RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MIC13Q5XKP0 118 aa18.37■□□□□ 0.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR1L4Q8NGR5 311 aa18.37■□□□□ 0.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C2orf50Q96LR7 162 aa18.37■□□□□ 0.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C11orf1Q9H5F2 150 aa18.37■□□□□ 0.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCLOQ9Y6V0 5065 aa18.37■□□□□ 0.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIR3DS1Q14943 382 aa18.36■□□□□ 0.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WDR83OSQ9Y284 106 aa18.36■□□□□ 0.53
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BAXQ07812 192 aa18.32■□□□□ 0.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC39A9Q9NUM3 307 aa18.32■□□□□ 0.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CT45A10P0DMU9 189 aa18.31■□□□□ 0.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LEPP41159 167 aa18.31■□□□□ 0.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STX12Q86Y82 276 aa18.31■□□□□ 0.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ODF3Q96PU9 254 aa18.31■□□□□ 0.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC32Q9BV29 185 aa18.31■□□□□ 0.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF586Q9NXT0 402 aa18.31■□□□□ 0.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa18.3■□□□□ 0.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGSF23A1L1A6 192 aa18.3■□□□□ 0.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NPIPB6E9PJ23 425 aa18.3■□□□□ 0.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 J3KRW8 73 aa18.3■□□□□ 0.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HBG1P69891 147 aa18.3■□□□□ 0.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HBG2P69892 147 aa18.3■□□□□ 0.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAB32Q13637 225 aa18.3■□□□□ 0.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLINT1Q14677 625 aa18.3■□□□□ 0.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM252Q8N6L7 170 aa18.3■□□□□ 0.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF253O75346 499 aa18.29■□□□□ 0.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IL15RAQ13261 267 aa18.29■□□□□ 0.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR5I1Q13606 314 aa18.29■□□□□ 0.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LINC00612Q8N6U2 182 aa18.29■□□□□ 0.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LINC00588Q9Y4M8 146 aa18.29■□□□□ 0.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa18.28■□□□□ 0.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa18.28■□□□□ 0.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SNURFLB1AK76 121 aa18.28■□□□□ 0.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHAC2Q8WUX2 184 aa18.28■□□□□ 0.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GAGE12BA1L429 117 aa18.27■□□□□ 0.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GAGE7O76087 117 aa18.27■□□□□ 0.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RLN2P04090 185 aa18.27■□□□□ 0.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GAGE12FP0CL80 117 aa18.27■□□□□ 0.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GAGE12GP0CL81 117 aa18.27■□□□□ 0.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GAGE12IP0CL82 117 aa18.27■□□□□ 0.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FGF7P21781 194 aa18.27■□□□□ 0.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATP6V1FQ16864 119 aa18.27■□□□□ 0.52
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRBV19A0A075B6N1 114 aa18.26■□□□□ 0.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 M6PRP20645 277 aa18.26■□□□□ 0.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SSX7Q7RTT5 188 aa18.26■□□□□ 0.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF575Q86XF7 245 aa18.26■□□□□ 0.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C6orf223Q8N319 242 aa18.26■□□□□ 0.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PYGO2Q9BRQ0 406 aa18.26■□□□□ 0.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM14CQ9P0S9 112 aa18.26■□□□□ 0.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa18.25■□□□□ 0.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MZT2BQ6NZ67 158 aa18.25■□□□□ 0.51
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MPDU1O75352 247 aa18.24■□□□□ 0.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TNP2Q05952 138 aa18.24■□□□□ 0.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RXFP4Q8TDU9 374 aa18.24■□□□□ 0.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRELID1Q9Y255 219 aa18.24■□□□□ 0.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TIMM9Q9Y5J7 89 aa18.24■□□□□ 0.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HOXA5P20719 270 aa18.23■□□□□ 0.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF503Q96F45 646 aa18.23■□□□□ 0.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A0J9YY99 117 aa18.22■□□□□ 0.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NDUFB4O95168 129 aa18.22■□□□□ 0.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PYYP10082 97 aa18.22■□□□□ 0.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ERCC8Q13216 396 aa18.22■□□□□ 0.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PDE6HQ13956 83 aa18.22■□□□□ 0.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C7orf71A4D174 169 aa18.21■□□□□ 0.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BLNKQ8WV28 456 aa18.21■□□□□ 0.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LINC00477Q96M19 166 aa18.21■□□□□ 0.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NPCDR1Q9BY65 106 aa18.21■□□□□ 0.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GCSAMLQ5JQS6 135 aa18.2■□□□□ 0.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 Q9H8V8 135 aa18.2■□□□□ 0.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MUC4Q99102 2169 aa18.2■□□□□ 0.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RYR1P21817 5038 aa18.19■□□□□ 0.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NHLH2Q02577 135 aa18.19■□□□□ 0.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ASAH1Q13510 395 aa18.19■□□□□ 0.5
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