RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 ISLRO14498 428 aa5.53□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 PMCHL1Q16048 86 aa5.53□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 C5orf64Q2M2E5 130 aa5.53□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 RPEL1Q2QD12 228 aa5.53□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 DEFB125Q8N687 156 aa5.53□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 FXYD5Q96DB9 178 aa5.53□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 PERPQ96FX8 193 aa5.53□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 V9GYV3 84 aa5.53□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 EPG5Q9HCE0 2579 aa5.52□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa5.52□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 GAGE12HA6NDE8 117 aa5.52□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 LY6LH3BQJ8 138 aa5.52□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 CRYGCP07315 174 aa5.52□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa5.52□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 PET117Q6UWS5 81 aa5.52□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 DYNAPQ8N1N2 210 aa5.52□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 MTURNQ8N3F0 131 aa5.52□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 LY6G5BQ8NDX9 201 aa5.52□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 FAM168AQ92567 244 aa5.52□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 DPF1Q92782 380 aa5.52□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 RAB37Q96AX2 223 aa5.52□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 MRAP2Q96G30 205 aa5.52□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 PIMREGQ9BSJ6 248 aa5.52□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 NAT8BQ9UHF3 227 aa5.52□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 CENPEQ02224 2701 aa5.52□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 IGLV2-8P01709 118 aa5.52□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 IGLL1P15814 213 aa5.52□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 HILS1P60008 231 aa5.52□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 PEX7O00628 323 aa5.52□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 NBR2O15453 112 aa5.52□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 SCGB2A1O75556 95 aa5.52□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa5.52□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 VMO1Q7Z5L0 202 aa5.52□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 ZNF329Q86UD4 541 aa5.52□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 TMEM116Q8NCL8 245 aa5.52□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa5.52□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa5.51□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 H0Y8G0 127 aa5.51□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 SIVA1O15304 175 aa5.51□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 IGHV3-23P01764 117 aa5.51□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 COL8A1P27658 744 aa5.51□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 SLC25A34Q6PIV7 304 aa5.51□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 OR2K2Q8NGT1 345 aa5.51□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 TRGV9Q99603 122 aa5.51□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 RASL11BQ9BPW5 248 aa5.51□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 GNB4Q9HAV0 340 aa5.51□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 A0A087X0K7 114 aa5.51□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa5.51□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 SNAI2O43623 268 aa5.51□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 HSBP1O75506 76 aa5.51□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 PRTN3P24158 256 aa5.51□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 UBE2G1P62253 170 aa5.51□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 PAX8Q06710 450 aa5.51□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 OR4F17Q8NGA8 305 aa5.51□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 ASCL2Q99929 193 aa5.51□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 POLQO75417 2590 aa5.51□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 IGKV1-17P01599 117 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 PSG3Q16557 428 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 WFDC11Q8NEX6 87 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 OR11H6Q8NGC7 330 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 CFHR4Q92496 578 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 HIGD1AQ9Y241 93 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 LY96Q9Y6Y9 160 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 B5MCH6 92 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 I3L2K1 104 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 ID1P41134 155 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 CX3CL1P78423 397 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 TCF24Q7RTU0 167 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 EPDR1Q9UM22 224 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 SPCS1Q9Y6A9 102 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 K7EIM0 57 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 LINC00310P59036 64 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 LMO4P61968 165 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 NDPQ00604 133 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 Q71RC1 249 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 Q8N976 141 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 OR10AG1Q8NH19 301 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 AJUBAQ96IF1 538 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 KCNS1Q96KK3 526 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 C17orf77Q96MU5 243 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 BPESC1Q9GZL8 116 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC4-211ENST00000492996 Q9H3A6 140 aa5.5□□□□□ -1.53
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