RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 RPL5P46777 297 aaKnown RBP-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 HNMTP50135 292 aa-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 DAOAP59103 153 aa-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 CLEC6AQ6EIG7 209 aa-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 LRRC18Q8N456 261 aa-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 C19orf60Q96EN9 201 aa-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 ARL5BQ96KC2 179 aa-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 STMN3Q9NZ72 180 aa-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 DISC1C4P0D8 188 aa-4.23□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 LRRN3E7EW58 273 aa-4.23□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP-4.23□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 NEMFO60524 1076 aa-4.23□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 ADAP1O75689 374 aa-4.23□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 COX4I1P13073 169 aa-4.23□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP-4.23□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 PIGYQ3MUY2 71 aa-4.23□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 STOML3Q8TAV4 291 aa-4.23□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 FBXL12Q9NXK8 326 aa-4.23□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZFHX3Q15911 3703 aa-4.23□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 FMN1Q68DA7 1419 aa-4.23□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 ARAP1Q96P48 1450 aa-4.24□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 KDM3BQ7LBC6 1761 aa-4.24□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP-4.24□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 hDV103S1A0JD37 113 aa-4.24□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 M0R2P5 195 aa-4.24□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 NCR2O95944 276 aa-4.24□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 ISG15P05161 165 aa-4.24□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCKP06307 115 aa-4.24□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 S100A4P26447 101 aaKnown RBP-4.24□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 JOSD2Q8TAC2 188 aa-4.24□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 LGALS14Q8TCE9 139 aa-4.24□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 GLYATL2Q8WU03 294 aa-4.24□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa-4.24□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 CST11Q9H112 138 aa-4.24□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMEM133Q9H2Q1 129 aa-4.24□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 CMTM6Q9NX76 183 aa-4.24□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 LRP6O75581 1613 aa-4.24□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 KIAA0232Q92628 1395 aa-4.25□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 K7EP34 96 aa-4.25□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 MT1BP07438 61 aa-4.25□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 CXCR4P61073 352 aa-4.25□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 ERVS71-1P61550 626 aa-4.25□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa-4.25□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 SPOPLQ6IQ16 392 aa-4.25□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 LYPD5Q6UWN5 251 aa-4.25□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 AHSA2Q719I0 299 aa-4.25□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 HIST2H3AQ71DI3 136 aa-4.25□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP-4.25□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa-4.25□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR5D16Q8NGK9 328 aa-4.25□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 DMAC1Q96GE9 116 aa-4.25□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 TIPINQ9BVW5 301 aa-4.25□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP-4.25□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC22A13Q9Y226 551 aa-4.25□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 RIMS2Q9UQ26 1411 aa-4.26□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa-4.26□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP-4.26□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 PEX19P40855 299 aa-4.26□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 AKR1D1P51857 326 aa-4.26□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 ATP5J2P56134 94 aa-4.26□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 RAB8AP61006 207 aa-4.26□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR5AK3PQ8NH89 298 aa-4.26□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 DHRS9Q9BPW9 319 aa-4.26□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 NSD3Q9BZ95 1437 aa-4.27□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP-4.27□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 NDUFB3O43676 98 aa-4.27□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 IGKCP01834 107 aa-4.27□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 MT1GP13640 62 aa-4.27□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP-4.27□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 IZUMO2Q6UXV1 221 aa-4.27□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa-4.27□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 DEFB125Q8N687 156 aa-4.27□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 DEFB123Q8N688 67 aa-4.27□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC25A40Q8TBP6 338 aa-4.27□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa-4.27□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 AP1S3Q96PC3 154 aa-4.27□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 MS4A6AQ9H2W1 248 aa-4.27□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP-4.27□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 CYSLTR1Q9Y271 337 aa-4.27□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP-4.27□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 DOCK5Q9H7D0 1870 aa-4.28□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP-4.28□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 NEO1Q92859 1461 aa-4.28□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 H0YGG7 62 aa-4.28□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 BRI3O95415 125 aa-4.28□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa-4.28□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa-4.28□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP-4.28□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP-4.28□□□□□ -3.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLIT1O75093 1534 aa-4.29□□□□□ -3.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa-4.29□□□□□ -3.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa-4.29□□□□□ -3.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 DAPL1A0PJW8 107 aa-4.29□□□□□ -3.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 C1orf196B1AJZ1 125 aa-4.29□□□□□ -3.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 TPST1O60507 370 aa-4.29□□□□□ -3.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 MARCKSL1P49006 195 aa-4.29□□□□□ -3.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 SSX6Q7RTT6 188 aa-4.29□□□□□ -3.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 COMMD7Q86VX2 200 aa-4.29□□□□□ -3.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 BLIDQ8IZY5 108 aa-4.29□□□□□ -3.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.7 ms