RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544361.1

QKI-213, Transcript of QKI, KH domain containing RNA binding, human

TSL 5

Gene QKI, Length 613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
QKI-213	ENST00000544361	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		2.75	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	PSG7	Q13046	419 aa		2.75	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	CATR1	Q13166	79 aa		2.75	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	EDDM3A	Q14507	147 aa		2.75	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	KISS1	Q15726	138 aa		2.75	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	IGFBP7	Q16270	282 aa		2.75	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		2.75	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361		Q56UQ5	140 aa		2.75	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	ASCL4	Q6XD76	172 aa		2.75	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		2.75	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	SSX8	Q7RTT4	187 aa		2.75	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		2.75	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		2.75	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	ZNF525	Q8N782	197 aa		2.75	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	OR10AC1	Q8NH08	325 aa		2.75	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	OR10G6	Q8NH81	332 aa		2.75	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		2.75	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	C8orf44	Q96CB5	159 aa		2.75	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	COX14	Q96I36	57 aa		2.75	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		2.75	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		2.75	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	IMUP	Q9GZP8	106 aa		2.75	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	HES4	Q9HCC6	221 aa		2.75	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	SH2D2A	Q9NP31	389 aa		2.75	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	TAC3	Q9UHF0	121 aa		2.75	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	PSG8	Q9UQ74	426 aa		2.75	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		2.75	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	ALPK3	Q96L96	1907 aa		2.75	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		2.74	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361		A0A1B0GX51	115 aa		2.74	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361		A0A1W2PQD3	144 aa		2.74	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361		A0A1W2PRE2	83 aa		2.74	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		2.74	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		2.74	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		2.74	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361		K7ENP7	123 aa		2.74	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361		K7EQS6	105 aa		2.74	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	ACYP1	P07311	99 aa		2.74	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	GABRG2	P18507	467 aa		2.74	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	PLGLB1	Q02325	96 aa		2.74	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	RPL18	Q07020	188 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	UNC119	Q13432	240 aa		2.74	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	CEACAM16	Q2WEN9	425 aa		2.74	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		2.74	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	ZNF658B	Q4V348	819 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	NMS	Q5H8A3	153 aa		2.74	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361		Q6AWC8	147 aa		2.74	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		2.74	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	TCF23	Q7RTU1	214 aa		2.74	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		2.74	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	OOSP2	Q86WS3	158 aa		2.74	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	MKX	Q8IYA7	352 aa		2.74	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	CA13	Q8N1Q1	262 aa		2.74	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	OSR2	Q8N2R0	312 aa		2.74	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	OR8B12	Q8NGG6	310 aa		2.74	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		2.74	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	RDH5	Q92781	318 aa		2.74	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	KLK6	Q92876	244 aa		2.74	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	CLDN23	Q96B33	292 aa		2.74	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	BORCS8	Q96FH0	119 aa		2.74	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	OR4C12	Q96R67	309 aa		2.74	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	WFDC6	Q9BQY6	131 aa		2.74	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		2.74	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		2.74	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		2.74	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		2.74	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	NXT1	Q9UKK6	140 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	PHF3	Q92576	2039 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	BRCA2	P51587	3418 aa		2.74	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	PLXNA2	O75051	1894 aa		2.73	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	LRRK1	Q38SD2	2015 aa		2.73	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		2.73	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361		A0A1W2PRD5	423 aa		2.73	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361		A0A1W2PRF3	423 aa		2.73	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361		A0A1W2PRM7	423 aa		2.73	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	C2orf70	A6NJV1	201 aa		2.73	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	LINC01619	G3V211	115 aa		2.73	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361		J3KT08	172 aa		2.73	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	CCL21	O00585	134 aa		2.73	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	PDCD6	O75340	191 aa		2.73	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	MOS	P00540	346 aa		2.73	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	IL4	P05112	153 aa		2.73	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	ZNF688	P0C7X2	276 aa		2.73	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	CBLN1	P23435	193 aa		2.73	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	2.73	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	EMP1	P54849	157 aa		2.73	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	UCN	P55089	124 aa		2.73	□□□□□ -1.97
QKI-213	ENST00000544361	FBXW4	P57775	412 aa		2.73	□□□□□ -1.97

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