ACSS3-208	ENST00000616449	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ACSS3-208	ENST00000616449	BMI1	P35226	326 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ACSS3-208	ENST00000616449	GTSF1	Q8WW33	167 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ACSS3-208	ENST00000616449	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ACSS3-208	ENST00000616449	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ACSS3-208	ENST00000616449	ORMDL3	Q8N138	153 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ACSS3-208	ENST00000616449		A1L4Q6	167 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ACSS3-208	ENST00000616449	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ACSS3-208	ENST00000616449	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ACSS3-208	ENST00000616449	SFTA2	Q6UW10	78 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ACSS3-208	ENST00000616449	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ACSS3-208	ENST00000616449	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ACSS3-208	ENST00000616449	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ACSS3-208	ENST00000616449	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ACSS3-208	ENST00000616449	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ACSS3-208	ENST00000616449	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
ACSS3-208	ENST00000616449	VGLL1	Q99990	258 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ACSS3-208	ENST00000616449	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ACSS3-208	ENST00000616449	CHODL	Q9H9P2	273 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ACSS3-208	ENST00000616449	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ACSS3-208	ENST00000616449		K7ENP7	123 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ACSS3-208	ENST00000616449	SMIM17	P0DL12	118 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ACSS3-208	ENST00000616449	ATP5J2	P56134	94 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ACSS3-208	ENST00000616449	PSG9	Q00887	426 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ACSS3-208	ENST00000616449	PSG3	Q16557	428 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ACSS3-208	ENST00000616449	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ACSS3-208	ENST00000616449	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ACSS3-208	ENST00000616449	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ACSS3-208	ENST00000616449	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ACSS3-208	ENST00000616449	SAA4	P35542	130 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ACSS3-208	ENST00000616449	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ACSS3-208	ENST00000616449	FOXC2	Q99958	501 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ACSS3-208	ENST00000616449	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	PCP4	P48539	62 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	LINC00310	P59036	64 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	THAP8	Q8NA92	274 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	HIVEP2	P31629	2446 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	GP9	P14770	177 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	LEP	P41159	167 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	ATP5G2	Q06055	141 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	TNFRSF14	Q92956	283 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449		H3BVH4	76 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	ATP6V0E1	O15342	81 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	DEFB1	P60022	68 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	DUX5	Q96PT3	197 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	LINC00311	Q8N616	119 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449		K7EIM0	57 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	GAGE10	A6NGK3	116 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	FCN3	O75636	299 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	CDSN	Q15517	529 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	TEX22	C9J3V5	150 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		10.05	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449		H3BUT2	72 aa		10.05	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	NDUFA3	O95167	84 aa		10.05	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	GNLY	P22749	145 aa		10.05	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	PRTN3	P24158	256 aa		10.05	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		10.05	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	IGLV1-47	P01700	117 aa		10.05	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		10.05	□□□□□ -0.8

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