RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, human

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C6orf48-208	ENST00000395788	LTA	P01374	205 aa		4.61	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	IGLV2-11	P01706	119 aa		4.61	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	GALR1	P47211	349 aa		4.61	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	TPPP2	P59282	170 aa		4.61	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	FOXE3	Q13461	319 aa		4.61	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		4.61	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		4.61	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		4.61	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		4.61	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	BLNK	Q8WV28	456 aa		4.61	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	FMC1	Q96HJ9	113 aa		4.61	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	LINC00479	Q96M42	142 aa		4.61	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		4.61	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		4.61	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788		V9GYV3	84 aa		4.61	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		4.6	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	PPP5D1	E7EU14	171 aa		4.6	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	SCGB1D1	O95968	90 aa		4.6	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	TRBV12-3	P01733	135 aa		4.6	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	ELANE	P08246	267 aa		4.6	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	ARL3	P36405	182 aa		4.6	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	MEOX2	P50222	304 aa		4.6	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	GNG5	P63218	68 aa		4.6	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	PSG9	Q00887	426 aa		4.6	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	BAGE2	Q86Y30	109 aa		4.6	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		4.6	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		4.6	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	GLMP	Q8WWB7	406 aa		4.6	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	BTF3L4	Q96K17	158 aa		4.6	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	FAM210B	Q96KR6	192 aa		4.6	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	OR5B12	Q96R08	314 aa		4.6	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	METTL26	Q96S19	204 aa		4.6	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		4.6	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	IL36B	Q9NZH7	164 aa		4.6	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	ZNF492	Q9P255	531 aa		4.6	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	MLX	Q9UH92	298 aa		4.6	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		4.6	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	AKAP9	Q99996	3911 aa		4.6	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	ITPR3	Q14573	2671 aa		4.59	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		4.59	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		4.59	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	ZNF785	A8K8V0	405 aa		4.59	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		4.59	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	DIRC3	C9JPN6	131 aa		4.59	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788		H3BTX0	84 aa		4.59	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788		K7EMT4	169 aa		4.59	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	S100P	P25815	95 aa		4.59	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	RAB5B	P61020	215 aa		4.59	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	OR5I1	Q13606	314 aa		4.59	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	SMUG1	Q53HV7	270 aa		4.59	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	CT83	Q5H943	113 aa		4.59	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		4.59	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		4.59	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788		Q86TA4	180 aa		4.59	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	GPHB5	Q86YW7	130 aa		4.59	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		4.59	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		4.59	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		4.59	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		4.59	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		4.59	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	BIN3	Q9NQY0	253 aa		4.59	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		4.59	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		4.59	□□□□□ -1.67
C6orf48-208	ENST00000395788	FBN3	Q75N90	2809 aa		4.59	□□□□□ -1.68
C6orf48-208	ENST00000395788	ZAN	Q9Y493	2812 aa		4.59	□□□□□ -1.68
C6orf48-208	ENST00000395788	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
C6orf48-208	ENST00000395788	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		4.58	□□□□□ -1.68
C6orf48-208	ENST00000395788	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		4.58	□□□□□ -1.68
C6orf48-208	ENST00000395788	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		4.58	□□□□□ -1.68
C6orf48-208	ENST00000395788	RBAKDN	A6NC62	111 aa		4.58	□□□□□ -1.68
C6orf48-208	ENST00000395788	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
C6orf48-208	ENST00000395788	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
C6orf48-208	ENST00000395788	ERVFC1-1	P60608	527 aa		4.58	□□□□□ -1.68
C6orf48-208	ENST00000395788	UBE2G1	P62253	170 aa		4.58	□□□□□ -1.68
C6orf48-208	ENST00000395788	SLC35B1	P78383	322 aa		4.58	□□□□□ -1.68
C6orf48-208	ENST00000395788	PSG3	Q16557	428 aa		4.58	□□□□□ -1.68
C6orf48-208	ENST00000395788	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
C6orf48-208	ENST00000395788	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		4.58	□□□□□ -1.68
C6orf48-208	ENST00000395788	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		4.58	□□□□□ -1.68
C6orf48-208	ENST00000395788	PET117	Q6UWS5	81 aa		4.58	□□□□□ -1.68
C6orf48-208	ENST00000395788	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		4.58	□□□□□ -1.68
C6orf48-208	ENST00000395788	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		4.58	□□□□□ -1.68
C6orf48-208	ENST00000395788	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		4.58	□□□□□ -1.68
C6orf48-208	ENST00000395788	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
C6orf48-208	ENST00000395788	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		4.58	□□□□□ -1.68
C6orf48-208	ENST00000395788	GNB4	Q9HAV0	340 aa		4.58	□□□□□ -1.68
C6orf48-208	ENST00000395788	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		4.58	□□□□□ -1.68
C6orf48-208	ENST00000395788	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		4.57	□□□□□ -1.68
C6orf48-208	ENST00000395788	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		4.57	□□□□□ -1.68
C6orf48-208	ENST00000395788	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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