RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492485.5

TRIOBP-211, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TRIOBP, Length 3,948 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-211ENST00000492485 C8orf49Q96NF6 230 aa9.98□□□□□ -0.81
TRIOBP-211ENST00000492485 C11orf1Q9H5F2 150 aa9.98□□□□□ -0.81
TRIOBP-211ENST00000492485 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa9.98□□□□□ -0.81
TRIOBP-211ENST00000492485 C15orf65H3BRN8 121 aa9.98□□□□□ -0.81
TRIOBP-211ENST00000492485 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
TRIOBP-211ENST00000492485 TMEM219Q86XT9 240 aa9.98□□□□□ -0.81
TRIOBP-211ENST00000492485 ERCC8Q13216 396 aa9.97□□□□□ -0.81
TRIOBP-211ENST00000492485 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF329Q86UD4 541 aa9.97□□□□□ -0.81
TRIOBP-211ENST00000492485 CST9LQ9H4G1 147 aa9.97□□□□□ -0.81
TRIOBP-211ENST00000492485 C19orf67A6NJJ6 358 aa9.97□□□□□ -0.81
TRIOBP-211ENST00000492485 H0YJW9 148 aa9.97□□□□□ -0.81
TRIOBP-211ENST00000492485 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
TRIOBP-211ENST00000492485 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
TRIOBP-211ENST00000492485 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
TRIOBP-211ENST00000492485 RNF182Q8N6D2 247 aa9.97□□□□□ -0.81
TRIOBP-211ENST00000492485 PYGO2Q9BRQ0 406 aa9.97□□□□□ -0.81
TRIOBP-211ENST00000492485 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
TRIOBP-211ENST00000492485 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa9.97□□□□□ -0.81
TRIOBP-211ENST00000492485 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
TRIOBP-211ENST00000492485 TMEM170BQ5T4T1 132 aa9.97□□□□□ -0.81
TRIOBP-211ENST00000492485 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa9.97□□□□□ -0.81
TRIOBP-211ENST00000492485 CACNG8Q8WXS5 425 aa9.97□□□□□ -0.81
TRIOBP-211ENST00000492485 IFI27L1Q96BM0 104 aa9.97□□□□□ -0.81
TRIOBP-211ENST00000492485 LINC00312Q9Y6C7 94 aa9.97□□□□□ -0.81
TRIOBP-211ENST00000492485 ZZEF1O43149 2961 aa9.96□□□□□ -0.81
TRIOBP-211ENST00000492485 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
TRIOBP-211ENST00000492485 C17orf58Q2M2W7 97 aa9.96□□□□□ -0.81
TRIOBP-211ENST00000492485 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa9.96□□□□□ -0.81
TRIOBP-211ENST00000492485 GAFA1Q96PS6 74 aa9.96□□□□□ -0.81
TRIOBP-211ENST00000492485 COL12A1Q99715 3063 aa9.96□□□□□ -0.81
TRIOBP-211ENST00000492485 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa9.96□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa9.96□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 K7EM74 188 aa9.96□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 CEACAM3P40198 252 aa9.96□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 MFAP4P55083 255 aa9.96□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 TEX43Q6ZNM6 134 aa9.96□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 MDS2Q8NDY4 140 aa9.96□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 YPEL4Q96NS1 127 aa9.96□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa9.96□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 SLC25A15Q9Y619 301 aa9.96□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 KMT2EQ8IZD2 1858 aa9.96□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 CYSLTR1Q9Y271 337 aa9.96□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 A0A0G2JLM5 398 aa9.95□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 K7EP13 123 aa9.95□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 SMIM13P0DJ93 91 aa9.95□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 TDGF1P13385 188 aa9.95□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 KIR3DS1Q14943 382 aa9.95□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 SLC25A2Q9BXI2 301 aa9.95□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 C21orf62Q9NYP8 219 aa9.95□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa9.95□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa9.95□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 KIR2DL5AQ8N109 375 aa9.95□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 TMEM14BQ9NUH8 114 aa9.95□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 NPC2P61916 151 aa9.95□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 PSG3Q16557 428 aa9.95□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP9.95□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa9.95□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa9.94□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 Q0VG73 95 aa9.94□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 OCIAD2Q56VL3 154 aa9.94□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa9.94□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 C19orf24Q9BVV8 132 aa9.94□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 PCP2Q8IVA1 136 aa9.94□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 ORAOV1Q8WV07 137 aa9.94□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 DLX6P56179 175 aa9.93□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 NEGR1Q7Z3B1 354 aa9.93□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 OR11H12B2RN74 326 aa9.93□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 ETDBQ3ZM63 59 aa9.93□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa9.93□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 OR11H1Q8NG94 326 aa9.93□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 OR11H2Q8NH07 326 aa9.93□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 RAB1BQ9H0U4 201 aa9.93□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 MSRB1Q9NZV6 116 aa9.93□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 LINC00477Q96M19 166 aa9.92□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 PDLIM4P50479 330 aa9.92□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 FMC1Q96HJ9 113 aa9.92□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 DKK2Q9UBU2 259 aa9.92□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 PRR20EP86478 221 aa9.92□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 PRR20CP86479 221 aa9.92□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 PRR20DP86480 221 aa9.92□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 PRR20BP86481 221 aa9.92□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 PRR20AP86496 221 aa9.92□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 C22orf34Q6ZV56 151 aa9.92□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 PSMB11A5LHX3 300 aa9.91□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 HBDP02042 147 aa9.91□□□□□ -0.82
TRIOBP-211ENST00000492485 FAM106CPP0CH98 169 aa9.91□□□□□ -0.82
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