RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467464.1

PTPRF-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-211ENST00000467464 PCLOQ9Y6V0 5065 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 NPIPB6E9PJ23 425 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF253O75346 499 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 S100A11P31949 105 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 S100A10P60903 97 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 IFITM3Q01628 133 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 GFI1BQ5VTD9 330 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 LINC00612Q8N6U2 182 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 C15orf53Q8NAA6 179 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 C16orf74Q96GX8 76 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 TRBV19A0A075B6N1 114 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 CBY3A6NI87 242 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 PRSS29PA6NIE9 313 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 H7BYZ3 331 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 NDUFB4O95168 129 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 CT45A10P0DMU9 189 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 GUK1Q16774 197 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF493Q6ZR52 646 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 OR1L4Q8NGR5 311 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 C20orf144Q9BQM9 153 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 M0R3E3 92 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 ATP5G1P05496 136 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 ATP5G3P48201 142 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 BAXQ07812 192 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 RAB31Q13636 194 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 GCSAMLQ5JQS6 135 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 Q6ZRG5 221 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 STX12Q86Y82 276 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 OR10J6PQ8NGY7 276 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 ODF3Q96PU9 254 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 PFDN5Q99471 154 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 TMEM14CQ9P0S9 112 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 H0YIZ8 118 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 UPK1BO75841 260 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 SIX6O95475 246 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 HTN1P15515 57 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 FGF7P21781 194 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 HBG1P69891 147 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 HBG2P69892 147 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 NHLH2Q02577 135 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 ATP6V1FQ16864 119 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 MZT2BQ6NZ67 158 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 ZNRF2Q8NHG8 242 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 RNF141Q8WVD5 230 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 S100ZQ8WXG8 99 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 FAM19A4Q96LR4 140 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 NPCDR1Q9BY65 106 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 OR5AC2Q9NZP5 309 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 A6NHS1 94 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 F5H768 121 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 MPDU1O75352 247 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 PYYP10082 97 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 ERCC8Q13216 396 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 THAP6Q8TBB0 222 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 SLC25A2Q9BXI2 301 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 KLLNB2CW77 178 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 J3KRW8 73 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 HOXA5P20719 270 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 PDE6HQ13956 83 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 NMES1Q9C002 83 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 LINC00588Q9Y4M8 146 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRF-211ENST00000467464 LRP1BQ9NZR2 4599 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRF-211ENST00000467464 NUDT3O95989 172 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRF-211ENST00000467464 LEPP41159 167 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRF-211ENST00000467464 H2BFSP57053 126 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRF-211ENST00000467464 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRF-211ENST00000467464 OR5C1Q8NGR4 320 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRF-211ENST00000467464 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRF-211ENST00000467464 ABCA13Q86UQ4 5058 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRF-211ENST00000467464 E5RGE8 158 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRF-211ENST00000467464 CRISP2P16562 243 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRF-211ENST00000467464 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRF-211ENST00000467464 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRF-211ENST00000467464 PRR9Q5T870 116 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRF-211ENST00000467464 C1orf134Q5TEV5 83 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRF-211ENST00000467464 MIR17HGQ75NE6 70 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRF-211ENST00000467464 C11orf72Q8NBR9 251 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRF-211ENST00000467464 ENKURQ8TC29 256 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRF-211ENST00000467464 PYGO2Q9BRQ0 406 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRF-211ENST00000467464 LINC00467Q9BRT7 94 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRF-211ENST00000467464 PRELID1Q9Y255 219 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRF-211ENST00000467464 NACAE9PAV3 2078 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRF-211ENST00000467464 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRF-211ENST00000467464 GAGE12BA1L429 117 aa8.31□□□□□ -1.08
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