RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516914.2

RNU6-677P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 677, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-677P, Length 101 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-677P-201ENST00000516914 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 SIP14410 1827 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 H3BQV1 296 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 H7BYZ3 331 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 SPATA45Q537H7 98 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 TMEM78Q5T7P6 136 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 OR10AC1Q8NH08 325 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 BORCS8Q96FH0 119 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 MED11Q9P086 117 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 NAT8BQ9UHF3 227 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 ROCK1Q13464 1354 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 CITO14578 2027 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 TRIQKQ629K1 86 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 DCUN1D2Q6PH85 259 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 CCL4L1Q8NHW4 92 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 DIRC1Q969H9 104 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 HSPB8Q9UJY1 196 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 NUP210LQ5VU65 1888 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 PTPRFP10586 1907 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 MYH2Q9UKX2 1941 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 TENM3Q9P273 2699 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 K7EIL1 84 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 CD14P08571 375 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 DYDC1Q8WWB3 177 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 PCBD2Q9H0N5 130 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 CST11Q9H112 138 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 TECPR2O15040 1411 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 ERBINQ96RT1 1412 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 SYNMO15061 1565 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 MYLKQ15746 1914 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 A0A0J9YY99 117 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 S100A5P33763 92 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 FXYD4P59646 89 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 ISOC1Q96CN7 298 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 C10orf95Q9H7T3 257 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 BCL9O00512 1426 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 A0A096LPI6 279 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 A0A1W2PRE2 83 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 GABARAPH6UMI1 98 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 MT-ND6P03923 174 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 BCL2P10415 239 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 OCIAD2Q56VL3 154 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 ANGPTL5Q86XS5 388 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 MCEEQ96PE7 176 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 OR4C12Q96R67 309 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 LIMD2Q9BT23 127 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 SMPXQ9UHP9 88 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 TPRKBQ9Y3C4 175 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 MYH3P11055 1940 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 A0A0D9SG42 100 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 FABP4P15090 132 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 S100A11P31949 105 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 VMA21Q3ZAQ7 101 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 CROCCP2Q86T23 111 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 STX12Q86Y82 276 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 EFCAB11Q9BUY7 163 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 NIT2Q9NQR4 276 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 ADGBQ8N7X0 1667 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 A6NN06 94 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 FABP1P07148 127 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 FABP2P12104 132 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 PDE6GP18545 87 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 SPINK9Q5DT21 86 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 LINC00299Q6ZSB3 139 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 ATOH7Q8N100 152 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 OR4B1Q8NGF8 309 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 CCDC32Q9BV29 185 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 ATPIF1Q9UII2 106 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 PIK3C2AO00443 1686 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 MUC4Q99102 2169 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 ZNF727A8MUV8 499 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 IGHV3-30P01768 117 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 SDC2P34741 201 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 SPATA8Q6RVD6 105 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 HRCT1Q6UXD1 115 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 OR5H6Q8NGV6 325 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 THEM6Q8WUY1 208 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 ZNF462Q96JM2 2506 aa0.4□□□□□ -2.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 TRACP01848 142 aa0.4□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 114.7 ms