RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 ATP5SQ99766 215 aa5.67□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 UQCR10Q9UDW1 63 aa5.67□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 COX11Q9Y6N1 276 aa5.67□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 A0A0J9YWU9 116 aa5.67□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 IGLC7A0M8Q6 106 aa5.67□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 IGKV1-5P01602 117 aa5.67□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 CSN3P07498 182 aa5.67□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 MAJINQ3KP22 176 aa5.67□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa5.67□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 OR5C1Q8NGR4 320 aa5.67□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 IL22RA2Q969J5 263 aa5.67□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa5.67□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 PAM16Q9Y3D7 125 aa5.67□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa5.66□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 TMEM238C9JI98 176 aa5.66□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 TMEM250H0YL14 139 aa5.66□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 UCP3P55916 312 aa5.66□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 RUNX1Q01196 453 aa5.66□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 Q6ZWC4 215 aa5.66□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 TMEM256Q8N2U0 113 aa5.66□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 TEX45Q8NA69 505 aa5.66□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 OR1L6Q8NGR2 347 aa5.66□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa5.66□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 PXMP4Q9Y6I8 212 aa5.66□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa5.66□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 TMEM213A2RRL7 107 aa5.66□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 ZNF785A8K8V0 405 aa5.66□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 IFNA5P01569 189 aa5.66□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 CTRLP40313 264 aa5.66□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 LYZP61626 148 aa5.66□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 DEFB114Q30KQ6 69 aa5.66□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 TMEM41BQ5BJD5 291 aa5.66□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 Q8N1Y9 231 aa5.66□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 VSTM2AQ8TAG5 236 aa5.66□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 MANBALQ9NQG1 85 aa5.66□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa5.66□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 CBY3A6NI87 242 aa5.66□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 IL4P05112 153 aa5.66□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 RPL19P84098 196 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 ZNF90Q03938 601 aa5.66□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 ADTRPQ96IZ2 230 aa5.66□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 UHRF2Q96PU4 802 aa5.66□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 B9D2Q9BPU9 175 aa5.66□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 VPS25Q9BRG1 176 aa5.66□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 CSTL1Q9H114 145 aa5.66□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa5.66□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 PRSS47A8MTI9 375 aa5.65□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 NUPR1O60356 82 aa5.65□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 UCP1P25874 307 aa5.65□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 ERHP84090 104 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 TDRG1Q3Y452 100 aa5.65□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 PSMG4Q5JS54 123 aa5.65□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 CST9LP1Q5W188 147 aa5.65□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 TMEM144Q7Z5S9 345 aa5.65□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 OR4C5Q8NGB2 326 aa5.65□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CS-212ENST00000548567 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa5.65□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 TCF24Q7RTU0 167 aa5.65□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 MUC7Q8TAX7 377 aa5.65□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 GPR146Q96CH1 333 aa5.65□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 SMIM12Q96EX1 92 aa5.65□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 RPRMQ9NS64 109 aa5.65□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 BET1LQ9NYM9 111 aa5.65□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa5.65□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 IGLV1-51P01701 117 aa5.64□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 IGLC2P0DOY2 106 aa5.64□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 IGLC3P0DOY3 106 aa5.64□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 ZNF726P1Q15940 193 aa5.64□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 LCN15Q6UWW0 184 aa5.64□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 OR4A5Q8NH83 315 aa5.64□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa5.64□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 THYN1Q9P016 225 aa5.64□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 PEMTQ9UBM1 199 aa5.64□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 SSSCA1O60232 199 aa5.64□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 CRYGBP07316 175 aa5.64□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 ID3Q02535 119 aa5.64□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 FHL3Q13643 280 aa5.64□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 MSMO1Q15800 293 aa5.64□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 VN1R17PQ8TDU5 208 aa5.64□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 NUDT11Q96G61 164 aa5.64□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 TMEM56Q96MV1 263 aa5.64□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa5.63□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 IGLL5B9A064 214 aa5.63□□□□□ -1.51
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