RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555562.1

FOXN3-AS1-201, FOXN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN3-AS1, Length 1,077 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa14.04□□□□□ -0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PATE2Q6UY27 113 aa14.04□□□□□ -0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 Q6ZRG5 221 aa14.04□□□□□ -0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 THAP6Q8TBB0 222 aa14.04□□□□□ -0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP14.03□□□□□ -0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRAV10A0A0B4J240 114 aa14.03□□□□□ -0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RPL29P47914 159 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EBLN2Q6P2I7 272 aa14.03□□□□□ -0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 Q6ZNX1 250 aa14.03□□□□□ -0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SCRT1Q9BWW7 348 aa14.03□□□□□ -0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RPRMQ9NS64 109 aa14.03□□□□□ -0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 X6R8D5 127 aa14.03□□□□□ -0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAT2Q9NYQ8 4349 aa14.03□□□□□ -0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C4BPBP20851 252 aa14.02□□□□□ -0.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FOXI2Q6ZQN5 318 aa14.02□□□□□ -0.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa14.02□□□□□ -0.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR1L4Q8NGR5 311 aa14.02□□□□□ -0.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR2T35Q8NGX2 323 aa14.02□□□□□ -0.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AQP10Q96PS8 301 aa14.02□□□□□ -0.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ARV1Q9H2C2 271 aa14.02□□□□□ -0.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PCLOQ9Y6V0 5065 aa14.02□□□□□ -0.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AGRNO00468 2067 aa14.02□□□□□ -0.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HLA-DRB4P13762 266 aa14.01□□□□□ -0.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FGF7P21781 194 aa14.01□□□□□ -0.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CLINT1Q14677 625 aa14.01□□□□□ -0.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 Q6ZTC4 211 aa14.01□□□□□ -0.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LRRC20Q8TCA0 184 aa14.01□□□□□ -0.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM37Q8WXS4 190 aa14.01□□□□□ -0.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C17orf77Q96MU5 243 aa14.01□□□□□ -0.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PFDN5Q99471 154 aa14.01□□□□□ -0.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ATP5SQ99766 215 aa14.01□□□□□ -0.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NPCDR1Q9BY65 106 aa14.01□□□□□ -0.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP14.01□□□□□ -0.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa14.01□□□□□ -0.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 H3BMM0 161 aa14□□□□□ -0.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C10orf113Q5VZT2 155 aa14□□□□□ -0.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MIC13Q5XKP0 118 aa14□□□□□ -0.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UHRF2Q96PU4 802 aa14□□□□□ -0.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 WFDC1Q9HC57 220 aa14□□□□□ -0.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CLEC5AQ9NY25 188 aa14□□□□□ -0.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa13.99□□□□□ -0.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SOCS3O14543 225 aa13.99□□□□□ -0.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LINC00305Q7Z4B0 112 aa13.99□□□□□ -0.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa13.99□□□□□ -0.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KCNIP2Q9NS61 270 aa13.99□□□□□ -0.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC39A9Q9NUM3 307 aa13.99□□□□□ -0.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TNFSF18Q9UNG2 199 aa13.99□□□□□ -0.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RNF222A6NCQ9 220 aa13.98□□□□□ -0.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa13.98□□□□□ -0.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LINC00336Q6ZUF6 198 aa13.98□□□□□ -0.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa13.98□□□□□ -0.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR4B1Q8NGF8 309 aa13.98□□□□□ -0.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PXMP4Q9Y6I8 212 aa13.98□□□□□ -0.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 B2MP61769 119 aa13.97□□□□□ -0.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF709Q8N972 641 aa13.97□□□□□ -0.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CLUHP3Q96NS8 147 aa13.97□□□□□ -0.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SMIM3Q9BZL3 60 aa13.97□□□□□ -0.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 A0A087X0K7 114 aa13.96□□□□□ -0.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CXCL2P19875 107 aa13.96□□□□□ -0.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C12orf74Q32Q52 190 aa13.96□□□□□ -0.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MORN5Q5VZ52 161 aa13.96□□□□□ -0.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF738Q8NE65 137 aa13.96□□□□□ -0.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PKHD1P08F94 4074 aa13.95□□□□□ -0.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa13.95□□□□□ -0.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IGKV3-20P01619 116 aa13.95□□□□□ -0.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LCN15Q6UWW0 184 aa13.95□□□□□ -0.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 XCL2Q9UBD3 114 aa13.95□□□□□ -0.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa13.94□□□□□ -0.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AMBPP02760 352 aa13.94□□□□□ -0.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PSG9Q00887 426 aa13.94□□□□□ -0.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC50A1Q9BRV3 221 aa13.94□□□□□ -0.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CELA1Q9UNI1 258 aa13.94□□□□□ -0.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RYR1P21817 5038 aa13.94□□□□□ -0.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 A0A0J9YX75 114 aa13.93□□□□□ -0.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C17orf112F2Z3M2 114 aa13.93□□□□□ -0.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SMLR1H3BR10 107 aa13.93□□□□□ -0.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IFNA5P01569 189 aa13.93□□□□□ -0.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 P0DMU3 169 aa13.93□□□□□ -0.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM231AP0DMU4 169 aa13.93□□□□□ -0.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM231CP0DMU5 169 aa13.93□□□□□ -0.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GCSAMLQ5JQS6 135 aa13.93□□□□□ -0.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GDF5OSQ5U4N7 250 aa13.93□□□□□ -0.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM78BQ5VT40 261 aa13.93□□□□□ -0.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 POM121L12Q8N7R1 296 aa13.93□□□□□ -0.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GUK1Q16774 197 aa13.92□□□□□ -0.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF767PQ75MW2 155 aa13.92□□□□□ -0.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP13.92□□□□□ -0.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR11H4Q8NGC9 324 aa13.92□□□□□ -0.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SCGB1C1Q8TD33 95 aa13.92□□□□□ -0.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ST6GAL2Q96JF0 529 aa13.92□□□□□ -0.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C20orf173Q96LM9 149 aa13.92□□□□□ -0.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NDUFAF3Q9BU61 184 aa13.92□□□□□ -0.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa13.92□□□□□ -0.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa13.92□□□□□ -0.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF266Q14584 549 aa13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.6 ms