RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368358.3

HCN3-201, Transcript of hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCN3, Length 3,718 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3-201ENST00000368358 RPL7P18124 248 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 TTC9CQ8N5M4 171 aa10.4□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 NUP35Q8NFH5 326 aa10.4□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 WDR73Q6P4I2 378 aa10.39□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 RNF182Q8N6D2 247 aa10.39□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa10.39□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 MXRA5Q9NR99 2828 aa10.39□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 TRBV19A0A075B6N1 114 aa10.39□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 CTSGP08311 255 aa10.39□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 RELQ04864 619 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 TOMM20LQ6UXN7 152 aa10.39□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 AJUBAQ96IF1 538 aa10.39□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 CLEC5AQ9NY25 188 aa10.39□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 PSG8Q9UQ74 426 aa10.39□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 FMC1Q96HJ9 113 aa10.38□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 TRBV12-3P01733 135 aa10.38□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 ORM1P02763 201 aa10.38□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 EBI3Q14213 229 aa10.38□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 PIFOQ8TCI5 191 aa10.38□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 M0QZK8 103 aa10.38□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 GRAMD2BQ96HH9 432 aa10.38□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 METTL26Q96S19 204 aa10.38□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa10.38□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 LY96Q9Y6Y9 160 aa10.38□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 C2CD3Q4AC94 2353 aa10.37□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 HSBP1O75506 76 aa10.37□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 OR4X2Q8NGF9 303 aa10.37□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 BORCS7Q96B45 105 aa10.37□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 RNF24Q9Y225 148 aa10.37□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 IZUMO1RA6ND01 250 aa10.37□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 TSTD3H0UI37 97 aa10.37□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 H3BRN7 92 aa10.37□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 TYMSP04818 313 aa10.37□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 C8orf49Q96NF6 230 aa10.37□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 PRSS22Q9GZN4 317 aa10.37□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 FAM181BA6NEQ2 426 aa10.36□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 VN1R17PQ8TDU5 208 aa10.36□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 DUX3Q96PT4 197 aa10.36□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 J3QLI3 93 aa10.36□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 M0QZ24 198 aa10.36□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 Q86TA4 180 aa10.36□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 HLA-DQA1P01909 254 aa10.36□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 SLAQ13239 276 aa10.36□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 A6NDX4 124 aa10.35□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 PPIFP30405 207 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 ERCC8Q13216 396 aa10.35□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 TSKUQ8WUA8 353 aa10.35□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 ZNF414Q96IQ9 312 aa10.35□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 MEGF9Q9H1U4 602 aa10.35□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 NAGKQ9UJ70 344 aa10.35□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 DEFA6Q01524 100 aa10.35□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 DPF1Q92782 380 aa10.35□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 VPREB3Q9UKI3 123 aa10.35□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa10.35□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 ATRQ13535 2644 aa10.35□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 PLP1P60201 277 aa10.34□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 DEFB136Q30KP8 78 aa10.34□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa10.34□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 C16orf92Q96LL3 132 aa10.34□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 APOHP02749 345 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 TMEM136Q6ZRR5 245 aa10.34□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 GNB1LQ9BYB4 327 aa10.34□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 MT-ND6P03923 174 aa10.34□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa10.34□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 NDFIP1Q9BT67 221 aa10.34□□□□□ -0.75
HCN3-201ENST00000368358 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
HCN3-201ENST00000368358 PMCHL1Q16048 86 aa10.33□□□□□ -0.76
HCN3-201ENST00000368358 TMEM189A5PLL7 270 aa10.33□□□□□ -0.76
HCN3-201ENST00000368358 RAB9AP51151 201 aa10.33□□□□□ -0.76
HCN3-201ENST00000368358 ATOH7Q8N100 152 aa10.33□□□□□ -0.76
HCN3-201ENST00000368358 GLMPQ8WWB7 406 aa10.33□□□□□ -0.76
HCN3-201ENST00000368358 VGLL1Q99990 258 aa10.33□□□□□ -0.76
HCN3-201ENST00000368358 PAM16Q9Y3D7 125 aa10.33□□□□□ -0.76
HCN3-201ENST00000368358 DIRC3C9JPN6 131 aa10.33□□□□□ -0.76
HCN3-201ENST00000368358 S100A7P31151 101 aa10.33□□□□□ -0.76
HCN3-201ENST00000368358 ZNF138P52744 262 aa10.33□□□□□ -0.76
HCN3-201ENST00000368358 HBBP68871 147 aa10.33□□□□□ -0.76
HCN3-201ENST00000368358 PSG9Q00887 426 aa10.33□□□□□ -0.76
HCN3-201ENST00000368358 WFDC12Q8WWY7 111 aa10.33□□□□□ -0.76
HCN3-201ENST00000368358 CCDC140Q96MF4 163 aa10.33□□□□□ -0.76
HCN3-201ENST00000368358 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
HCN3-201ENST00000368358 RCHY1Q96PM5 261 aa10.33□□□□□ -0.76
HCN3-201ENST00000368358 A0A0G2JLM5 398 aa10.32□□□□□ -0.76
HCN3-201ENST00000368358 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa10.32□□□□□ -0.76
HCN3-201ENST00000368358 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa10.32□□□□□ -0.76
HCN3-201ENST00000368358 PSG3Q16557 428 aa10.32□□□□□ -0.76
HCN3-201ENST00000368358 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa10.32□□□□□ -0.76
HCN3-201ENST00000368358 TMEM75Q8N9X5 138 aa10.32□□□□□ -0.76
HCN3-201ENST00000368358 ZNF502Q8TBZ5 544 aa10.32□□□□□ -0.76
HCN3-201ENST00000368358 IGKV3-20P01619 116 aa10.32□□□□□ -0.76
HCN3-201ENST00000368358 TMEM14CQ9P0S9 112 aa10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54 ms