RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 C17orf77Q96MU5 243 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 RABAC1Q9UI14 185 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 IGF1P05019 195 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 CLEC3BP05452 202 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 S100A7P31151 101 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 GFI1BQ5VTD9 330 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 CMTM2Q8TAZ6 248 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 SGK494Q96LW2 274 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 ATP6V0BQ99437 205 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 M0QZK8 103 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 BMPR1BO00238 502 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 IGHG2P01859 326 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 RPL7P18124 248 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 RPL19P84098 196 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 LY6EQ16553 131 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 Q86TA4 180 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM183AQ8IXX5 376 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 NUDT11Q96G61 164 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 GPR61Q9BZJ8 451 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 SERTAD4Q9NUC0 356 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 FAM223BA6NKX1 122 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 J3QLI3 93 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 GATCO43716 136 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 IGLV2-11P01706 119 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 TOMM20LQ6UXN7 152 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 FAM223AQ8IWN6 122 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 MS4A10Q96PG2 267 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF492Q9P255 531 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 XKRY2A2RUG3 117 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 BRI3O95415 125 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 COX19Q49B96 90 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 C9orf152Q5JTZ5 239 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 PRR27Q6MZM9 219 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 CLEC19AQ6UXS0 136 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM75Q8N9X5 138 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 GRAMD2BQ96HH9 432 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 GNB1LQ9BYB4 327 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 HIVEP2P31629 2446 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 C19orf71A6NCJ1 209 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 IZUMO1RA6ND01 250 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 K7EQM0 130 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 CA1P00915 261 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 CBLN1P23435 193 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 S100A2P29034 98 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 IER3P46695 156 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 RAB9AP51151 201 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 PSG9Q00887 426 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 ATP5G2Q06055 141 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 PRSS22Q9GZN4 317 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 AAMDCQ9H7C9 122 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 LINC00527Q9UJ94 153 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 SNURFLB1AK76 121 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 DIRC3C9JPN6 131 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 H3BUA1 57 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF253O75346 499 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 MT-ND6P03923 174 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 PPIFP30405 207 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 TCL1AP56279 114 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 PDZD11Q5EBL8 140 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 WDR73Q6P4I2 378 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 CLPSL1A2RUU4 121 aa6.34□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 BUB3O43684 328 aa6.34□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 RELQ04864 619 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 PSG3Q16557 428 aa6.34□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 CT83Q5H943 113 aa6.34□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 TSKUQ8WUA8 353 aa6.34□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 GNB4Q9HAV0 340 aa6.34□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 NAT8BQ9UHF3 227 aa6.34□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 ZFP30Q9Y2G7 519 aa6.34□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa6.34□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 A0A087X0K7 114 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 NPIPB6E9PJ23 425 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 M0R3E3 92 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 TGFAP01135 160 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 TRGV3P03979 118 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 BLCAPP62952 87 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 RASL11AQ6T310 242 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM136Q6ZRR5 245 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 PRNTQ86SH4 94 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 NUP35Q8NFH5 326 aa6.33□□□□□ -1.4
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