RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565362.5

PDXDC1-211, Transcript of pyridoxal dependent decarboxylase domain containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene PDXDC1, Length 720 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDXDC1-211ENST00000565362 GGACTQ9BVM4 153 aa7.58□□□□□ -1.2
PDXDC1-211ENST00000565362 ARL6Q9H0F7 186 aa7.58□□□□□ -1.2
PDXDC1-211ENST00000565362 ARV1Q9H2C2 271 aa7.58□□□□□ -1.2
PDXDC1-211ENST00000565362 RNF24Q9Y225 148 aa7.58□□□□□ -1.2
PDXDC1-211ENST00000565362 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
PDXDC1-211ENST00000565362 ABCA13Q86UQ4 5058 aa7.58□□□□□ -1.2
PDXDC1-211ENST00000565362 C7orf66A4D0T2 115 aa7.57□□□□□ -1.2
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PDXDC1-211ENST00000565362 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
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PDXDC1-211ENST00000565362 C15orf53Q8NAA6 179 aa7.57□□□□□ -1.2
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PDXDC1-211ENST00000565362 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
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PDXDC1-211ENST00000565362 TMEM256Q8N2U0 113 aa7.56□□□□□ -1.2
PDXDC1-211ENST00000565362 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
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PDXDC1-211ENST00000565362 TAS2R60P59551 318 aa7.55□□□□□ -1.2
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PDXDC1-211ENST00000565362 LINC00305Q7Z4B0 112 aa7.55□□□□□ -1.2
PDXDC1-211ENST00000565362 LRRC20Q8TCA0 184 aa7.55□□□□□ -1.2
PDXDC1-211ENST00000565362 TMEM37Q8WXS4 190 aa7.55□□□□□ -1.2
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PDXDC1-211ENST00000565362 DEFB130AP0DP74 79 aa7.54□□□□□ -1.2
PDXDC1-211ENST00000565362 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa7.54□□□□□ -1.2
PDXDC1-211ENST00000565362 MGST2Q99735 147 aa7.54□□□□□ -1.2
PDXDC1-211ENST00000565362 C20orf144Q9BQM9 153 aa7.54□□□□□ -1.2
PDXDC1-211ENST00000565362 C20orf85Q9H1P6 137 aa7.54□□□□□ -1.2
PDXDC1-211ENST00000565362 C11orf1Q9H5F2 150 aa7.54□□□□□ -1.2
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PDXDC1-211ENST00000565362 FCN2Q15485 313 aa7.53□□□□□ -1.2
PDXDC1-211ENST00000565362 MORN5Q5VZ52 161 aa7.53□□□□□ -1.2
PDXDC1-211ENST00000565362 ZNF493Q6ZR52 646 aa7.53□□□□□ -1.2
PDXDC1-211ENST00000565362 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
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PDXDC1-211ENST00000565362 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa7.53□□□□□ -1.2
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PDXDC1-211ENST00000565362 F5H768 121 aa7.52□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 H7BYZ3 331 aa7.52□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 L7N2F9 121 aa7.52□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 SLC17A3O00476 420 aa7.52□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 CCSO14618 274 aa7.52□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 COX7A2P2O60397 106 aa7.52□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 TCRBP04435 133 aa7.52□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 CAMLGP49069 296 aa7.52□□□□□ -1.21
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PDXDC1-211ENST00000565362 ZNF846Q147U1 533 aa7.52□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 KIR3DS1Q14943 382 aa7.52□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 VWC2Q2TAL6 325 aa7.52□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 SOHLH1Q5JUK2 328 aa7.52□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 C1orf134Q5TEV5 83 aa7.52□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 C10orf113Q5VZT2 155 aa7.52□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 LINC00612Q8N6U2 182 aa7.52□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa7.52□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 WDR83OSQ9Y284 106 aa7.52□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 FAM24AA6NFZ4 105 aa7.51□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 H3BQ15 152 aa7.51□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 IL15RAQ13261 267 aa7.51□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 RAB31Q13636 194 aa7.51□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 Q6ZRG5 221 aa7.51□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 NRARPQ7Z6K4 114 aa7.51□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 ZNRF2Q8NHG8 242 aa7.51□□□□□ -1.21
PDXDC1-211ENST00000565362 CHAC2Q8WUX2 184 aa7.51□□□□□ -1.21
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