RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430918.5

HDLBP-217, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 3

Gene HDLBP, Length 612 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-217ENST00000430918 PXDC1Q5TGL8 231 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-217ENST00000430918 SPATA12Q7Z6I5 190 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-217ENST00000430918 C20orf144Q9BQM9 153 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-217ENST00000430918 TRAV5A0A0B4J249 113 aa7.08□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa7.08□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 C7orf66A4D0T2 115 aa7.08□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 H3BQ15 152 aa7.08□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 MBPP02686 304 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 TAS2R30P59541 319 aa7.08□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 ESRGQ1W209 222 aa7.08□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 C10orf113Q5VZT2 155 aa7.08□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 LINC00612Q8N6U2 182 aa7.08□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 RXFP4Q8TDU9 374 aa7.08□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 LRP1BQ9NZR2 4599 aa7.08□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 L7N2F9 121 aa7.07□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 CT45A10P0DMU9 189 aa7.07□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 IGLC2P0DOY2 106 aa7.07□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 CAMLGP49069 296 aa7.07□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 BCAP31P51572 246 aa7.07□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 VAMP2P63027 116 aa7.07□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 TTC32Q5I0X7 151 aa7.07□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 MIC13Q5XKP0 118 aa7.07□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 NRARPQ7Z6K4 114 aa7.07□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 MITD1Q8WV92 249 aa7.07□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 GGACTQ9BVM4 153 aa7.07□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 Q9H3A6 140 aa7.07□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa7.07□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 PXMP4Q9Y6I8 212 aa7.07□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 CENPXA8MT69 81 aa7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 NPIPB6E9PJ23 425 aa7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 CST7O76096 145 aa7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 LEPP41159 167 aa7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 CAV2P51636 162 aa7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 KRTAP10-2P60368 255 aa7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 Q6ZRG5 221 aa7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 Q6ZTI0 123 aa7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 ZNF503Q96F45 646 aa7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 UPK3BQ9BT76 320 aa7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 ZNF586Q9NXT0 402 aa7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 FAM24AA6NFZ4 105 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 FAM25EA8MYX2 175 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 M0R3E3 92 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 ERCC8Q13216 396 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 ZNF846Q147U1 533 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 Q8N1X5 172 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 OR1L4Q8NGR5 311 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 PYGO2Q9BRQ0 406 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 C20orf85Q9H1P6 137 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 SCRT2Q9NQ03 307 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 APOBP04114 4563 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 TRGV2A0A075B6R0 118 aa7.04□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 A0A096LPF7 62 aa7.04□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa7.04□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 C7orf71A4D174 169 aa7.04□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 H3BNG1 76 aa7.04□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 IL7P13232 177 aa7.04□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 BAXQ07812 192 aa7.04□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 BTN1A1Q13410 526 aa7.04□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 RAB31Q13636 194 aa7.04□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 GUK1Q16774 197 aa7.04□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 VSIG2Q96IQ7 327 aa7.04□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 ODF3Q96PU9 254 aa7.04□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 PFDN5Q99471 154 aa7.04□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 UQCC1Q9NVA1 299 aa7.04□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 WDR83OSQ9Y284 106 aa7.04□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 TRBV19A0A075B6N1 114 aa7.03□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 TRAV6A0A075B6T7 132 aa7.03□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa7.03□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 A0A1W2PPQ1 181 aa7.03□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 C5orf51A6NDU8 294 aa7.03□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 PYYP10082 97 aa7.03□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 LINC00315P59091 139 aa7.03□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 CD300CQ08708 224 aa7.03□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 C11orf72Q8NBR9 251 aa7.03□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 SEC22CQ9BRL7 303 aa7.03□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 C11orf1Q9H5F2 150 aa7.03□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 SLC39A9Q9NUM3 307 aa7.03□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 FUT9Q9Y231 359 aa7.03□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 DNAH5Q8TE73 4624 aa7.03□□□□□ -1.28
HDLBP-217ENST00000430918 IGSF23A1L1A6 192 aa7.02□□□□□ -1.29
HDLBP-217ENST00000430918 PLA2G10O15496 165 aa7.02□□□□□ -1.29
HDLBP-217ENST00000430918 ZNF253O75346 499 aa7.02□□□□□ -1.29
HDLBP-217ENST00000430918 NDUFB4O95168 129 aa7.02□□□□□ -1.29
HDLBP-217ENST00000430918 IGHV3-53P01767 116 aa7.02□□□□□ -1.29
HDLBP-217ENST00000430918 BTF3P20290 206 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
HDLBP-217ENST00000430918 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
HDLBP-217ENST00000430918 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.02□□□□□ -1.299e-8■□□□□ 11.3
HDLBP-217ENST00000430918 RPL29P47914 159 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
HDLBP-217ENST00000430918 S100A10P60903 97 aa7.02□□□□□ -1.29
HDLBP-217ENST00000430918 VWC2Q2TAL6 325 aa7.02□□□□□ -1.29
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