RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 STRCP1A6NGW2 1772 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 KLLNB2CW77 178 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 ATOX1O00244 68 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 LST1O00453 97 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 PSPHP1O15172 72 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 OR1I1O60431 355 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 CDK2AP2O75956 126 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 TCL1BO95988 128 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 TRBV12-3P01733 135 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 IGKCP01834 107 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 IGLL1P15814 213 aa2.32□□□□□ -2.04
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PTPRM-204ENST00000577468 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 GNB2P62879 340 aa2.32□□□□□ -2.04
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PTPRM-204ENST00000577468 ORMDL2Q53FV1 153 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 LGALS9CQ6DKI2 356 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa2.32□□□□□ -2.04
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PTPRM-204ENST00000577468 STAG3L4Q8TBR4 150 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF721Q8TF20 911 aa2.32□□□□□ -2.04
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PTPRM-204ENST00000577468 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 FAM3DQ96BQ1 224 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 DSCR8Q96T75 97 aa2.32□□□□□ -2.04
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PTPRM-204ENST00000577468 SELENOKQ9Y6D0 94 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 V9GY05 133 aa2.32□□□□□ -2.04
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PTPRM-204ENST00000577468 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 BTAF1O14981 1849 aa2.31□□□□□ -2.04
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PTPRM-204ENST00000577468 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa2.31□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 A8MUN3 132 aa2.31□□□□□ -2.04
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PTPRM-204ENST00000577468 E9PLD3 99 aa2.31□□□□□ -2.04
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PTPRM-204ENST00000577468 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 ADIGQ0VDE8 80 aa2.31□□□□□ -2.04
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PTPRM-204ENST00000577468 C6orf99Q4VX62 202 aa2.31□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 WDR38Q5JTN6 314 aa2.31□□□□□ -2.04
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PTPRM-204ENST00000577468 FAM219BQ5XKK7 198 aa2.31□□□□□ -2.04
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PTPRM-204ENST00000577468 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 SBSPONQ8IVN8 264 aa2.31□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM256Q8N2U0 113 aa2.31□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa2.31□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa2.31□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 OR8B3Q8NGG8 313 aa2.31□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 C10orf105Q8TEF2 133 aa2.31□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP2.31□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 RNF185Q96GF1 192 aa2.31□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 ABHD14BQ96IU4 210 aa2.31□□□□□ -2.04
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PTPRM-204ENST00000577468 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 CHAC1Q9BUX1 264 aa2.31□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 SCRT2Q9NQ03 307 aa2.31□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa2.31□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 PAPPAQ13219 1627 aa2.31□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 DYSFO75923 2080 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 TRAV2A0A0B4J234 112 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 A0A0D9SEW6 157 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 EPOPA6NHQ4 379 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 K7EM74 188 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 HBDP02042 147 aa2.3□□□□□ -2.04
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