RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492485.5

TRIOBP-211, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TRIOBP, Length 3,948 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-211ENST00000492485 FAM106AQ4KMX7 169 aa9.91□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 EPG5Q9HCE0 2579 aa9.91□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 A0A1B0GV72 72 aa9.91□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 BMI1P35226 326 aa9.91□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 DEFB1P60022 68 aa9.91□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 FAM120AOSQ5T036 256 aa9.91□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 SAMD5Q5TGI4 173 aa9.91□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 DPM3Q9P2X0 92 aa9.91□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa9.91□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 IGHV1-8P0DP01 117 aa9.91□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 ADIPOQQ15848 244 aa9.91□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 PATE2Q6UY27 113 aa9.91□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 ST20Q9HBF5 79 aa9.91□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 TRAV40A0A0B4J280 105 aa9.9□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 J3QW42 95 aa9.9□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 Q8NFD4 153 aa9.9□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 C8orf46Q8TAG6 207 aa9.9□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 SCGB3A1Q96QR1 104 aa9.9□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 C1RLQ9NZP8 487 aa9.9□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa9.9□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 OR5AN1Q8NGI8 311 aa9.9□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 DPF1Q92782 380 aa9.9□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 LOC105371242A0A075B767 164 aa9.9□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 A0A1B0GWJ7 208 aa9.9□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 TMEM158Q8WZ71 300 aa9.9□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 SIGLEC9Q9Y336 463 aa9.9□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa9.89□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa9.89□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 SH2D1AO60880 128 aa9.89□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 EFNA4P52798 201 aa9.89□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 TMEM249Q2WGJ8 235 aa9.89□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 ANKRD39Q53RE8 183 aa9.89□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 GDF5OSQ5U4N7 250 aa9.89□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 TTC9CQ8N5M4 171 aa9.89□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa9.89□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 SAMD13Q5VXD3 122 aa9.89□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 BRD3OSQ6XYD6 125 aa9.89□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 DUX5Q96PT3 197 aa9.89□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 OTORQ9NRC9 128 aa9.89□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa9.89□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 Q71RC1 249 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 RNF138Q8WVD3 245 aa9.89□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 FXYD5Q96DB9 178 aa9.89□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 CRXO43186 299 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 RHOGP84095 191 aa9.88□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 Q86TA4 180 aa9.88□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 C11orf44Q8N8P7 122 aa9.88□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF503Q96F45 646 aa9.88□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa9.88□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 MUC3AQ02505 3323 aa9.88□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 FASNP49327 2511 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 NDUFS7O75251 213 aa9.88□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa9.88□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 PET117Q6UWS5 81 aa9.88□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 ARPC1AQ92747 370 aa9.88□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF479Q96JC4 524 aa9.88□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 C15orf32Q32M92 178 aa9.88□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa9.88□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 GTSF1Q8WW33 167 aa9.88□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 NUP210LQ5VU65 1888 aa9.88□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 AKAP13Q12802 2813 aa9.88□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 G3V318 75 aa9.88□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 TMEM178BH3BS89 294 aa9.88□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 ASCL5Q7RTU5 278 aa9.88□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 SMIM12Q96EX1 92 aa9.88□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 C22orf46C9J442 243 aa9.87□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 NPYP01303 97 aa9.87□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF56Q15929 161 aa9.87□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 METTL26Q96S19 204 aa9.87□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 DSCAMO60469 2012 aa9.87□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa9.87□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 A0A0G2JNJ9 132 aa9.87□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 H3BMG7 143 aa9.87□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 TM4SF5O14894 197 aa9.87□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 NBR2O15453 112 aa9.87□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 GRNP28799 593 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa9.87□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 Q9UFV3 132 aa9.87□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa9.87□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa9.87□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 SH2D6Q7Z4S9 175 aa9.87□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 VGLL1Q99990 258 aa9.87□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 CHODLQ9H9P2 273 aa9.87□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 RAXQ9Y2V3 346 aa9.87□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 TRGV3P03979 118 aa9.86□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 TMEM131Q92545 1883 aa9.86□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa9.86□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 FABP5P3A8MUU1 101 aa9.86□□□□□ -0.83
TRIOBP-211ENST00000492485 PRTN3P24158 256 aa9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 127.8 ms