RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LAGE3Q14657 143 aa6.54□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FFAR4Q5NUL3 377 aa6.54□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 Q6ZQT7 251 aa6.54□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa6.54□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.54□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DNAJC30Q96LL9 226 aa6.54□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM222Q9H0R3 208 aa6.54□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C8orf4Q9NR00 106 aa6.54□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.53□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa6.53□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PANO1I0J062 215 aa6.53□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RGS13O14921 159 aa6.53□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MPDU1O75352 247 aa6.53□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SULT1A3P0DMM9 295 aa6.53□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SULT1A4P0DMN0 295 aa6.53□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ERCC8Q13216 396 aa6.53□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GPR107Q5VW38 600 aa6.53□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa6.53□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IQCF2Q8IXL9 164 aa6.53□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR10P1Q8NGE3 313 aa6.53□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR1S1Q8NH92 325 aa6.53□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARPC5LQ9BPX5 153 aa6.53□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRR13Q9NZ81 148 aa6.53□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC17A3O00476 420 aa6.52□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HYPMO75409 117 aa6.52□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IAPPP10997 89 aa6.52□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SH2D6Q7Z4S9 175 aa6.52□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SNX29P2Q8IUI4 249 aa6.52□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR13C8Q8NGS7 320 aa6.52□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GLYATL2Q8WU03 294 aa6.52□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A0J9YXV3 536 aa6.51□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TNFAIP8O95379 198 aa6.51□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IL5P05113 134 aa6.51□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TIRAPP58753 221 aa6.51□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRTAP10-8P60410 259 aa6.51□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RAB11AP62491 216 aa6.51□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AKR1C1Q04828 323 aa6.51□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UBE2NLQ5JXB2 153 aa6.51□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM122CQ6P4D5 195 aa6.51□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LCN15Q6UWW0 184 aa6.51□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SAMD12Q8N8I0 201 aa6.51□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR10G4Q8NGN3 311 aa6.51□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MARCH1Q8TCQ1 289 aa6.51□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GPX8Q8TED1 209 aa6.51□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DPH3Q96FX2 82 aa6.51□□□□□ -1.37
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC50A1Q9BRV3 221 aa6.51□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.51□□□□□ -1.37
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PITX3O75364 302 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GPX1P07203 203 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LINC00869P0C866 280 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LHFPL1Q86WI0 220 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR4C5Q8NGB2 326 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZFAND1Q8TCF1 268 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ODF3Q96PU9 254 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HSPB7Q9UBY9 170 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 COX11Q9Y6N1 276 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SMCO3A2RU48 225 aa6.49□□□□□ -1.37
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OPCMLQ14982 345 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TOR2AQ5JU69 321 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MUC21Q5SSG8 566 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARL6Q9H0F7 186 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NAA60Q9H7X0 242 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BOLA1Q9Y3E2 137 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KLLNB2CW77 178 aa6.48□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 B3GALNT1O75752 331 aa6.48□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CD3DP04234 171 aa6.48□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR4E1P0C645 316 aa6.48□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CXCL2P19875 107 aa6.48□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 VWC2Q2TAL6 325 aa6.48□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRR9Q5T870 116 aa6.48□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PATE2Q6UY27 113 aa6.48□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR4D10Q8NGI6 311 aa6.48□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RMI2Q96E14 147 aa6.48□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CACFD1Q9UGQ2 172 aa6.48□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FABP12A6NFH5 140 aa6.47□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PHOX2AO14813 284 aa6.47□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCR6P51684 374 aa6.47□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SMCO1Q147U7 214 aa6.47□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 WDR73Q6P4I2 378 aa6.47□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TERB2Q8NHR7 220 aa6.47□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa6.47□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARV1Q9H2C2 271 aa6.47□□□□□ -1.37
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