RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1-202ENST00000380828 PIP4P2Q8N4L2 257 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1-202ENST00000380828 FXYD5Q96DB9 178 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1-202ENST00000380828 LIME1Q9H400 295 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1-202ENST00000380828 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1-202ENST00000380828 IL36BQ9NZH7 164 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1-202ENST00000380828 SHANK1Q9Y566 2161 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1-202ENST00000380828 MUC3AQ02505 3323 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1-202ENST00000380828 HBG1P69891 147 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1-202ENST00000380828 TREML4Q6UXN2 200 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1-202ENST00000380828 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A0A0MQY5 61 aa5.34□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 TIMM23O14925 209 aa5.34□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 VSIG8P0DPA2 414 aa5.34□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF542PQ5EBM4 170 aa5.34□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 Q6ZRU5 148 aa5.34□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 AICDAQ9GZX7 198 aa5.34□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 APC2O95996 2303 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF134P52741 427 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 QRFPP83859 136 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 LINC01545Q5VT33 79 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 MIC13Q5XKP0 118 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 C6orf223Q8N319 242 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 PLCE1Q9P212 2302 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 EPM2AB3EWF7 344 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 H3BT86 120 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 M0R1B8 84 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 SYNGR2O43760 224 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 IGLV3-19P01714 112 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 DYNLT3P51808 116 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 MARCH3Q86UD3 253 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 C11orf53Q8IXP5 236 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 OR52N5Q8NH56 324 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 PLAC8L1A1L4L8 177 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 PSMB8P28062 276 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF117Q03924 483 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 CST6Q15828 149 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 SFTPA2Q8IWL1 248 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 SFTPA1Q8IWL2 248 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 Q8N1Y9 231 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 UPK3BQ9BT76 320 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 C11orf1Q9H5F2 150 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 TRAV17A0A0B4J275 112 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 USP17L23D6RBM5 183 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 SFTPDP35247 375 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 GNB1P62873 340 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 SBSPONQ8IVN8 264 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 FOXB1Q99853 325 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF286AQ9HBT8 521 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 NCOR1O75376 2440 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 LINC01559Q495D7 138 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 ABCA11PQ4W5N1 156 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF793Q6ZN11 406 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 CHAC1Q9BUX1 264 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 NBEAQ8NFP9 2946 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 C5orf49A4QMS7 147 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 C4orf51C9J302 202 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 GFRA3O60609 400 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 MSMPQ1L6U9 139 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 IGFL3Q6UXB1 125 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 ARL17AQ8IVW1 177 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM252Q8N6L7 170 aa5.31□□□□□ -1.56
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RABGEF1-202ENST00000380828 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 KNCNA6PVL3 124 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 PQLC2Q6ZP29 291 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 SEM1Q6ZVN7 128 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
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RABGEF1-202ENST00000380828 IGHG1P01857 330 aa5.31□□□□□ -1.56
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RABGEF1-202ENST00000380828 C6orf201Q7Z4U5 140 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 PDCD6O75340 191 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 IGKV1D-33P01593 117 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 IGKV1-33P01594 117 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 DEFA4P12838 97 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 CD24P25063 80 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 ORMDL2Q53FV1 153 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 C1orf100Q5SVJ3 147 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 MYO7BQ6PIF6 2116 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa5.3□□□□□ -1.56
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