RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427778.1

LINC00963-204, long intergenic non-protein coding RNA 963, humanhuman

TSL 2

Gene LINC00963, Length 382 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00963-204ENST00000427778 C11orf94C9JXX5 98 aa6.35□□□□□ -1.39
LINC00963-204ENST00000427778 H3BQ15 152 aa6.35□□□□□ -1.39
LINC00963-204ENST00000427778 DEFB4AO15263 64 aa6.35□□□□□ -1.39
LINC00963-204ENST00000427778 IGKV3-20P01619 116 aa6.35□□□□□ -1.39
LINC00963-204ENST00000427778 TCTAP57738 103 aa6.35□□□□□ -1.39
LINC00963-204ENST00000427778 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
LINC00963-204ENST00000427778 FGL1Q08830 312 aa6.35□□□□□ -1.39
LINC00963-204ENST00000427778 PDE6HQ13956 83 aa6.35□□□□□ -1.39
LINC00963-204ENST00000427778 IGFL4Q6B9Z1 124 aa6.35□□□□□ -1.39
LINC00963-204ENST00000427778 OR11H7Q8NGC8 314 aa6.35□□□□□ -1.39
LINC00963-204ENST00000427778 ASB13Q8WXK3 278 aa6.35□□□□□ -1.39
LINC00963-204ENST00000427778 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
LINC00963-204ENST00000427778 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa6.35□□□□□ -1.39
LINC00963-204ENST00000427778 ATP5SQ99766 215 aa6.35□□□□□ -1.39
LINC00963-204ENST00000427778 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
LINC00963-204ENST00000427778 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
LINC00963-204ENST00000427778 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa6.35□□□□□ -1.39
LINC00963-204ENST00000427778 HSPB11Q9Y547 144 aa6.35□□□□□ -1.39
LINC00963-204ENST00000427778 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa6.34□□□□□ -1.39
LINC00963-204ENST00000427778 SLC17A3O00476 420 aa6.34□□□□□ -1.39
LINC00963-204ENST00000427778 CRXO43186 299 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
LINC00963-204ENST00000427778 RPL12P30050 165 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
LINC00963-204ENST00000427778 CLINT1Q14677 625 aa6.34□□□□□ -1.39
LINC00963-204ENST00000427778 C1orf158Q8N1D5 194 aa6.34□□□□□ -1.39
LINC00963-204ENST00000427778 THAP6Q8TBB0 222 aa6.34□□□□□ -1.39
LINC00963-204ENST00000427778 LRRC20Q8TCA0 184 aa6.34□□□□□ -1.39
LINC00963-204ENST00000427778 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
LINC00963-204ENST00000427778 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
LINC00963-204ENST00000427778 MBD2Q9UBB5 411 aa6.34□□□□□ -1.39
LINC00963-204ENST00000427778 RFNGQ9Y644 331 aa6.34□□□□□ -1.39
LINC00963-204ENST00000427778 TRBV19A0A075B6N1 114 aa6.33□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 TRAV5A0A0B4J249 113 aa6.33□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa6.33□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 C17orf112F2Z3M2 114 aa6.33□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 INSP01308 110 aa6.33□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 HLA-DMBP28068 263 aa6.33□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 TSPOP30536 169 aa6.33□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 FXYD7P58549 80 aa6.33□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 GCSAMLQ5JQS6 135 aa6.33□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 TMEM256Q8N2U0 113 aa6.33□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa6.33□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 ODF3Q96PU9 254 aa6.33□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 ZNF586Q9NXT0 402 aa6.33□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 M0R2Z0 102 aa6.32□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 NDUFB4O95168 129 aa6.32□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 LY6G6CO95867 125 aa6.32□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 HBE1P02100 147 aa6.32□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 SPINK13Q1W4C9 94 aa6.32□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 Q6ZTC4 211 aa6.32□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 C2CD4CQ8TF44 421 aa6.32□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 C20orf144Q9BQM9 153 aa6.32□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 SLC25A2Q9BXI2 301 aa6.32□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 MED28Q9H204 178 aa6.32□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 CELA1Q9UNI1 258 aa6.32□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 PRELID1Q9Y255 219 aa6.32□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 DNAH6Q9C0G6 4158 aa6.32□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 TRAV10A0A0B4J240 114 aa6.31□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 NPIPB6E9PJ23 425 aa6.31□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 IFNA5P01569 189 aa6.31□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 GIPP09681 153 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 SPART-AS1P0CW21 52 aa6.31□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 CDKN1BP46527 198 aa6.31□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 OXA1LQ15070 435 aa6.31□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 FCN2Q15485 313 aa6.31□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 RRN3P1Q2M238 152 aa6.31□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 RGS21Q2M5E4 152 aa6.31□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 C12orf74Q32Q52 190 aa6.31□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 BAP18Q8IXM2 172 aa6.31□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 OR10J6PQ8NGY7 276 aa6.31□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 AQP10Q96PS8 301 aa6.31□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 DKK2Q9UBU2 259 aa6.31□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 FUT9Q9Y231 359 aa6.31□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 TIMM9Q9Y5J7 89 aa6.31□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 PKHD1P08F94 4074 aa6.3□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.3□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa6.3□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa6.3□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 PRAC2D3DTV9 90 aa6.3□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 H3BTX0 84 aa6.3□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 PYYP10082 97 aa6.3□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 RHOBP62745 196 aa6.3□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 LGALS9CQ6DKI2 356 aa6.3□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 MIR17HGQ75NE6 70 aa6.3□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 SCGB1C1Q8TD33 95 aa6.3□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 FXYD5Q96DB9 178 aa6.3□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 TMEM208Q9BTX3 173 aa6.3□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 WFDC1Q9HC57 220 aa6.3□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.29□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 NBEAP1P0C6P0 100 aa6.29□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 TAS2R60P59551 318 aa6.29□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 ZNF266Q14584 549 aa6.29□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 KHDC3LQ587J8 217 aa6.29□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 FFAR4Q5NUL3 377 aa6.29□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 FAM222AQ5U5X8 452 aa6.29□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 LYPD1Q8N2G4 141 aa6.29□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.9 ms